More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5502 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 		 363 aa  754    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  31 
 
 		 352 aa  160  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  29.86 
 
 		 362 aa  153  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  31.65 
 
 		 347 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  27.45 
 
 		 347 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5586  Luciferase-like monooxygenase  27.86 
 
 		 346 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0885387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  32.28 
 
 		 352 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6547  Luciferase-like monooxygenase  27.86 
 
 		 346 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  27.94 
 
 		 346 aa  136  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  34.18 
 
 		 347 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  27.7 
 
 		 353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  30.29 
 
 		 347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  26.04 
 
 		 346 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6087  alkanal monooxygenase alpha chain  27.04 
 
 		 345 aa  129  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.518252  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  26.04 
 
 		 346 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3467  luciferase family protein  29.5 
 
 		 354 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6122  luciferase family protein  33.06 
 
 		 345 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  25.76 
 
 		 346 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  27.02 
 
 		 355 aa  126  6e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  30.97 
 
 		 380 aa  125  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  30.17 
 
 		 345 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  30.49 
 
 		 345 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  31.96 
 
 		 354 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4155  luciferase-like  28.9 
 
 		 343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455198 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  31.98 
 
 		 346 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  36.07 
 
 		 415 aa  117  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  31.63 
 
 		 358 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  23.8 
 
 		 374 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  29.08 
 
 		 363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  29.59 
 
 		 358 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  29.44 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  27.5 
 
 		 376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  30.54 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  25.54 
 
 		 331 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  31.71 
 
 		 329 aa  108  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  34.18 
 
 		 365 aa  106  5e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  37.24 
 
 		 345 aa  106  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  31.14 
 
 		 345 aa  105  9e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3314  monooxygenase  27.62 
 
 		 352 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  29 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  27.88 
 
 		 354 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  31.61 
 
 		 364 aa  104  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  29.6 
 
 		 327 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2477  luciferase family protein  27.5 
 
 		 344 aa  103  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  30 
 
 		 328 aa  103  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  32.2 
 
 		 352 aa  103  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  34.39 
 
 		 362 aa  103  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  35.29 
 
 		 334 aa  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  34.39 
 
 		 362 aa  103  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  39.1 
 
 		 334 aa  103  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  26.61 
 
 		 379 aa  102  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  23.8 
 
 		 342 aa  102  9e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  29.63 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  34.57 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  30.77 
 
 		 372 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1069  luciferase family protein  30.51 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  30.23 
 
 		 439 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  30.53 
 
 		 346 aa  99.4  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1041  luciferase-like protein  30.51 
 
 		 308 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.655824  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1057  luciferase family protein  30.51 
 
 		 308 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.191696 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  33.96 
 
 		 348 aa  99.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  31.15 
 
 		 333 aa  99  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1236  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  35.68 
 
 		 323 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.282844  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  33.52 
 
 		 362 aa  98.6  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  30.41 
 
 		 330 aa  97.4  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4444  Luciferase-like, subgroup  32.47 
 
 		 328 aa  97.4  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155072  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03171  putative luciferase (monooxygenase) oxidoreductase protein  30.18 
 
 		 324 aa  97.1  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.208799 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  28.61 
 
 		 343 aa  97.1  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  26.55 
 
 		 352 aa  96.7  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0647  luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 		 321 aa  96.7  6e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9288  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  26.88 
 
 		 356 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.862144 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  25.94 
 
 		 383 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  25.53 
 
 		 387 aa  95.5  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  28.49 
 
 		 334 aa  94.7  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  30.64 
 
 		 371 aa  95.1  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  28.49 
 
 		 436 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0203  luciferase family protein  25.97 
 
 		 362 aa  94.7  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.444678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  28.49 
 
 		 436 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0732  luciferase  32.7 
 
 		 321 aa  94.7  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  28.49 
 
 		 436 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  31.05 
 
 		 382 aa  94.4  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  29.65 
 
 		 439 aa  94  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  28.11 
 
 		 364 aa  94  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  28.11 
 
 		 344 aa  93.6  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  28.11 
 
 		 344 aa  93.2  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  31.49 
 
 		 329 aa  92.4  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2849  alkanal monooxygenase  29.64 
 
 		 341 aa  92.4  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.633126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  25 
 
 		 355 aa  91.3  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  26.04 
 
 		 343 aa  91.7  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  30 
 
 		 307 aa  90.9  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  29.19 
 
 		 335 aa  90.5  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0962  alkanal monooxygenase alpha chain  24.83 
 
 		 354 aa  89.7  8e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.99674  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  26.63 
 
 		 357 aa  89.4  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  34.62 
 
 		 281 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2939  luciferase-like  34.74 
 
 		 368 aa  87.8  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0140506  hitchhiker  0.0000735163 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  41.38 
 
 		 348 aa  88.6  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  31.21 
 
 		 386 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  43.81 
 
 		 348 aa  87.4  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  30.84 
 
 		 3337 aa  87  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2703  Luciferase-like monooxygenase  30.11 
 
 		 341 aa  87  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.190412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>