More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4241 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  100 
 
 		 331 aa  678    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  32.71 
 
 		 365 aa  151  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  29.31 
 
 		 374 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  32.55 
 
 		 364 aa  139  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  31.2 
 
 		 362 aa  138  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  31.2 
 
 		 362 aa  138  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  29.32 
 
 		 362 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  28.05 
 
 		 347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  30.38 
 
 		 436 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  30.38 
 
 		 436 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  30.38 
 
 		 436 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  27.89 
 
 		 352 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3467  luciferase family protein  33.64 
 
 		 354 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  29.2 
 
 		 439 aa  123  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  29.79 
 
 		 439 aa  122  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  27.86 
 
 		 358 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_003296  RS03171  putative luciferase (monooxygenase) oxidoreductase protein  41.84 
 
 		 324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.208799 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.55 
 
 		 345 aa  119  7e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  35.38 
 
 		 353 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  26.14 
 
 		 347 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  27.52 
 
 		 354 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  30 
 
 		 334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  28.83 
 
 		 376 aa  116  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  25.53 
 
 		 347 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  26.44 
 
 		 346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  27.12 
 
 		 387 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  28.21 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  27.81 
 
 		 342 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  28.49 
 
 		 372 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  26.14 
 
 		 346 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  27.63 
 
 		 363 aa  112  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  25.93 
 
 		 379 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  26.44 
 
 		 345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7516  putative alkanal monooxygenase  28.12 
 
 		 345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  25.57 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  30.15 
 
 		 355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  27.8 
 
 		 346 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  26.69 
 
 		 382 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  27.64 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  25.88 
 
 		 383 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  25.53 
 
 		 346 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  30.77 
 
 		 343 aa  110  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  29.84 
 
 		 345 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  26.48 
 
 		 352 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  26.67 
 
 		 345 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  27.8 
 
 		 333 aa  108  9.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  36.22 
 
 		 345 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  39.76 
 
 		 330 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  30.16 
 
 		 358 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  25.54 
 
 		 363 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  27.44 
 
 		 347 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  29.06 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  25.23 
 
 		 355 aa  106  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  25.07 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0647  luciferase-like monooxygenase  36.42 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  26.85 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  30.22 
 
 		 352 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  28.75 
 
 		 330 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6547  Luciferase-like monooxygenase  27.05 
 
 		 346 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  27.18 
 
 		 328 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0731  luciferase family protein  27.01 
 
 		 347 aa  103  4e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2497  luciferase family oxidoreductase, group 1  30.82 
 
 		 322 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124889  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  31.12 
 
 		 358 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  26.52 
 
 		 346 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  27.05 
 
 		 358 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  25.84 
 
 		 348 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0732  luciferase  35.76 
 
 		 321 aa  103  5e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1229  luciferase family protein  28.16 
 
 		 343 aa  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  27.92 
 
 		 345 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4429  luciferase family protein  26.5 
 
 		 388 aa  102  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  26.56 
 
 		 380 aa  101  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2288  Luciferase-like monooxygenase  25.48 
 
 		 369 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000270787 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  28.08 
 
 		 361 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  26.92 
 
 		 357 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0573  luciferase family protein  26.47 
 
 		 421 aa  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5586  Luciferase-like monooxygenase  26.14 
 
 		 346 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0885387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4155  luciferase-like  23.68 
 
 		 343 aa  99.8  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1236  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  37.06 
 
 		 323 aa  99.8  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.282844  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4004  luciferase family protein  25.43 
 
 		 369 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  26.58 
 
 		 377 aa  98.6  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  29.53 
 
 		 377 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  26.71 
 
 		 371 aa  98.6  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  27.38 
 
 		 402 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  26.6 
 
 		 359 aa  98.2  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  27.76 
 
 		 374 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07710  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.56 
 
 		 322 aa  98.2  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2684  Luciferase-like monooxygenase  31.31 
 
 		 355 aa  97.4  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.301782  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  27.76 
 
 		 340 aa  97.4  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1925  luciferase family protein  25.55 
 
 		 387 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11965  monooxygenase  25.14 
 
 		 369 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.234651  normal  0.884377 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  26.32 
 
 		 415 aa  96.7  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0613  luciferase-like protein  29.11 
 
 		 350 aa  96.3  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02730  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  27.02 
 
 		 347 aa  96.3  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.844523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2551  luciferase family protein  24.84 
 
 		 374 aa  95.9  8e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.726432  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1967  luciferase family protein  28.21 
 
 		 366 aa  95.1  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0819  luciferase-like monooxygenase  28.08 
 
 		 349 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3657  Luciferase-like monooxygenase  27.83 
 
 		 340 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3314  monooxygenase  28.35 
 
 		 352 aa  94.7  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5859  luciferase family protein  27.02 
 
 		 363 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1938  luciferase family protein  23.89 
 
 		 380 aa  94  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.107007  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>