More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1042 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  100 
 
 		 358 aa  733    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  36.54 
 
 		 342 aa  192  6e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  37.54 
 
 		 340 aa  188  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2486  Luciferase-like monooxygenase  35.59 
 
 		 367 aa  182  7e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000818407 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2764  luciferase family protein  34.69 
 
 		 377 aa  182  7e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0691777  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0613  luciferase-like protein  35.51 
 
 		 350 aa  182  8.000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2381  Luciferase-like monooxygenase  36.52 
 
 		 355 aa  180  4e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.715687  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0010  Luciferase-like monooxygenase  32.6 
 
 		 356 aa  176  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1252  luciferase-like protein  34.09 
 
 		 367 aa  173  3.9999999999999995e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.334812  normal  0.775678 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0428  oxidoreductase ( coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase)  30.11 
 
 		 343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2684  Luciferase-like monooxygenase  34.69 
 
 		 355 aa  171  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.301782  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2762  Luciferase-like monooxygenase  31.04 
 
 		 364 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.150269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3657  Luciferase-like monooxygenase  34.74 
 
 		 340 aa  170  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3319  luciferase family protein  35.63 
 
 		 340 aa  169  7e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.231946  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  33.52 
 
 		 377 aa  169  8e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6837  Luciferase-like monooxygenase  33.43 
 
 		 345 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.119181  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2854  Luciferase-like monooxygenase  32.86 
 
 		 353 aa  166  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3123  Luciferase-like monooxygenase  33.14 
 
 		 354 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  33.52 
 
 		 358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  33.24 
 
 		 345 aa  164  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1993  Luciferase-like monooxygenase  35.11 
 
 		 348 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1675  luciferase family protein  35.39 
 
 		 348 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2688  Luciferase-like monooxygenase  29.83 
 
 		 344 aa  162  7e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078022 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3314  monooxygenase  31.88 
 
 		 352 aa  162  9e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6633  Luciferase-like monooxygenase  37.04 
 
 		 344 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.45 
 
 		 387 aa  160  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.327386  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5859  luciferase family protein  32.76 
 
 		 363 aa  160  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.63 
 
 		 345 aa  159  9e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0535  Luciferase-like monooxygenase  32.29 
 
 		 349 aa  158  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7516  putative alkanal monooxygenase  32.71 
 
 		 345 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1967  luciferase family protein  33.43 
 
 		 366 aa  157  4e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  31.48 
 
 		 734 aa  156  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4507  luciferase family protein  32.75 
 
 		 347 aa  156  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.714194 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4479  luciferase family protein  33.91 
 
 		 345 aa  154  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1449  Luciferase-like monooxygenase  28.98 
 
 		 345 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  32.57 
 
 		 345 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1814  luciferase family protein  29.89 
 
 		 367 aa  152  5.9999999999999996e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440948  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1229  luciferase family protein  32.57 
 
 		 343 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1952  luciferase family protein  32.95 
 
 		 343 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2829  Luciferase-like, subgroup  30.73 
 
 		 388 aa  151  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783781  hitchhiker  0.00301376 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1759  luciferase-like monooxygenase  28.12 
 
 		 351 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0703  luciferase-like  29.51 
 
 		 378 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00489666  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  32.67 
 
 		 359 aa  150  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.27 
 
 		 365 aa  149  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1977  luciferase family protein  27.84 
 
 		 352 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94437e-17 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0731  luciferase family protein  27.59 
 
 		 347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1776  luciferase-like monooxygenase  27.84 
 
 		 351 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1930  putative monooxygenase  30.62 
 
 		 371 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.699322  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1941  luciferase family protein  27.76 
 
 		 351 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2185  luciferase family protein  30.84 
 
 		 345 aa  146  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2288  Luciferase-like monooxygenase  28.16 
 
 		 369 aa  146  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000270787 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2020  luciferase family protein  27.84 
 
 		 351 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.123786  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  33.14 
 
 		 361 aa  145  9e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1802  luciferase family protein  27.27 
 
 		 351 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1942  luciferase family protein  27.27 
 
 		 351 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.59 
 
 		 366 aa  145  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.267791 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2154  Luciferase-like, subgroup  30.17 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0618326  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2284  Luciferase-like monooxygenase  29.05 
 
 		 382 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170982  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0569  Luciferase-like monooxygenase  29.61 
 
 		 374 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal  0.327151 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1932  luciferase family protein  29.89 
 
 		 396 aa  143  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.936337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2551  luciferase family protein  28.49 
 
 		 374 aa  143  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.726432  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1773  Luciferase-like monooxygenase  29.89 
 
 		 410 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.59166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3387  luciferase family protein  26.84 
 
 		 351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.351449  hitchhiker  0.000000000482857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  30.29 
 
 		 374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1808  luciferase family protein  27.17 
 
 		 351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491562  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18700  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.45 
 
 		 381 aa  140  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2041  luciferase family protein  27.84 
 
 		 352 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0397  luciferase family protein  29.3 
 
 		 353 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0387  luciferase family protein  29.3 
 
 		 353 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000173024  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02730  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.03 
 
 		 347 aa  139  4.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.844523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1938  luciferase family protein  29.17 
 
 		 380 aa  138  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.107007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  30.48 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  28.7 
 
 		 352 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3586  luciferase-like protein  29.75 
 
 		 372 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0195616  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  31.07 
 
 		 357 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3728  luciferase-like protein  30.06 
 
 		 376 aa  136  7.000000000000001e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.755496  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2468  Luciferase-like, subgroup  30.17 
 
 		 369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.874778 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2006  Luciferase-like, subgroup  29.14 
 
 		 377 aa  134  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.528515  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  26.93 
 
 		 396 aa  134  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0546352  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  29.6 
 
 		 481 aa  133  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4581  Luciferase-like monooxygenase  29.89 
 
 		 371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2597  luciferase family protein  29.05 
 
 		 374 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1277  Luciferase-like monooxygenase  28.69 
 
 		 376 aa  129  7.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1100  Luciferase-like, subgroup  29.33 
 
 		 367 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.43762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0819  luciferase-like monooxygenase  31.03 
 
 		 349 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1723  Luciferase-like monooxygenase  28.45 
 
 		 386 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.655893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19770  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.23 
 
 		 384 aa  124  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000302603  normal  0.0229547 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  27.14 
 
 		 374 aa  110  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  29.45 
 
 		 334 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  26.49 
 
 		 341 aa  107  4e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  29.86 
 
 		 354 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  27.19 
 
 		 331 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5586  Luciferase-like monooxygenase  27.06 
 
 		 346 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0885387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  38.1 
 
 		 352 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6547  Luciferase-like monooxygenase  26.53 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  26.59 
 
 		 347 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  29.62 
 
 		 352 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  26.25 
 
 		 346 aa  100  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  29.23 
 
 		 334 aa  99.4  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  26.73 
 
 		 347 aa  99  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>