More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0778 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0778  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 		 355 aa  725    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30900  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  60.39 
 
 		 354 aa  411  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.796008  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0448  Luciferase-like protein  50 
 
 		 340 aa  332  6e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1492  Luciferase-like, subgroup  53.2 
 
 		 345 aa  325  9e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2168  Luciferase-like monooxygenase  48.69 
 
 		 338 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319006  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3446  luciferase family protein  51.45 
 
 		 341 aa  323  3e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.922588  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3005  luciferase family protein  49.43 
 
 		 338 aa  319  5e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2848  Luciferase-like monooxygenase  49.13 
 
 		 341 aa  317  3e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3232  Luciferase-like monooxygenase  50.14 
 
 		 344 aa  315  7e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1423  luciferase-like protein  49.13 
 
 		 341 aa  315  7e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03180  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  51.02 
 
 		 340 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1598  Luciferase-like, subgroup  48.09 
 
 		 338 aa  310  2.9999999999999997e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399762  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0327  luciferase-like  47.67 
 
 		 344 aa  308  6.999999999999999e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0868  luciferase family protein  47.97 
 
 		 340 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2676  Luciferase-like monooxygenase  48.26 
 
 		 340 aa  306  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0559319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1973  luciferase family protein  47.38 
 
 		 340 aa  306  5.0000000000000004e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123864  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2051  luciferase family protein  47.38 
 
 		 340 aa  305  7e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0326  luciferase family protein  45.93 
 
 		 344 aa  303  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2353  Luciferase-like monooxygenase  47.97 
 
 		 340 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0651216  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3758  luciferase family protein  50.57 
 
 		 361 aa  300  2e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3121  luciferase family protein  46.8 
 
 		 340 aa  300  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2850  Luciferase-like monooxygenase  47.69 
 
 		 341 aa  298  8e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000200599  normal  0.039851 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6664  Luciferase-like monooxygenase  44.77 
 
 		 340 aa  298  9e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3196  luciferase family protein  46.09 
 
 		 340 aa  296  3e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.845193  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3561  Luciferase-like monooxygenase  45.64 
 
 		 340 aa  296  3e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.197544  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0500  Luciferase-like monooxygenase  45.06 
 
 		 340 aa  296  5e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.715375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20390  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  58.33 
 
 		 274 aa  295  7e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.173262  normal  0.119903 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4485  luciferase-like  46.8 
 
 		 340 aa  295  9e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2931  luciferase family protein  48.27 
 
 		 348 aa  291  8e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06130  hypothetical protein  42.86 
 
 		 258 aa  159  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7327  flavin-dependent oxidoreductase  29.86 
 
 		 372 aa  129  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5180  monooxygenase  27.96 
 
 		 361 aa  119  9e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0398  putative luciferase-like monooxygenase  26.89 
 
 		 346 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5208  monooxygenase  28.9 
 
 		 359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0275727  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4330  Luciferase-like monooxygenase  30.2 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.619439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2397  Luciferase-like monooxygenase  27.93 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3764  luciferase family protein  28.13 
 
 		 381 aa  106  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.269499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2543  Luciferase-like monooxygenase  27.17 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264716 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17000  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.62 
 
 		 365 aa  104  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0548834  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2323  Luciferase-like, subgroup  27.3 
 
 		 338 aa  100  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708828  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7208  monooxygenase  26.74 
 
 		 341 aa  98.6  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.841094  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3415  luciferase family protein  26.89 
 
 		 337 aa  94.4  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.462422  normal  0.0975768 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4358  luciferase family protein  25.5 
 
 		 342 aa  94.4  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608083  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5567  Luciferase-like monooxygenase  26.91 
 
 		 344 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  30.12 
 
 		 345 aa  87.8  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  29.94 
 
 		 344 aa  85.5  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  30.23 
 
 		 344 aa  85.1  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2792  luciferase-like protein  26.3 
 
 		 338 aa  82.4  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0367162  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  28.16 
 
 		 346 aa  81.3  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  27.42 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  30.09 
 
 		 347 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  27.44 
 
 		 348 aa  72.4  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  30.42 
 
 		 380 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1985  Luciferase-like, subgroup  28.79 
 
 		 331 aa  72  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  26.51 
 
 		 348 aa  72  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06220  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  43.21 
 
 		 127 aa  67.8  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2745  luciferase family protein  26.59 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  26.33 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  27.91 
 
 		 355 aa  66.2  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  26.24 
 
 		 327 aa  65.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  26.13 
 
 		 341 aa  65.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  31.03 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20270  hypothetical protein  71.7 
 
 		 58 aa  63.5  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0458549  normal  0.306219 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  36.54 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  31.03 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  31.03 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1236  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  33.12 
 
 		 323 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.282844  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  28.43 
 
 		 345 aa  62  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  36.9 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  27.71 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  26.23 
 
 		 365 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  35.71 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5062  luciferase family protein  39.22 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  32.93 
 
 		 352 aa  59.3  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  27.24 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  25.14 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3368  luciferase family protein  27.52 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852738  normal  0.168989 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10043  oxidoreductase  34.95 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2460  putative F420-dependent oxidoreductase  38.1 
 
 		 531 aa  57  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.952845  normal  0.0130004 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  31.3 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  29.86 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  32.58 
 
 		 352 aa  56.2  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  24.86 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  44.62 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  34.86 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  30.69 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1938  luciferase family protein  32.74 
 
 		 380 aa  55.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.107007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0703  luciferase-like  32.74 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00489666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1814  luciferase family protein  36.08 
 
 		 367 aa  55.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440948  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  25.53 
 
 		 364 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4204  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  38 
 
 		 334 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2993  luciferase family protein  33.02 
 
 		 347 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.11529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  34.34 
 
 		 372 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1713  luciferase family oxidoreductase, group 1  29.79 
 
 		 338 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.921889 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  22.29 
 
 		 342 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2267  Luciferase-like, subgroup  35.29 
 
 		 391 aa  55.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1952  luciferase family protein  34.23 
 
 		 343 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0625  Luciferase-like monooxygenase  28.75 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00154415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  28.46 
 
 		 363 aa  55.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27940  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  36.73 
 
 		 262 aa  54.7  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.632404  normal  0.0133043 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>