More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0164 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 		 334 aa  670    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  97.01 
 
 		 334 aa  634    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  39.68 
 
 		 341 aa  262  4.999999999999999e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  31.74 
 
 		 374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  29.33 
 
 		 353 aa  143  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  33.12 
 
 		 352 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  30.97 
 
 		 328 aa  135  8e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  26.65 
 
 		 371 aa  125  8.000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7310  monooxygenase  28.83 
 
 		 355 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  27.61 
 
 		 362 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  29.48 
 
 		 376 aa  123  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7675  putative alkanal monooxygenase (FMN-linked) (luciferase-related)  27.87 
 
 		 413 aa  119  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  29.31 
 
 		 365 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  30 
 
 		 331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  29.78 
 
 		 364 aa  115  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  39.26 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3467  luciferase family protein  30.36 
 
 		 354 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  34.16 
 
 		 343 aa  113  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  26.42 
 
 		 352 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  28.21 
 
 		 342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1424  Luciferase-like monooxygenase  26.56 
 
 		 377 aa  110  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  44.54 
 
 		 348 aa  110  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  27.38 
 
 		 336 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  36.57 
 
 		 329 aa  108  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  27.05 
 
 		 342 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  29.69 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  23.73 
 
 		 387 aa  104  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  24.43 
 
 		 379 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2402  amino acid adenylation  28.28 
 
 		 1519 aa  105  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  24.19 
 
 		 383 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  30.67 
 
 		 346 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  33.71 
 
 		 333 aa  103  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  35.29 
 
 		 363 aa  103  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3721  luciferase-like  29.74 
 
 		 389 aa  103  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  31.71 
 
 		 364 aa  103  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  27.39 
 
 		 3337 aa  103  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  29.91 
 
 		 354 aa  103  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  36.24 
 
 		 352 aa  102  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  26.02 
 
 		 362 aa  102  7e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1646  luciferase family protein  27.74 
 
 		 405 aa  101  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0451  luciferase-like protein  30.07 
 
 		 309 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0462  luciferase family protein  30.07 
 
 		 312 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  36.94 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  35.23 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.03 
 
 		 1107 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3067  Luciferase-like monooxygenase  26.32 
 
 		 408 aa  101  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0438  luciferase family protein  30.07 
 
 		 309 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.465558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  27.6 
 
 		 330 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2849  alkanal monooxygenase  32.95 
 
 		 341 aa  100  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.633126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  33.33 
 
 		 333 aa  99.8  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  40.91 
 
 		 346 aa  99  9e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  29.35 
 
 		 345 aa  99.4  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  29.23 
 
 		 358 aa  99  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  27.59 
 
 		 6889 aa  99  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4430  luciferase-like  27.14 
 
 		 337 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  27.11 
 
 		 348 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  27.62 
 
 		 335 aa  98.2  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4006  luciferase-like protein  27.87 
 
 		 364 aa  98.2  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9288  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  29.66 
 
 		 356 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.862144 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3066  MCP methyltransferase, CheR-type  26.95 
 
 		 4483 aa  97.8  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2999  Luciferase-like monooxygenase  34.65 
 
 		 294 aa  97.4  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.547071  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1926  hypothetical protein  27.68 
 
 		 313 aa  97.1  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  42.74 
 
 		 343 aa  97.1  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4204  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  36.42 
 
 		 334 aa  97.1  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  26.91 
 
 		 347 aa  96.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1675  luciferase family protein  25.07 
 
 		 362 aa  96.7  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.79214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0573  luciferase family protein  24.93 
 
 		 421 aa  96.7  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  42.4 
 
 		 372 aa  95.9  8e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  44.83 
 
 		 344 aa  95.9  9e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  40 
 
 		 344 aa  95.9  9e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  27.91 
 
 		 334 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1236  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  35.62 
 
 		 323 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.282844  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  35.83 
 
 		 359 aa  95.5  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  46 
 
 		 345 aa  94.4  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  27.22 
 
 		 354 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2486  Luciferase-like monooxygenase  29.45 
 
 		 367 aa  93.6  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000818407 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  24.72 
 
 		 347 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1229  luciferase family protein  27.09 
 
 		 343 aa  93.2  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  27.88 
 
 		 365 aa  93.6  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  25.5 
 
 		 347 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4444  Luciferase-like, subgroup  25.5 
 
 		 328 aa  92.8  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155072  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  27.09 
 
 		 345 aa  92.8  7e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0203  luciferase family protein  31.33 
 
 		 362 aa  92.8  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.444678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  23.23 
 
 		 382 aa  92.8  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3318  luciferase family protein  34.43 
 
 		 346 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2764  luciferase family protein  28.36 
 
 		 377 aa  92.4  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0691777  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4193  hypothetical protein  34.24 
 
 		 339 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  26.78 
 
 		 335 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  29.27 
 
 		 358 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.62 
 
 		 306 aa  92  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  27.69 
 
 		 355 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49090  hypothetical protein  33.01 
 
 		 339 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002313 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3286  luciferase family protein  29.9 
 
 		 307 aa  91.7  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  24.79 
 
 		 346 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  24.79 
 
 		 346 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2745  luciferase family protein  39.2 
 
 		 405 aa  90.1  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0213  putative F420-dependent oxidoreductase  37.69 
 
 		 336 aa  90.1  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  24.5 
 
 		 346 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6087  alkanal monooxygenase alpha chain  26.07 
 
 		 345 aa  90.5  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.518252  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.35 
 
 		 273 aa  89.7  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>