More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7310 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7310  monooxygenase  100 
 
 		 355 aa  729    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.89 
 
 		 1107 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  44.19 
 
 		 6889 aa  300  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  42.11 
 
 		 3337 aa  292  5e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0838  amino acid adenylation domain-containing protein  43.13 
 
 		 1541 aa  272  5.000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3067  Luciferase-like monooxygenase  40.94 
 
 		 408 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2402  amino acid adenylation  41.06 
 
 		 1519 aa  265  7e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3066  MCP methyltransferase, CheR-type  38.19 
 
 		 4483 aa  243  3e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4910  Luciferase-like monooxygenase  40.25 
 
 		 372 aa  222  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.805789  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1424  Luciferase-like monooxygenase  31.32 
 
 		 377 aa  192  8e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  28.83 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  29.43 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  26.52 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  24.64 
 
 		 374 aa  103  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  27.07 
 
 		 352 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  28.74 
 
 		 380 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  25.23 
 
 		 362 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  23.93 
 
 		 341 aa  97.4  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  27.64 
 
 		 439 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  26.42 
 
 		 353 aa  92.8  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  36.36 
 
 		 346 aa  92.4  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  28.61 
 
 		 436 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  28.32 
 
 		 439 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  28.61 
 
 		 436 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  28.61 
 
 		 436 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  30.61 
 
 		 330 aa  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  28.97 
 
 		 352 aa  91.3  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  29.64 
 
 		 345 aa  92  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  26.17 
 
 		 365 aa  92  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  27.33 
 
 		 364 aa  90.9  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  25.07 
 
 		 387 aa  91.3  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6087  alkanal monooxygenase alpha chain  26.41 
 
 		 345 aa  89.7  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.518252  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  34.09 
 
 		 345 aa  88.6  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  25.38 
 
 		 347 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2712  luciferase family protein  27.22 
 
 		 388 aa  87.8  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.688075 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  25.6 
 
 		 346 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  25.6 
 
 		 346 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  24.04 
 
 		 347 aa  86.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  32.95 
 
 		 376 aa  86.7  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  30.65 
 
 		 352 aa  86.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  34.1 
 
 		 344 aa  86.3  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3314  monooxygenase  29.17 
 
 		 352 aa  85.5  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  33.53 
 
 		 344 aa  85.5  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  25.9 
 
 		 347 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  30.86 
 
 		 346 aa  84.3  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  24.92 
 
 		 346 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  28.74 
 
 		 363 aa  83.2  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  29.29 
 
 		 329 aa  82.8  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  29.52 
 
 		 358 aa  82.8  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  24.55 
 
 		 345 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  27.41 
 
 		 372 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  24.85 
 
 		 345 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3467  luciferase family protein  29.26 
 
 		 354 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  26.17 
 
 		 346 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  30.65 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  33.1 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0428  oxidoreductase ( coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase)  26.07 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  30.43 
 
 		 333 aa  80.1  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  36.59 
 
 		 348 aa  80.1  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  26.6 
 
 		 734 aa  79.7  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  22.46 
 
 		 386 aa  79.3  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  25.53 
 
 		 347 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5586  Luciferase-like monooxygenase  24.85 
 
 		 346 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0885387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6547  Luciferase-like monooxygenase  25.29 
 
 		 346 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4155  luciferase-like  27.68 
 
 		 343 aa  78.2  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455198 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1808  luciferase family protein  27.7 
 
 		 351 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491562  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  32.97 
 
 		 327 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  32.16 
 
 		 348 aa  77.4  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  32.2 
 
 		 341 aa  77.8  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3318  luciferase family protein  34.39 
 
 		 346 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  25.9 
 
 		 365 aa  77.8  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  26.19 
 
 		 355 aa  77  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6195  luciferase family protein  31.82 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0105566 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  27.83 
 
 		 342 aa  76.6  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.58 
 
 		 372 aa  76.3  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6122  luciferase family protein  23.6 
 
 		 345 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  27.03 
 
 		 336 aa  75.5  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  24.44 
 
 		 340 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2745  luciferase family protein  40.21 
 
 		 405 aa  75.9  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  23.48 
 
 		 358 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  25.91 
 
 		 328 aa  75.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  24.59 
 
 		 358 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3387  luciferase family protein  26.87 
 
 		 351 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.351449  hitchhiker  0.000000000482857 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  26.82 
 
 		 354 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  28.51 
 
 		 329 aa  74.7  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3657  Luciferase-like monooxygenase  25.5 
 
 		 340 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  33.59 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3319  luciferase family protein  23.58 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.231946  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  22.76 
 
 		 355 aa  73.2  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  26.73 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4444  Luciferase-like, subgroup  27.01 
 
 		 328 aa  73.2  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155072  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1449  Luciferase-like monooxygenase  25.58 
 
 		 345 aa  73.2  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2477  luciferase family protein  23.94 
 
 		 344 aa  72.8  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4507  luciferase family protein  26.84 
 
 		 347 aa  72.8  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.714194 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5167  luciferase family protein  31.55 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  27.69 
 
 		 362 aa  72.8  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  27.69 
 
 		 362 aa  72.8  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1776  luciferase-like monooxygenase  25.37 
 
 		 351 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1759  luciferase-like monooxygenase  25.37 
 
 		 351 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4909  luciferase-like  24.58 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>