67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_20390 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_20390  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  100 
 
 
274 aa  553  1e-156  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.173262  normal  0.119903 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30900  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  86.35 
 
 
354 aa  485  1e-136  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.796008  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0778  Luciferase-like monooxygenase  58.33 
 
 
355 aa  311  1e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1492  Luciferase-like, subgroup  58.87 
 
 
345 aa  285  7e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0448  Luciferase-like protein  56.32 
 
 
340 aa  281  1e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3232  Luciferase-like monooxygenase  55.6 
 
 
344 aa  277  1e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3005  luciferase family protein  55.17 
 
 
338 aa  269  4e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0326  luciferase family protein  53.26 
 
 
344 aa  268  8e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3758  luciferase family protein  56.06 
 
 
361 aa  262  4e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2051  luciferase family protein  52.29 
 
 
340 aa  261  6.999999999999999e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1973  luciferase family protein  52.29 
 
 
340 aa  261  1e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123864  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2168  Luciferase-like monooxygenase  52.67 
 
 
338 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319006  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3446  luciferase family protein  54.58 
 
 
341 aa  258  8e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.922588  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0327  luciferase-like  51.52 
 
 
344 aa  257  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1598  Luciferase-like, subgroup  52.87 
 
 
338 aa  257  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399762  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2676  Luciferase-like monooxygenase  52.29 
 
 
340 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0559319  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03180  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  56.37 
 
 
340 aa  257  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2848  Luciferase-like monooxygenase  51.53 
 
 
341 aa  256  4e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1423  luciferase-like protein  51.53 
 
 
341 aa  255  6e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0868  luciferase family protein  50.76 
 
 
340 aa  251  7e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3561  Luciferase-like monooxygenase  51.91 
 
 
340 aa  251  9.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.197544  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2931  luciferase family protein  53.82 
 
 
348 aa  250  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3121  luciferase family protein  51.53 
 
 
340 aa  249  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2353  Luciferase-like monooxygenase  52.09 
 
 
340 aa  248  9e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0651216  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0500  Luciferase-like monooxygenase  50 
 
 
340 aa  246  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.715375  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4485  luciferase-like  50.38 
 
 
340 aa  246  3e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6664  Luciferase-like monooxygenase  49.24 
 
 
340 aa  246  4e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3196  luciferase family protein  49.62 
 
 
340 aa  243  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.845193  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2850  Luciferase-like monooxygenase  51.34 
 
 
341 aa  242  6e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000200599  normal  0.039851 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06130  hypothetical protein  43.46 
 
 
258 aa  170  3e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7327  flavin-dependent oxidoreductase  32.46 
 
 
372 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0398  putative luciferase-like monooxygenase  29.79 
 
 
346 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3764  luciferase family protein  32.51 
 
 
381 aa  108  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.269499  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5180  monooxygenase  31.77 
 
 
361 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5567  Luciferase-like monooxygenase  30.29 
 
 
344 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638626  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5208  monooxygenase  29.35 
 
 
359 aa  102  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0275727  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2543  Luciferase-like monooxygenase  33.21 
 
 
350 aa  95.9  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264716 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4358  luciferase family protein  28.24 
 
 
342 aa  94.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608083  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17000  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.73 
 
 
365 aa  91.3  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0548834  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2792  luciferase-like protein  29.41 
 
 
338 aa  85.9  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0367162  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3415  luciferase family protein  29.5 
 
 
337 aa  85.1  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.462422  normal  0.0975768 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4330  Luciferase-like monooxygenase  29.41 
 
 
341 aa  84  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.619439  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2397  Luciferase-like monooxygenase  29.35 
 
 
341 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2323  Luciferase-like, subgroup  28.25 
 
 
338 aa  82  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708828  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  31.67 
 
 
346 aa  81.6  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  32.06 
 
 
344 aa  80.5  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  30.48 
 
 
345 aa  78.2  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7208  monooxygenase  29.23 
 
 
341 aa  77.4  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.841094  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  28.86 
 
 
376 aa  74.7  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  31.54 
 
 
344 aa  75.1  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  28.57 
 
 
341 aa  71.2  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  30.04 
 
 
347 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  27.02 
 
 
348 aa  69.3  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  28.52 
 
 
348 aa  69.3  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1985  Luciferase-like, subgroup  29.55 
 
 
331 aa  66.6  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  26.9 
 
 
343 aa  63.5  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2745  luciferase family protein  28.04 
 
 
405 aa  53.5  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266873  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  32.72 
 
 
358 aa  53.1  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2381  Luciferase-like monooxygenase  26.09 
 
 
355 aa  51.2  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.715687  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  27.27 
 
 
329 aa  47.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  41.67 
 
 
329 aa  44.3  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0516  luciferase family protein  25.44 
 
 
327 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6837  Luciferase-like monooxygenase  33.97 
 
 
345 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.119181  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4204  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  32.03 
 
 
334 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  24.83 
 
 
372 aa  43.5  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  46.67 
 
 
327 aa  43.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0958  luciferase-like  65.52 
 
 
361 aa  42  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>