More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_19770 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_19770  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  100 
 
 
384 aa  787    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000302603  normal  0.0229547 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  76.74 
 
 
366 aa  594  1e-168  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.267791 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2597  luciferase family protein  74.53 
 
 
374 aa  565  1e-160  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1930  putative monooxygenase  74.72 
 
 
371 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.699322  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2154  Luciferase-like, subgroup  73.3 
 
 
365 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0618326  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1938  luciferase family protein  71.16 
 
 
380 aa  560  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.107007  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3586  luciferase-like protein  73.44 
 
 
372 aa  555  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0195616  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0569  Luciferase-like monooxygenase  74.37 
 
 
374 aa  555  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal  0.327151 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2468  Luciferase-like, subgroup  74.44 
 
 
369 aa  548  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.874778 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18700  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  73.05 
 
 
381 aa  548  1e-155  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2288  Luciferase-like monooxygenase  70.52 
 
 
369 aa  548  1e-155  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000270787 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2284  Luciferase-like monooxygenase  71.95 
 
 
382 aa  544  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170982  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  70.17 
 
 
396 aa  538  9.999999999999999e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0546352  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3728  luciferase-like protein  71.27 
 
 
376 aa  540  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.755496  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4581  Luciferase-like monooxygenase  73.24 
 
 
371 aa  540  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  66.06 
 
 
387 aa  536  1e-151  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.327386  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2551  luciferase family protein  66.67 
 
 
374 aa  534  1e-151  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.726432  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0703  luciferase-like  70.7 
 
 
378 aa  532  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00489666  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1773  Luciferase-like monooxygenase  66.75 
 
 
410 aa  521  1e-147  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.59166  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1100  Luciferase-like, subgroup  69.59 
 
 
367 aa  521  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.43762 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1277  Luciferase-like monooxygenase  70.05 
 
 
376 aa  509  1e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2829  Luciferase-like, subgroup  65.04 
 
 
388 aa  509  1e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783781  hitchhiker  0.00301376 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1814  luciferase family protein  68.38 
 
 
367 aa  510  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440948  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1723  Luciferase-like monooxygenase  68.62 
 
 
386 aa  507  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.655893  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2006  Luciferase-like, subgroup  67.88 
 
 
377 aa  494  9.999999999999999e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.528515  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  70.15 
 
 
481 aa  489  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1932  luciferase family protein  64.2 
 
 
396 aa  468  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.936337  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  38.04 
 
 
359 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  36.05 
 
 
377 aa  205  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  35.06 
 
 
734 aa  203  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  36.63 
 
 
357 aa  202  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  35.92 
 
 
361 aa  193  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.62 
 
 
365 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  34.26 
 
 
374 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  34.39 
 
 
352 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1759  luciferase-like monooxygenase  34.12 
 
 
351 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2020  luciferase family protein  33.82 
 
 
351 aa  180  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.123786  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1977  luciferase family protein  33.82 
 
 
352 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94437e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1776  luciferase-like monooxygenase  33.82 
 
 
351 aa  179  7e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1941  luciferase family protein  33.53 
 
 
351 aa  177  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0819  luciferase-like monooxygenase  34.42 
 
 
349 aa  176  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3387  luciferase family protein  33.24 
 
 
351 aa  176  9e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.351449  hitchhiker  0.000000000482857 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1802  luciferase family protein  33.24 
 
 
351 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1942  luciferase family protein  33.24 
 
 
351 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1808  luciferase family protein  32.35 
 
 
351 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491562  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2041  luciferase family protein  33.82 
 
 
352 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0387  luciferase family protein  31.2 
 
 
353 aa  163  6e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000173024  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0397  luciferase family protein  31.2 
 
 
353 aa  163  6e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2684  Luciferase-like monooxygenase  35.2 
 
 
355 aa  160  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.301782  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0010  Luciferase-like monooxygenase  32.58 
 
 
356 aa  153  5e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  29.74 
 
 
340 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2381  Luciferase-like monooxygenase  34.82 
 
 
355 aa  149  9e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.715687  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2762  Luciferase-like monooxygenase  31.36 
 
 
364 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.150269  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  32.36 
 
 
330 aa  143  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3314  monooxygenase  31.25 
 
 
352 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1449  Luciferase-like monooxygenase  29.14 
 
 
345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3657  Luciferase-like monooxygenase  28.66 
 
 
340 aa  136  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  31.21 
 
 
358 aa  136  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  29.23 
 
 
358 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2185  luciferase family protein  29.68 
 
 
345 aa  136  7.000000000000001e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1967  luciferase family protein  31.12 
 
 
366 aa  135  9e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  29.91 
 
 
342 aa  133  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.79 
 
 
345 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6633  Luciferase-like monooxygenase  31.5 
 
 
344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2688  Luciferase-like monooxygenase  26.82 
 
 
344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078022 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  32.09 
 
 
345 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0535  Luciferase-like monooxygenase  30.88 
 
 
349 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3319  luciferase family protein  30.87 
 
 
340 aa  130  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.231946  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1952  luciferase family protein  31.67 
 
 
343 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1229  luciferase family protein  31.81 
 
 
343 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7516  putative alkanal monooxygenase  30.23 
 
 
345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4479  luciferase family protein  29.77 
 
 
345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1252  luciferase-like protein  30.87 
 
 
367 aa  126  6e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.334812  normal  0.775678 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2486  Luciferase-like monooxygenase  28.99 
 
 
367 aa  126  7e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000818407 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02730  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  27.91 
 
 
347 aa  126  8.000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.844523  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0613  luciferase-like protein  36.92 
 
 
350 aa  125  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2764  luciferase family protein  30.03 
 
 
377 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0691777  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6837  Luciferase-like monooxygenase  28.9 
 
 
345 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.119181  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1993  Luciferase-like monooxygenase  30.17 
 
 
348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1675  luciferase family protein  30.46 
 
 
348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0731  luciferase family protein  27.71 
 
 
347 aa  120  3e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5859  luciferase family protein  31.49 
 
 
363 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  36.41 
 
 
345 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3123  Luciferase-like monooxygenase  28.94 
 
 
354 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729871  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0428  oxidoreductase ( coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase)  27.03 
 
 
343 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4507  luciferase family protein  29.63 
 
 
347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.714194 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2854  Luciferase-like monooxygenase  28.57 
 
 
353 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  27.33 
 
 
362 aa  92  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  23.08 
 
 
331 aa  89.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  22.77 
 
 
353 aa  87.4  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1404  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  37.01 
 
 
145 aa  84.3  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  23.97 
 
 
374 aa  83.6  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  34.04 
 
 
329 aa  82  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  33.52 
 
 
330 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  27.73 
 
 
328 aa  80.9  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  25.21 
 
 
365 aa  75.1  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0451  luciferase-like protein  25.98 
 
 
309 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0462  luciferase family protein  25.98 
 
 
312 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0438  luciferase family protein  25.98 
 
 
309 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.465558  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  24.6 
 
 
354 aa  73.6  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>