More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0852 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0852  luciferase family protein  100 
 
 		 365 aa  762    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0203  luciferase family protein  58.56 
 
 		 362 aa  468  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.444678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0220  luciferase family protein  54.67 
 
 		 360 aa  432  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2939  luciferase-like  47.22 
 
 		 368 aa  337  1.9999999999999998e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0140506  hitchhiker  0.0000735163 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7561  putative luciferase-like monooxygenase  38.69 
 
 		 366 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11965  monooxygenase  37.81 
 
 		 369 aa  238  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.234651  normal  0.884377 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4004  luciferase family protein  37.94 
 
 		 369 aa  237  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1646  luciferase family protein  31.42 
 
 		 405 aa  157  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5158  luciferase family protein  31.08 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0522  luciferase-like  29.81 
 
 		 374 aa  140  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1468  luciferase-like  29.04 
 
 		 366 aa  139  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.839714  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13649  monooxygenase  33.33 
 
 		 395 aa  135  9e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.486849  hitchhiker  0.000284766 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4772  luciferase-like protein  33.98 
 
 		 396 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4858  luciferase family protein  33.98 
 
 		 396 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7675  putative alkanal monooxygenase (FMN-linked) (luciferase-related)  29.95 
 
 		 413 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4429  luciferase family protein  28.57 
 
 		 388 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1925  luciferase family protein  28.85 
 
 		 387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3721  luciferase-like  30.39 
 
 		 389 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2267  Luciferase-like, subgroup  27.27 
 
 		 391 aa  120  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  28.8 
 
 		 364 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  31.5 
 
 		 436 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  31.5 
 
 		 436 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  31.5 
 
 		 436 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  30.04 
 
 		 439 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  28.28 
 
 		 439 aa  104  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  29.73 
 
 		 353 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  25.61 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  27.98 
 
 		 415 aa  100  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  30 
 
 		 352 aa  99.8  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  25.54 
 
 		 345 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  29.68 
 
 		 372 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  25.2 
 
 		 374 aa  98.2  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  30.45 
 
 		 377 aa  93.6  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  32.85 
 
 		 379 aa  92.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  27.37 
 
 		 362 aa  92.4  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  27.37 
 
 		 362 aa  92.4  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  27.54 
 
 		 365 aa  90.1  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  28.44 
 
 		 329 aa  89.4  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  27.02 
 
 		 363 aa  88.2  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  26.95 
 
 		 354 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 309 aa  87  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  31.31 
 
 		 358 aa  86.7  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  28.7 
 
 		 346 aa  86.7  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7341  Luciferase-like monooxygenase  27.73 
 
 		 309 aa  86.3  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268267 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  27.07 
 
 		 343 aa  85.9  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  28.7 
 
 		 327 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5748  luciferase family protein  25.44 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  hitchhiker  0.000000000857143 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  32.83 
 
 		 387 aa  85.1  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  23.87 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  30.7 
 
 		 383 aa  84.3  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 		 363 aa  84.3  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  41.35 
 
 		 345 aa  84  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  30.35 
 
 		 347 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  26.77 
 
 		 358 aa  83.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  41.35 
 
 		 346 aa  83.6  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3539  Luciferase-like monooxygenase  23.3 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  27.3 
 
 		 402 aa  83.6  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3880  luciferase family protein  26.56 
 
 		 316 aa  82.8  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  34.81 
 
 		 334 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4271  luciferase family protein  27.42 
 
 		 316 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0653657  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  34.81 
 
 		 334 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  25 
 
 		 342 aa  82  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  36.17 
 
 		 348 aa  82.4  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  34.27 
 
 		 344 aa  82.4  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  35.71 
 
 		 376 aa  81.6  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4430  luciferase-like  25.44 
 
 		 337 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  30.9 
 
 		 352 aa  81.6  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  34.04 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  31.61 
 
 		 382 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  32.29 
 
 		 346 aa  80.9  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  34.4 
 
 		 343 aa  81.3  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  24.49 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4155  luciferase-like  31.37 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455198 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  31.21 
 
 		 355 aa  80.9  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4444  Luciferase-like, subgroup  24.1 
 
 		 328 aa  80.1  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155072  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  29.95 
 
 		 380 aa  79.3  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  27.14 
 
 		 311 aa  79.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  30.12 
 
 		 290 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  28.04 
 
 		 341 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  23.84 
 
 		 354 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  26.86 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  25.86 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2867  putative F420-dependent oxidoreductase  30.39 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  24.38 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  30.66 
 
 		 352 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  29.12 
 
 		 281 aa  76.6  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  29.35 
 
 		 347 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6087  alkanal monooxygenase alpha chain  32.5 
 
 		 345 aa  76.3  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.518252  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2346  luciferase family protein  28.35 
 
 		 316 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0184001 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0629  luciferase family protein  25.87 
 
 		 319 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662642 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  23.86 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  23.16 
 
 		 336 aa  75.1  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  27.93 
 
 		 347 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  30.69 
 
 		 347 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  34.03 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1041  luciferase-like protein  25.15 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.655824  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5586  Luciferase-like monooxygenase  30.65 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0885387  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  27.11 
 
 		 364 aa  74.3  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1057  luciferase family protein  25.15 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.191696 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3286  luciferase family protein  26.46 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0452434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>