More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0732 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0732  luciferase  100 
 
 		 321 aa  660    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0647  luciferase-like monooxygenase  99.38 
 
 		 321 aa  656    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03171  putative luciferase (monooxygenase) oxidoreductase protein  57.99 
 
 		 324 aa  349  3e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.208799 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2115  luciferase family protein  53.46 
 
 		 352 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.287313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  31.14 
 
 		 353 aa  112  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0958  luciferase-like  29.25 
 
 		 361 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  31.2 
 
 		 352 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  27.04 
 
 		 360 aa  105  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  30.96 
 
 		 362 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  35.76 
 
 		 331 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  32.34 
 
 		 354 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3467  luciferase family protein  28.66 
 
 		 354 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478174  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  29.59 
 
 		 341 aa  97.4  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  26.47 
 
 		 358 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  33.33 
 
 		 363 aa  96.3  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  25.39 
 
 		 347 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  32.81 
 
 		 372 aa  95.9  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  36.11 
 
 		 358 aa  95.9  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  35.8 
 
 		 330 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  32.7 
 
 		 363 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  32.78 
 
 		 347 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  29.22 
 
 		 327 aa  93.2  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  34.81 
 
 		 345 aa  92.8  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  38.36 
 
 		 362 aa  92  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  33.33 
 
 		 347 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1444  luciferase family protein  34.16 
 
 		 438 aa  92  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588544 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  38.36 
 
 		 362 aa  92  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  28.9 
 
 		 355 aa  91.7  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  33.74 
 
 		 342 aa  90.5  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  32.22 
 
 		 346 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  32.22 
 
 		 346 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  32.22 
 
 		 346 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  29.59 
 
 		 379 aa  89.4  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  29.47 
 
 		 374 aa  87.8  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0573  luciferase family protein  28.69 
 
 		 421 aa  87.8  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  32.18 
 
 		 346 aa  87.4  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7561  putative luciferase-like monooxygenase  25.43 
 
 		 366 aa  87  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  30.77 
 
 		 352 aa  86.7  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  31.64 
 
 		 345 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  31.48 
 
 		 365 aa  85.9  9e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  32.73 
 
 		 345 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  26.32 
 
 		 329 aa  85.5  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1041  luciferase-like protein  29.93 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.655824  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  34.76 
 
 		 342 aa  85.1  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1057  luciferase family protein  29.93 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.191696 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1069  luciferase family protein  29.24 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  26.77 
 
 		 364 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  30.3 
 
 		 347 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  26.41 
 
 		 402 aa  83.2  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  31.45 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  28.44 
 
 		 333 aa  82.4  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5586  Luciferase-like monooxygenase  27.45 
 
 		 346 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0885387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  30.36 
 
 		 380 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  32.05 
 
 		 439 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  28.97 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  33.76 
 
 		 439 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3539  Luciferase-like monooxygenase  27.23 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  29.59 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  29.03 
 
 		 346 aa  79.3  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  29.38 
 
 		 345 aa  79.3  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  31.18 
 
 		 344 aa  79.3  0.00000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6547  Luciferase-like monooxygenase  27.6 
 
 		 346 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  25.46 
 
 		 387 aa  79  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2703  Luciferase-like monooxygenase  29.61 
 
 		 341 aa  78.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.190412  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  28.24 
 
 		 355 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  31.72 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  31.74 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  29.31 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  30.13 
 
 		 436 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  30.13 
 
 		 436 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  30.13 
 
 		 436 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  28.83 
 
 		 354 aa  77  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  28.57 
 
 		 383 aa  77  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6087  alkanal monooxygenase alpha chain  29.68 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.518252  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  28.74 
 
 		 346 aa  75.9  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  30.73 
 
 		 364 aa  75.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  31.87 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2006  Luciferase-like, subgroup  26.07 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.528515  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  28.32 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  28.7 
 
 		 342 aa  75.1  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5748  luciferase family protein  27.22 
 
 		 340 aa  74.3  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  hitchhiker  0.000000000857143 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0277  luciferase-alpha subunit  26.98 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.200385  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  31.91 
 
 		 348 aa  73.9  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  26.74 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  26.18 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2849  alkanal monooxygenase  29.95 
 
 		 341 aa  73.6  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.633126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4155  luciferase-like  28.57 
 
 		 343 aa  73.2  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455198 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1469  luciferase-like  25.12 
 
 		 384 aa  72.4  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  29.7 
 
 		 328 aa  72  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  25.31 
 
 		 382 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2329  Luciferase-like monooxygenase  28.66 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1696  Luciferase-like monooxygenase  40.86 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  23.98 
 
 		 355 aa  70.1  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.68 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  25.57 
 
 		 361 aa  70.1  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  26.42 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2280  luciferase-like monooxygenase  28.74 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101166  normal  0.0450195 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  22.49 
 
 		 371 aa  69.3  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2939  luciferase-like  24.32 
 
 		 368 aa  69.3  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0140506  hitchhiker  0.0000735163 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  35.82 
 
 		 281 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>