More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3067 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3067  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 
408 aa  850    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.8 
 
 
1107 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2402  amino acid adenylation  42.94 
 
 
1519 aa  293  5e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  42.69 
 
 
6889 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  39.07 
 
 
3337 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3066  MCP methyltransferase, CheR-type  43.75 
 
 
4483 aa  281  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7310  monooxygenase  40.94 
 
 
355 aa  270  4e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0838  amino acid adenylation domain-containing protein  41.29 
 
 
1541 aa  257  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4910  Luciferase-like monooxygenase  42.78 
 
 
372 aa  255  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.805789  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1424  Luciferase-like monooxygenase  32.84 
 
 
377 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  25.32 
 
 
355 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  26.32 
 
 
334 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  26.23 
 
 
334 aa  93.6  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  22.22 
 
 
353 aa  93.2  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  34.07 
 
 
344 aa  89.7  9e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  23.64 
 
 
341 aa  89.4  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6547  Luciferase-like monooxygenase  25.93 
 
 
346 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  24.9 
 
 
374 aa  89  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6087  alkanal monooxygenase alpha chain  26.01 
 
 
345 aa  89  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.518252  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  27.9 
 
 
362 aa  89  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 
346 aa  87.8  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  32.97 
 
 
344 aa  86.3  9e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5586  Luciferase-like monooxygenase  25.78 
 
 
346 aa  86.3  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0885387  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4155  luciferase-like  26.93 
 
 
343 aa  85.9  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.455198 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  32.42 
 
 
345 aa  85.9  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  28.66 
 
 
346 aa  84.7  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  22.94 
 
 
352 aa  84.7  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  23.26 
 
 
380 aa  84  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  25.91 
 
 
364 aa  83.6  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6122  luciferase family protein  24.21 
 
 
345 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  24.56 
 
 
333 aa  83.2  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  26.21 
 
 
363 aa  82.8  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  25.29 
 
 
345 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  24.48 
 
 
386 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  30.13 
 
 
352 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  23.45 
 
 
333 aa  80.9  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  30.22 
 
 
358 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3657  Luciferase-like monooxygenase  29.65 
 
 
340 aa  80.9  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3314  monooxygenase  25 
 
 
352 aa  80.9  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  24.52 
 
 
376 aa  80.5  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  24.15 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  24.32 
 
 
346 aa  80.1  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  31.21 
 
 
341 aa  79.7  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  31.8 
 
 
330 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  29.96 
 
 
345 aa  79.7  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  28.16 
 
 
348 aa  78.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2703  Luciferase-like monooxygenase  28.05 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.190412  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  27.11 
 
 
330 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  25.97 
 
 
347 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  25.85 
 
 
347 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4507  luciferase family protein  27.64 
 
 
347 aa  76.6  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.714194 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  24.63 
 
 
346 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  24.63 
 
 
347 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  25.87 
 
 
402 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  24.63 
 
 
346 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  24.69 
 
 
354 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  24.27 
 
 
345 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  26.81 
 
 
364 aa  75.1  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  24.7 
 
 
352 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  26.35 
 
 
358 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2745  luciferase family protein  33.33 
 
 
405 aa  74.7  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266873  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  27.84 
 
 
376 aa  74.3  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  28.39 
 
 
340 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  24.81 
 
 
328 aa  74.3  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  24.2 
 
 
347 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  24.2 
 
 
346 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  28.84 
 
 
359 aa  73.2  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.6 
 
 
372 aa  72.4  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  29.08 
 
 
372 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  23.77 
 
 
355 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  22.8 
 
 
387 aa  71.6  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  25.1 
 
 
354 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  25 
 
 
363 aa  71.2  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  27.62 
 
 
348 aa  71.2  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  24.46 
 
 
365 aa  71.2  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  26.48 
 
 
342 aa  71.2  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6195  luciferase family protein  29.68 
 
 
323 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0105566 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  29.48 
 
 
342 aa  70.5  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  26.13 
 
 
734 aa  70.5  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  27.4 
 
 
377 aa  70.1  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  28.49 
 
 
347 aa  69.7  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  26.21 
 
 
299 aa  69.7  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0010  Luciferase-like monooxygenase  28.17 
 
 
356 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  25.93 
 
 
374 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  28 
 
 
358 aa  68.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3319  luciferase family protein  28.38 
 
 
340 aa  68.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.231946  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3175  Luciferase-like monooxygenase  32.59 
 
 
278 aa  67.8  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012092 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0647  luciferase-like monooxygenase  29.56 
 
 
321 aa  67  0.0000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  29.34 
 
 
294 aa  67  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  26.47 
 
 
361 aa  67  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0819  luciferase-like monooxygenase  29.63 
 
 
349 aa  67  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  23.75 
 
 
329 aa  66.2  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3123  Luciferase-like monooxygenase  25.54 
 
 
354 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729871  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2854  Luciferase-like monooxygenase  26.41 
 
 
353 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0428  oxidoreductase ( coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase)  22.61 
 
 
343 aa  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10971  oxidoreductase  27.31 
 
 
290 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0930752  normal  0.92148 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2367  luciferase family protein  30.24 
 
 
322 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184521  hitchhiker  0.000901573 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  24.11 
 
 
379 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3539  Luciferase-like monooxygenase  27.54 
 
 
378 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0732  luciferase  29.25 
 
 
321 aa  65.1  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>