More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0613 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0613  luciferase-like protein  100 
 
 		 350 aa  697    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7516  putative alkanal monooxygenase  67.74 
 
 		 345 aa  459  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  66.76 
 
 		 345 aa  444  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5859  luciferase family protein  66.19 
 
 		 363 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02730  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  62.06 
 
 		 347 aa  432  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.844523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2764  luciferase family protein  63.82 
 
 		 377 aa  426  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0691777  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  64.01 
 
 		 358 aa  422  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2486  Luciferase-like monooxygenase  62.39 
 
 		 367 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000818407 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1229  luciferase family protein  62.94 
 
 		 343 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  62.94 
 
 		 345 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1952  luciferase family protein  62.35 
 
 		 343 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  61.42 
 
 		 345 aa  409  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1967  luciferase family protein  58.86 
 
 		 366 aa  400  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4507  luciferase family protein  53.91 
 
 		 347 aa  333  4e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.714194 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2854  Luciferase-like monooxygenase  52.91 
 
 		 353 aa  332  9e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0010  Luciferase-like monooxygenase  52.79 
 
 		 356 aa  325  5e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0428  oxidoreductase ( coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase)  44.9 
 
 		 343 aa  318  6e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3123  Luciferase-like monooxygenase  51.73 
 
 		 354 aa  318  6e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3314  monooxygenase  48.68 
 
 		 352 aa  313  2.9999999999999996e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  48.97 
 
 		 342 aa  312  6.999999999999999e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  48.53 
 
 		 340 aa  309  5e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2684  Luciferase-like monooxygenase  52.79 
 
 		 355 aa  308  9e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.301782  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2381  Luciferase-like monooxygenase  52.82 
 
 		 355 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.715687  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3657  Luciferase-like monooxygenase  45.72 
 
 		 340 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2688  Luciferase-like monooxygenase  45.51 
 
 		 344 aa  300  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078022 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1449  Luciferase-like monooxygenase  44.02 
 
 		 345 aa  297  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1252  luciferase-like protein  49.71 
 
 		 367 aa  295  7e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.334812  normal  0.775678 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6837  Luciferase-like monooxygenase  47.06 
 
 		 345 aa  291  8e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.119181  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3319  luciferase family protein  45.59 
 
 		 340 aa  291  9e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.231946  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0731  luciferase family protein  43.19 
 
 		 347 aa  288  1e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4479  luciferase family protein  50.29 
 
 		 345 aa  286  4e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1993  Luciferase-like monooxygenase  47.98 
 
 		 348 aa  276  5e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1675  luciferase family protein  47.69 
 
 		 348 aa  275  7e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6633  Luciferase-like monooxygenase  47.21 
 
 		 344 aa  271  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2762  Luciferase-like monooxygenase  44.92 
 
 		 364 aa  261  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.150269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0535  Luciferase-like monooxygenase  44.19 
 
 		 349 aa  257  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2185  luciferase family protein  38.08 
 
 		 345 aa  227  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  42.52 
 
 		 330 aa  226  6e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1759  luciferase-like monooxygenase  35.17 
 
 		 351 aa  223  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2020  luciferase family protein  35.17 
 
 		 351 aa  222  6e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.123786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1808  luciferase family protein  35.29 
 
 		 351 aa  222  7e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491562  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1776  luciferase-like monooxygenase  34.88 
 
 		 351 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1941  luciferase family protein  35.17 
 
 		 351 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1977  luciferase family protein  34.88 
 
 		 352 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94437e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3387  luciferase family protein  35.47 
 
 		 351 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.351449  hitchhiker  0.000000000482857 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1802  luciferase family protein  34.3 
 
 		 351 aa  216  5e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1942  luciferase family protein  34.3 
 
 		 351 aa  216  5e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2041  luciferase family protein  35.47 
 
 		 352 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0387  luciferase family protein  37.86 
 
 		 353 aa  204  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000173024  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0397  luciferase family protein  37.86 
 
 		 353 aa  204  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  35.63 
 
 		 358 aa  182  7e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.65 
 
 		 365 aa  157  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  34.73 
 
 		 734 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1404  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  50.76 
 
 		 145 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  34.15 
 
 		 377 aa  134  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  32.42 
 
 		 352 aa  133  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  33.43 
 
 		 361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  33.54 
 
 		 359 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.03 
 
 		 387 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.327386  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  34.23 
 
 		 374 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  33.03 
 
 		 357 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0703  luciferase-like  28.2 
 
 		 378 aa  123  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00489666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.26 
 
 		 366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.267791 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2154  Luciferase-like, subgroup  34.54 
 
 		 365 aa  119  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0618326  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1930  putative monooxygenase  33.03 
 
 		 371 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.699322  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2006  Luciferase-like, subgroup  28.37 
 
 		 377 aa  118  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.528515  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2284  Luciferase-like monooxygenase  32.41 
 
 		 382 aa  116  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170982  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0819  luciferase-like monooxygenase  29.81 
 
 		 349 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0569  Luciferase-like monooxygenase  28.32 
 
 		 374 aa  115  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal  0.327151 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19770  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  36.92 
 
 		 384 aa  114  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000302603  normal  0.0229547 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1773  Luciferase-like monooxygenase  34.54 
 
 		 410 aa  114  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.59166  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2468  Luciferase-like, subgroup  27.75 
 
 		 369 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.874778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  32.87 
 
 		 481 aa  113  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4581  Luciferase-like monooxygenase  28.61 
 
 		 371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2829  Luciferase-like, subgroup  34.02 
 
 		 388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783781  hitchhiker  0.00301376 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1100  Luciferase-like, subgroup  33.03 
 
 		 367 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.43762 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2288  Luciferase-like monooxygenase  25.93 
 
 		 369 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000270787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3586  luciferase-like protein  28.32 
 
 		 372 aa  109  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0195616  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3728  luciferase-like protein  31.96 
 
 		 376 aa  109  7.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.755496  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1932  luciferase family protein  32.57 
 
 		 396 aa  109  9.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.936337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2551  luciferase family protein  25.14 
 
 		 374 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.726432  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1814  luciferase family protein  34.2 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440948  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  26.45 
 
 		 396 aa  107  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0546352  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18700  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  27.46 
 
 		 381 aa  107  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1723  Luciferase-like monooxygenase  28.36 
 
 		 386 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.655893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2597  luciferase family protein  32.11 
 
 		 374 aa  102  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1938  luciferase family protein  26.29 
 
 		 380 aa  102  9e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.107007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  35.45 
 
 		 353 aa  100  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1277  Luciferase-like monooxygenase  28.65 
 
 		 376 aa  97.8  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  29.11 
 
 		 331 aa  96.3  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  30.9 
 
 		 439 aa  94  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  29.1 
 
 		 364 aa  92.8  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  26.25 
 
 		 374 aa  92  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  30.9 
 
 		 439 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  27.89 
 
 		 334 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  34.63 
 
 		 355 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  30.32 
 
 		 436 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  30.32 
 
 		 436 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  30.32 
 
 		 436 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  27.3 
 
 		 376 aa  87  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>