37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_20270 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_20270  hypothetical protein  100 
 
 
58 aa  116  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0458549  normal  0.306219 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30900  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  82.76 
 
 
354 aa  101  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.796008  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3758  luciferase family protein  70.18 
 
 
361 aa  83.2  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0778  Luciferase-like monooxygenase  71.7 
 
 
355 aa  82  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3232  Luciferase-like monooxygenase  70.18 
 
 
344 aa  82.4  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3005  luciferase family protein  68.42 
 
 
338 aa  81.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0448  Luciferase-like protein  70.18 
 
 
340 aa  81.6  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1598  Luciferase-like, subgroup  63.79 
 
 
338 aa  82  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399762  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03180  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  65.52 
 
 
340 aa  81.3  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1492  Luciferase-like, subgroup  70.18 
 
 
345 aa  81.3  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3561  Luciferase-like monooxygenase  65.52 
 
 
340 aa  80.5  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.197544  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3121  luciferase family protein  64.91 
 
 
340 aa  80.5  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0500  Luciferase-like monooxygenase  63.16 
 
 
340 aa  79.7  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.715375  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2850  Luciferase-like monooxygenase  63.79 
 
 
341 aa  79.7  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000200599  normal  0.039851 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2931  luciferase family protein  66.67 
 
 
348 aa  79  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0327  luciferase-like  66.67 
 
 
344 aa  79  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2676  Luciferase-like monooxygenase  66.67 
 
 
340 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0559319  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2353  Luciferase-like monooxygenase  66.67 
 
 
340 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0651216  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1423  luciferase-like protein  63.16 
 
 
341 aa  78.6  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2848  Luciferase-like monooxygenase  63.16 
 
 
341 aa  78.6  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1973  luciferase family protein  64.91 
 
 
340 aa  77.8  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123864  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3196  luciferase family protein  59.65 
 
 
340 aa  77.4  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.845193  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0326  luciferase family protein  63.16 
 
 
344 aa  77.4  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3446  luciferase family protein  68.42 
 
 
341 aa  77.4  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.922588  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0868  luciferase family protein  63.16 
 
 
340 aa  77.4  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2051  luciferase family protein  64.91 
 
 
340 aa  77.4  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6664  Luciferase-like monooxygenase  61.4 
 
 
340 aa  77  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4485  luciferase-like  63.16 
 
 
340 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2168  Luciferase-like monooxygenase  61.4 
 
 
338 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319006  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06220  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  56.14 
 
 
127 aa  65.9  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  46.43 
 
 
344 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  44.64 
 
 
347 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  46.43 
 
 
345 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  46.43 
 
 
344 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  40.35 
 
 
363 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  44.64 
 
 
346 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1696  Luciferase-like monooxygenase  38.98 
 
 
325 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>