More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6477 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 1107 aa  2218    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.46 
 
 		 1874 aa  431  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  47.97 
 
 		 6889 aa  347  8e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7310  monooxygenase  45.89 
 
 		 355 aa  330  1.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3067  Luciferase-like monooxygenase  46.8 
 
 		 408 aa  327  8.000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  34.12 
 
 		 2762 aa  325  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  32.65 
 
 		 1939 aa  319  1e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  42.03 
 
 		 3337 aa  314  4.999999999999999e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  29.72 
 
 		 1909 aa  311  6.999999999999999e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2402  amino acid adenylation  42.18 
 
 		 1519 aa  294  8e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  33.49 
 
 		 1559 aa  291  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3066  MCP methyltransferase, CheR-type  46.55 
 
 		 4483 aa  291  5.0000000000000004e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  31.69 
 
 		 2462 aa  288  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  33.33 
 
 		 1559 aa  288  5e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1173  KR domain protein  32.43 
 
 		 1966 aa  287  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0838  amino acid adenylation domain-containing protein  41.67 
 
 		 1541 aa  273  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  34.1 
 
 		 1832 aa  273  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  36.39 
 
 		 3427 aa  272  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  32.89 
 
 		 2333 aa  269  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  32.34 
 
 		 1822 aa  269  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  38.45 
 
 		 3696 aa  267  8e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  32.02 
 
 		 3645 aa  263  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  35.6 
 
 		 3679 aa  263  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  28.92 
 
 		 3111 aa  259  3e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.98 
 
 		 1909 aa  256  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  31.92 
 
 		 2890 aa  256  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  38.4 
 
 		 3702 aa  255  3e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  37.84 
 
 		 3693 aa  255  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  37.84 
 
 		 3693 aa  255  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4744  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 		 491 aa  252  3e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  34.85 
 
 		 4478 aa  251  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  32 
 
 		 3101 aa  250  8e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  38.63 
 
 		 3676 aa  244  6e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4910  Luciferase-like monooxygenase  40.48 
 
 		 372 aa  239  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.805789  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  30.12 
 
 		 1804 aa  233  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1965  amino acid adenylation domain-containing protein  31.4 
 
 		 2439 aa  229  3e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229236 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  39.1 
 
 		 2232 aa  222  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1424  Luciferase-like monooxygenase  34.75 
 
 		 377 aa  220  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  34.39 
 
 		 2880 aa  218  2.9999999999999998e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3391  beta-ketoacyl synthase  29.97 
 
 		 1806 aa  218  7e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.492462  normal  0.298792 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  37.79 
 
 		 2225 aa  216  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  30.36 
 
 		 1827 aa  216  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  35.42 
 
 		 7279 aa  209  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2366  polyketide synthase  38.84 
 
 		 1560 aa  208  4e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  29.84 
 
 		 1805 aa  206  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5919  beta-ketoacyl synthase  33.04 
 
 		 2463 aa  204  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00253672 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2974  6-deoxyerythronolide-B synthase., (Acyl-carrier- protein) S-malonyltransferase  41.27 
 
 		 2719 aa  199  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023824 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  29.85 
 
 		 3930 aa  199  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  36.52 
 
 		 2103 aa  196  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  34.59 
 
 		 3449 aa  194  6e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12946  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsB  28.07 
 
 		 1537 aa  193  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1541  Beta-ketoacyl synthase  35.56 
 
 		 2547 aa  193  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  30.43 
 
 		 1581 aa  192  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  29.4 
 
 		 1580 aa  191  7e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  29.4 
 
 		 1580 aa  191  7e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5920  beta-ketoacyl synthase  33.5 
 
 		 2975 aa  191  8e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0135718 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1007  Beta-ketoacyl synthase  36.72 
 
 		 1974 aa  189  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  29.4 
 
 		 1580 aa  189  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.36 
 
 		 7110 aa  189  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  32.35 
 
 		 1867 aa  187  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12947  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsC  34.96 
 
 		 2188 aa  186  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4951  Beta-ketoacyl synthase  28.44 
 
 		 1835 aa  186  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  40.11 
 
 		 3176 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  31.5 
 
 		 1577 aa  186  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  31.29 
 
 		 1828 aa  185  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  35.59 
 
 		 1593 aa  184  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2136  hypothetical protein  29.13 
 
 		 3781 aa  183  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2111  hypothetical protein  28.99 
 
 		 3780 aa  184  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  30.16 
 
 		 3254 aa  183  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  38.68 
 
 		 2230 aa  183  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  36.61 
 
 		 4183 aa  182  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3921  Beta-ketoacyl synthase-like protein  39.23 
 
 		 2499 aa  181  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.802024 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  31.44 
 
 		 3033 aa  181  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4756  Acyl transferase  32.56 
 
 		 2162 aa  180  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.593906  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  33.4 
 
 		 1955 aa  180  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.61 
 
 		 3092 aa  179  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8815  Polyketide synthase modules and related protein- like protein  35.22 
 
 		 2111 aa  179  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39915  normal  0.217366 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  35.42 
 
 		 2551 aa  179  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  29.51 
 
 		 4882 aa  178  5e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  30.11 
 
 		 7210 aa  177  8e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3395  acyl transferase domain-containing protein  29.38 
 
 		 1823 aa  177  8e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2600  Beta-ketoacyl synthase  33.91 
 
 		 2543 aa  177  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5921  beta-ketoacyl synthase  34.91 
 
 		 2985 aa  174  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0476483 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  32.4 
 
 		 3711 aa  174  6.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  32.22 
 
 		 3158 aa  173  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  29.57 
 
 		 4080 aa  173  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  32.66 
 
 		 5255 aa  173  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2378  amino acid adenylation domain protein  24.17 
 
 		 3695 aa  172  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  31.01 
 
 		 5154 aa  172  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  32.35 
 
 		 1548 aa  171  8e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  35.52 
 
 		 6768 aa  171  9e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2617  Beta-ketoacyl synthase  34.84 
 
 		 2486 aa  170  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12960  polyketide synthase pks1  32.71 
 
 		 1616 aa  170  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3010  polyketide synthase, type I, putative  34.84 
 
 		 2486 aa  170  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12945  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsA  30.58 
 
 		 1876 aa  169  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  28.21 
 
 		 1820 aa  169  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  33.68 
 
 		 1584 aa  167  8e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  39.64 
 
 		 2126 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  32.46 
 
 		 3281 aa  166  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3485  beta-ketoacyl synthase  26.99 
 
 		 1704 aa  165  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19651  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>