More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1053 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  100 
 
 		 376 aa  734    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  66.67 
 
 		 348 aa  435  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  65.53 
 
 		 347 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  64.69 
 
 		 346 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  64.31 
 
 		 344 aa  411  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  66.07 
 
 		 348 aa  408  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  64.01 
 
 		 344 aa  409  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  64.67 
 
 		 345 aa  410  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  58.6 
 
 		 343 aa  370  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  60.98 
 
 		 341 aa  361  9e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  57.67 
 
 		 372 aa  329  4e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2745  luciferase family protein  53.41 
 
 		 405 aa  296  3e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  29.91 
 
 		 342 aa  113  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  25.75 
 
 		 341 aa  107  4e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30900  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.79 
 
 		 354 aa  106  8e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.796008  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3005  luciferase family protein  31.21 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  42.98 
 
 		 364 aa  102  8e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2168  Luciferase-like monooxygenase  32.52 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319006  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0448  Luciferase-like protein  30.61 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  36.94 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  36.94 
 
 		 334 aa  101  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1492  Luciferase-like, subgroup  31.06 
 
 		 345 aa  99.8  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  31.78 
 
 		 327 aa  99.4  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3561  Luciferase-like monooxygenase  31.08 
 
 		 340 aa  99  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.197544  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  30.92 
 
 		 333 aa  98.6  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  29.36 
 
 		 347 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  41.53 
 
 		 352 aa  97.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  27.87 
 
 		 345 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2848  Luciferase-like monooxygenase  30.37 
 
 		 341 aa  96.3  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6664  Luciferase-like monooxygenase  28.44 
 
 		 340 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0326  luciferase family protein  30.7 
 
 		 344 aa  95.1  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  27.02 
 
 		 353 aa  93.6  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1423  luciferase-like protein  30.06 
 
 		 341 aa  93.6  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3446  luciferase family protein  30.24 
 
 		 341 aa  93.6  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.922588  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  27.35 
 
 		 347 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3232  Luciferase-like monooxygenase  28.41 
 
 		 344 aa  92.8  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  35.56 
 
 		 362 aa  92.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2792  luciferase-like protein  30.83 
 
 		 338 aa  92  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0367162  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4330  Luciferase-like monooxygenase  30.88 
 
 		 341 aa  91.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.619439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2323  Luciferase-like, subgroup  30.42 
 
 		 338 aa  91.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708828  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  30.94 
 
 		 343 aa  91.3  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4358  luciferase family protein  30.18 
 
 		 342 aa  90.5  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608083  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  26.73 
 
 		 346 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  27.65 
 
 		 346 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2353  Luciferase-like monooxygenase  30 
 
 		 340 aa  90.1  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0651216  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  26.73 
 
 		 346 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0868  luciferase family protein  29.71 
 
 		 340 aa  89.4  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  30.07 
 
 		 329 aa  89.4  9e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7208  monooxygenase  30.75 
 
 		 341 aa  88.6  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.841094  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2850  Luciferase-like monooxygenase  29.73 
 
 		 341 aa  89.4  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000200599  normal  0.039851 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03180  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.76 
 
 		 340 aa  89  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3196  luciferase family protein  26.77 
 
 		 340 aa  89  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.845193  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2051  luciferase family protein  27.74 
 
 		 340 aa  88.2  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  27.84 
 
 		 347 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7327  flavin-dependent oxidoreductase  30.54 
 
 		 372 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2397  Luciferase-like monooxygenase  29.46 
 
 		 341 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0398  putative luciferase-like monooxygenase  30.06 
 
 		 346 aa  87.4  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4485  luciferase-like  29.45 
 
 		 340 aa  87.4  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  35.23 
 
 		 330 aa  87  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3121  luciferase family protein  29.57 
 
 		 340 aa  86.7  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  26.51 
 
 		 345 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  26.8 
 
 		 355 aa  86.3  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  41.82 
 
 		 329 aa  86.3  8e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2676  Luciferase-like monooxygenase  29.79 
 
 		 340 aa  86.3  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0559319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  36.49 
 
 		 346 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  28.04 
 
 		 402 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0327  luciferase-like  29.18 
 
 		 344 aa  85.9  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3758  luciferase family protein  28.4 
 
 		 361 aa  85.5  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5208  monooxygenase  29.15 
 
 		 359 aa  85.1  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0275727  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2931  luciferase family protein  30.98 
 
 		 348 aa  85.5  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2543  Luciferase-like monooxygenase  28.57 
 
 		 350 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264716 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1973  luciferase family protein  27.44 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123864  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5180  monooxygenase  27.57 
 
 		 361 aa  85.5  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  44.44 
 
 		 363 aa  85.1  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  39.23 
 
 		 334 aa  85.1  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  29 
 
 		 340 aa  84.3  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  34.85 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  34.85 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  43.1 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3415  luciferase family protein  27.81 
 
 		 337 aa  84  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.462422  normal  0.0975768 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  36.59 
 
 		 374 aa  83.6  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  30.46 
 
 		 355 aa  83.2  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5567  Luciferase-like monooxygenase  31.17 
 
 		 344 aa  83.2  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0852  luciferase family protein  35.71 
 
 		 365 aa  81.6  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  42.86 
 
 		 382 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  26.87 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  30.06 
 
 		 364 aa  81.3  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  45.65 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4444  Luciferase-like, subgroup  40.54 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155072  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  35.94 
 
 		 372 aa  80.1  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17000  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  36.78 
 
 		 365 aa  80.1  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0548834  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3539  Luciferase-like monooxygenase  35.83 
 
 		 378 aa  79.7  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0203  luciferase family protein  34.75 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.444678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0500  Luciferase-like monooxygenase  27.81 
 
 		 340 aa  79.7  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.715375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  39.6 
 
 		 379 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  36.07 
 
 		 383 aa  79.7  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  30.86 
 
 		 363 aa  79.7  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  30.36 
 
 		 362 aa  79  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0778  Luciferase-like monooxygenase  27.42 
 
 		 355 aa  79  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  35.76 
 
 		 272 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>