More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3594 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  100 
 
 		 387 aa  802    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  78.02 
 
 		 383 aa  622  1e-177  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  68.72 
 
 		 377 aa  541  1e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  64.89 
 
 		 379 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  65.6 
 
 		 382 aa  503  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  35.13 
 
 		 415 aa  214  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  31.32 
 
 		 372 aa  182  9.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  30.69 
 
 		 436 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  30.69 
 
 		 436 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  30.69 
 
 		 436 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  30.08 
 
 		 439 aa  176  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  29.82 
 
 		 439 aa  176  6e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  27.69 
 
 		 365 aa  172  7.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  28.75 
 
 		 386 aa  166  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  30.83 
 
 		 402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  28.42 
 
 		 364 aa  162  9e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  28.12 
 
 		 362 aa  143  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  28.12 
 
 		 362 aa  143  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  32.68 
 
 		 355 aa  143  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6510  luciferase family protein  29.34 
 
 		 384 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4909  luciferase-like  29.75 
 
 		 384 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3254  luciferase family protein  29.75 
 
 		 384 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  32.75 
 
 		 380 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8768  Luciferase-like monooxygenase  29.92 
 
 		 375 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.463122 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  30.21 
 
 		 353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  25.52 
 
 		 362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  27.12 
 
 		 331 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  25.38 
 
 		 347 aa  110  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  26.32 
 
 		 347 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  26.49 
 
 		 358 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  24.86 
 
 		 355 aa  106  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4006  luciferase-like protein  24.21 
 
 		 364 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  25.85 
 
 		 345 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  25 
 
 		 371 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  23.73 
 
 		 334 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  26.37 
 
 		 345 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  25.33 
 
 		 362 aa  102  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  33.02 
 
 		 329 aa  102  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  31.19 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  37.2 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  28.77 
 
 		 352 aa  101  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  27.78 
 
 		 345 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  26.87 
 
 		 348 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3539  Luciferase-like monooxygenase  27 
 
 		 378 aa  96.7  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  26.92 
 
 		 341 aa  96.3  8e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  25.53 
 
 		 354 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  25.53 
 
 		 363 aa  95.9  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  25.88 
 
 		 352 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  32.98 
 
 		 333 aa  95.1  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  25 
 
 		 346 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  31.84 
 
 		 346 aa  94.4  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  25.2 
 
 		 346 aa  94  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  25.2 
 
 		 346 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  32.37 
 
 		 330 aa  93.2  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4444  Luciferase-like, subgroup  23.53 
 
 		 328 aa  92.8  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155072  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  30.37 
 
 		 354 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  23.81 
 
 		 334 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  25.26 
 
 		 347 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7310  monooxygenase  25.07 
 
 		 355 aa  90.9  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  24.2 
 
 		 328 aa  90.9  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  36.15 
 
 		 344 aa  89.7  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  34.29 
 
 		 327 aa  89.7  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  27.8 
 
 		 346 aa  89  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  24.24 
 
 		 363 aa  89.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  30.59 
 
 		 345 aa  88.6  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  26.19 
 
 		 347 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  24.16 
 
 		 335 aa  88.2  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  29.63 
 
 		 355 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  26.96 
 
 		 342 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  39.55 
 
 		 358 aa  88.2  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  27.15 
 
 		 345 aa  87.8  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  43.14 
 
 		 344 aa  87.8  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  28.4 
 
 		 364 aa  87.4  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  26.21 
 
 		 343 aa  87  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  37.1 
 
 		 341 aa  86.7  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.17 
 
 		 277 aa  86.7  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.759524 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 		 343 aa  86.3  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  24.47 
 
 		 358 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0852  luciferase family protein  32.18 
 
 		 365 aa  85.5  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  24.43 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2486  Luciferase-like monooxygenase  26.95 
 
 		 367 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000818407 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1646  luciferase family protein  24.46 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  34.71 
 
 		 377 aa  84.3  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6547  Luciferase-like monooxygenase  27.8 
 
 		 346 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0613  luciferase-like protein  25.28 
 
 		 350 aa  84.3  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5586  Luciferase-like monooxygenase  27.32 
 
 		 346 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0885387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1109  luciferase family protein  24.93 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7675  putative alkanal monooxygenase (FMN-linked) (luciferase-related)  29.38 
 
 		 413 aa  84  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3467  luciferase family protein  29.08 
 
 		 354 aa  83.6  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4624  luciferase family protein  28.49 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03171  putative luciferase (monooxygenase) oxidoreductase protein  25.66 
 
 		 324 aa  82.8  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.208799 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  41.41 
 
 		 345 aa  82.8  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 		 346 aa  82  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4027  luciferase family protein  28.77 
 
 		 306 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.826665 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  29.38 
 
 		 342 aa  82.4  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9288  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  25.5 
 
 		 356 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.862144 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1967  luciferase family protein  39.37 
 
 		 366 aa  82  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  25.47 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  27.54 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  23.37 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>