More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1793 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  100 
 
 		 362 aa  756    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4006  luciferase-like protein  42.13 
 
 		 364 aa  302  5.000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4156  alkanal monooxygenase  40.85 
 
 		 353 aa  299  6e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215497  normal  0.0257057 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  40.28 
 
 		 371 aa  297  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  38.67 
 
 		 348 aa  246  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  31.8 
 
 		 353 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  29.89 
 
 		 365 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1675  luciferase family protein  27.62 
 
 		 362 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.79214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  29.59 
 
 		 352 aa  126  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  28.36 
 
 		 364 aa  126  6e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  26.78 
 
 		 362 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0962  alkanal monooxygenase alpha chain  29.26 
 
 		 354 aa  122  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.99674  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  26.8 
 
 		 382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  26.11 
 
 		 379 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3635  alkanal monooxygenase  28.32 
 
 		 356 aa  113  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.804009 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  27.6 
 
 		 362 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  27.6 
 
 		 362 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  26.27 
 
 		 355 aa  112  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  30.28 
 
 		 372 aa  109  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  28.16 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  26.53 
 
 		 341 aa  106  5e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  27.72 
 
 		 374 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  27.43 
 
 		 354 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  25.33 
 
 		 387 aa  103  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  26.02 
 
 		 334 aa  102  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  24.51 
 
 		 347 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  24.79 
 
 		 345 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  31.79 
 
 		 334 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  25.61 
 
 		 358 aa  99.8  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  36.17 
 
 		 333 aa  99  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  33.52 
 
 		 363 aa  98.6  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  28.74 
 
 		 352 aa  98.2  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  24.15 
 
 		 347 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  35.46 
 
 		 333 aa  96.3  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  30.59 
 
 		 327 aa  95.9  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  23.96 
 
 		 345 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  25.62 
 
 		 347 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  24.8 
 
 		 383 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  24.29 
 
 		 346 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  24.29 
 
 		 346 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6122  luciferase family protein  24.65 
 
 		 345 aa  94.4  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6547  Luciferase-like monooxygenase  25.84 
 
 		 346 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  29.23 
 
 		 329 aa  94.4  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  28.11 
 
 		 345 aa  93.6  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5586  Luciferase-like monooxygenase  24.93 
 
 		 346 aa  93.6  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0885387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  23.58 
 
 		 352 aa  92.8  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  24.01 
 
 		 346 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  24.44 
 
 		 346 aa  91.3  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  31.77 
 
 		 345 aa  91.3  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  23.12 
 
 		 355 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  29.68 
 
 		 380 aa  91.3  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  27.49 
 
 		 439 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  24.86 
 
 		 376 aa  89.7  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  28.28 
 
 		 439 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  27.14 
 
 		 342 aa  89.7  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  29.74 
 
 		 341 aa  89.7  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6087  alkanal monooxygenase alpha chain  25.77 
 
 		 345 aa  89  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.518252  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  22.5 
 
 		 363 aa  89  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  22.16 
 
 		 358 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  31.55 
 
 		 355 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  26.74 
 
 		 343 aa  88.2  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  28.23 
 
 		 330 aa  87.8  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  26.55 
 
 		 436 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  27.44 
 
 		 328 aa  87.8  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  26.55 
 
 		 436 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  26.55 
 
 		 436 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  25 
 
 		 415 aa  85.5  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1236  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  27.87 
 
 		 323 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.282844  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  29.69 
 
 		 346 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7675  putative alkanal monooxygenase (FMN-linked) (luciferase-related)  39.42 
 
 		 413 aa  84.3  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  26.14 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  23.88 
 
 		 347 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1941  luciferase family protein  21.47 
 
 		 351 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1925  luciferase family protein  29.52 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  30.57 
 
 		 386 aa  83.2  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2020  luciferase family protein  21.47 
 
 		 351 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.123786  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  30.73 
 
 		 344 aa  82.8  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4429  luciferase family protein  28.64 
 
 		 388 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7516  putative alkanal monooxygenase  25.41 
 
 		 345 aa  82.8  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  30.36 
 
 		 343 aa  82.4  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1977  luciferase family protein  21.58 
 
 		 352 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94437e-17 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  24.63 
 
 		 345 aa  82  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  44.94 
 
 		 344 aa  82.8  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  24.27 
 
 		 331 aa  82  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1776  luciferase-like monooxygenase  21.58 
 
 		 351 aa  82  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1759  luciferase-like monooxygenase  21.58 
 
 		 351 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3721  luciferase-like  23.03 
 
 		 389 aa  81.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1646  luciferase family protein  23.42 
 
 		 405 aa  81.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9288  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  26.76 
 
 		 356 aa  80.9  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.862144 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  24.11 
 
 		 354 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  30.06 
 
 		 347 aa  80.5  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8768  Luciferase-like monooxygenase  51.14 
 
 		 375 aa  80.5  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.463122 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3387  luciferase family protein  23.01 
 
 		 351 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.351449  hitchhiker  0.000000000482857 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5158  luciferase family protein  36.11 
 
 		 396 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6195  luciferase family protein  25.84 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0105566 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2115  luciferase family protein  34.85 
 
 		 352 aa  80.1  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.287313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  25.93 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4772  luciferase-like protein  36.11 
 
 		 396 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13649  monooxygenase  35.21 
 
 		 395 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.486849  hitchhiker  0.000284766 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4858  luciferase family protein  36.11 
 
 		 396 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>