More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3561 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3561  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 		 340 aa  692    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.197544  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1973  luciferase family protein  80.59 
 
 		 340 aa  574  1.0000000000000001e-163  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123864  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2051  luciferase family protein  80.29 
 
 		 340 aa  573  1.0000000000000001e-162  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2848  Luciferase-like monooxygenase  80 
 
 		 341 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3121  luciferase family protein  80.59 
 
 		 340 aa  571  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0327  luciferase-like  80.88 
 
 		 344 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2676  Luciferase-like monooxygenase  79.41 
 
 		 340 aa  567  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0559319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1423  luciferase-like protein  79.41 
 
 		 341 aa  570  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2168  Luciferase-like monooxygenase  79.71 
 
 		 338 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319006  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2353  Luciferase-like monooxygenase  79.12 
 
 		 340 aa  565  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0651216  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0868  luciferase family protein  78.53 
 
 		 340 aa  564  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4485  luciferase-like  79.71 
 
 		 340 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0326  luciferase family protein  78.53 
 
 		 344 aa  561  1.0000000000000001e-159  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2931  luciferase family protein  79.41 
 
 		 348 aa  549  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1598  Luciferase-like, subgroup  78.7 
 
 		 338 aa  545  1e-154  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399762  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3196  luciferase family protein  74.12 
 
 		 340 aa  545  1e-154  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.845193  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6664  Luciferase-like monooxygenase  75.29 
 
 		 340 aa  542  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0500  Luciferase-like monooxygenase  75.88 
 
 		 340 aa  543  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.715375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0448  Luciferase-like protein  76.99 
 
 		 340 aa  539  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3005  luciferase family protein  75.59 
 
 		 338 aa  528  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2850  Luciferase-like monooxygenase  76.76 
 
 		 341 aa  520  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000200599  normal  0.039851 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03180  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  74.19 
 
 		 340 aa  499  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3232  Luciferase-like monooxygenase  61.88 
 
 		 344 aa  420  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1492  Luciferase-like, subgroup  61.24 
 
 		 345 aa  418  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3446  luciferase family protein  61.18 
 
 		 341 aa  417  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.922588  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3758  luciferase family protein  61.99 
 
 		 361 aa  409  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30900  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  53.64 
 
 		 354 aa  359  4e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.796008  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0778  Luciferase-like monooxygenase  45.64 
 
 		 355 aa  296  3e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20390  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  51.91 
 
 		 274 aa  241  1e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.173262  normal  0.119903 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06130  hypothetical protein  46.12 
 
 		 258 aa  202  5e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5180  monooxygenase  34.13 
 
 		 361 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5208  monooxygenase  31.1 
 
 		 359 aa  153  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0275727  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7327  flavin-dependent oxidoreductase  29.68 
 
 		 372 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2543  Luciferase-like monooxygenase  32.21 
 
 		 350 aa  143  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264716 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0398  putative luciferase-like monooxygenase  29.1 
 
 		 346 aa  143  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4330  Luciferase-like monooxygenase  32.66 
 
 		 341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.619439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2397  Luciferase-like monooxygenase  29.97 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17000  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.02 
 
 		 365 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0548834  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2323  Luciferase-like, subgroup  29.46 
 
 		 338 aa  135  8e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708828  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3764  luciferase family protein  32.54 
 
 		 381 aa  129  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.269499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4358  luciferase family protein  29.15 
 
 		 342 aa  123  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608083  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5567  Luciferase-like monooxygenase  30.62 
 
 		 344 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7208  monooxygenase  28.32 
 
 		 341 aa  119  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.841094  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3415  luciferase family protein  27.32 
 
 		 337 aa  119  7.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.462422  normal  0.0975768 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2792  luciferase-like protein  29.43 
 
 		 338 aa  115  7.999999999999999e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0367162  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1985  Luciferase-like, subgroup  31.5 
 
 		 331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  32.21 
 
 		 347 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  31.08 
 
 		 376 aa  99  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  30.56 
 
 		 348 aa  95.1  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06220  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  56.1 
 
 		 127 aa  93.2  6e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  29.57 
 
 		 345 aa  90.5  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  30.12 
 
 		 346 aa  88.2  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  28.61 
 
 		 348 aa  88.2  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  28.69 
 
 		 344 aa  85.9  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  28.89 
 
 		 344 aa  85.5  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  29.32 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2745  luciferase family protein  29.81 
 
 		 405 aa  80.9  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266873  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  31.1 
 
 		 364 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  27.09 
 
 		 365 aa  77.8  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.87 
 
 		 372 aa  75.5  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0958  luciferase-like  28.25 
 
 		 361 aa  73.9  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  28.32 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  27.22 
 
 		 343 aa  73.6  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  28.32 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  32.86 
 
 		 352 aa  72.8  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  28.06 
 
 		 362 aa  71.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  30.8 
 
 		 358 aa  69.7  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  27.69 
 
 		 352 aa  69.7  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  27.71 
 
 		 355 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  26.82 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  32.09 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  29.1 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  28.91 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  27.23 
 
 		 355 aa  66.2  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1074  luciferase family protein  25.62 
 
 		 345 aa  65.9  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2476  luciferase family oxidoreductase, group 1  29.34 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  30.83 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6173  luciferase family protein  32.26 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479672  normal  0.0665211 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  24.6 
 
 		 358 aa  63.9  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  27.32 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  44.59 
 
 		 327 aa  62.8  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  45.57 
 
 		 335 aa  62.4  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  39.6 
 
 		 334 aa  62  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  35.71 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1264  luciferase-like  31.15 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6567  luciferase family protein  31.15 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.420121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  38.1 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  25 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  25.15 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  28.63 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  25.32 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  31.71 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.73 
 
 		 365 aa  59.7  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  25.94 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20270  hypothetical protein  65.52 
 
 		 58 aa  59.7  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0458549  normal  0.306219 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  31.71 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02730  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  25 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.844523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1219  luciferase family oxidoreductase, group 1  26.69 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.21833 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  25.36 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>