More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4858 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13649  monooxygenase  82.99 
 
 
395 aa  660    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.486849  hitchhiker  0.000284766 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4772  luciferase-like protein  100 
 
 
396 aa  814    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4858  luciferase family protein  100 
 
 
396 aa  814    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5158  luciferase family protein  98.23 
 
 
396 aa  803    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4429  luciferase family protein  52.06 
 
 
388 aa  380  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1925  luciferase family protein  51.81 
 
 
387 aa  376  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32143  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1646  luciferase family protein  48.46 
 
 
405 aa  373  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2267  Luciferase-like, subgroup  50.14 
 
 
391 aa  343  4e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3721  luciferase-like  44.44 
 
 
389 aa  334  2e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7675  putative alkanal monooxygenase (FMN-linked) (luciferase-related)  42.67 
 
 
413 aa  296  5e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7561  putative luciferase-like monooxygenase  32.53 
 
 
366 aa  169  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4004  luciferase family protein  31.35 
 
 
369 aa  159  7e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12574  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11965  monooxygenase  31.65 
 
 
369 aa  159  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.234651  normal  0.884377 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0852  luciferase family protein  31.35 
 
 
365 aa  152  8e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2939  luciferase-like  29.44 
 
 
368 aa  138  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0140506  hitchhiker  0.0000735163 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0203  luciferase family protein  29.8 
 
 
362 aa  134  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.444678  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0220  luciferase family protein  27.46 
 
 
360 aa  133  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  39.01 
 
 
355 aa  113  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  27.53 
 
 
374 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  29.51 
 
 
362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  35.82 
 
 
380 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  27.65 
 
 
439 aa  102  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  28.82 
 
 
415 aa  102  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  27.2 
 
 
353 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  29.46 
 
 
365 aa  100  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  29.81 
 
 
346 aa  100  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0522  luciferase-like  25.59 
 
 
374 aa  99  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  27.06 
 
 
436 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  27.06 
 
 
436 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  27.06 
 
 
436 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  27.35 
 
 
439 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  36.63 
 
 
364 aa  95.5  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  30.45 
 
 
344 aa  91.3  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  28.3 
 
 
345 aa  90.5  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  27.65 
 
 
379 aa  90.9  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  30.45 
 
 
352 aa  89.7  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  34.25 
 
 
344 aa  88.6  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  26.93 
 
 
331 aa  87.4  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  26.18 
 
 
383 aa  86.7  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1468  luciferase-like  24.64 
 
 
366 aa  86.7  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.839714  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  28.45 
 
 
348 aa  85.9  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  25.35 
 
 
382 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  31.25 
 
 
377 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  31.28 
 
 
362 aa  84.7  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  31.28 
 
 
362 aa  84.7  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  25.49 
 
 
387 aa  85.1  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 
334 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 
334 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.966319 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  27.89 
 
 
341 aa  84  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  40.35 
 
 
372 aa  83.6  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  36.07 
 
 
343 aa  83.2  0.000000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  25.15 
 
 
371 aa  82.8  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  25.83 
 
 
347 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  27.73 
 
 
372 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  26.35 
 
 
345 aa  80.9  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  29.5 
 
 
329 aa  80.9  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  27.48 
 
 
352 aa  80.5  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  28.05 
 
 
348 aa  80.5  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  26.44 
 
 
358 aa  79.7  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  36.11 
 
 
362 aa  79.7  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  29.27 
 
 
327 aa  79.3  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  27.89 
 
 
354 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  26.99 
 
 
346 aa  77  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  32.11 
 
 
352 aa  77.4  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07710  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  44.09 
 
 
322 aa  77.4  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  29.03 
 
 
347 aa  77  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2745  luciferase family protein  37.39 
 
 
405 aa  77  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266873  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  33.1 
 
 
333 aa  77  0.0000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  25.64 
 
 
328 aa  76.6  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1979  Luciferase-like monooxygenase  32.57 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132329  normal  0.747602 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  25.86 
 
 
348 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  38.05 
 
 
333 aa  74.7  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  27.62 
 
 
363 aa  74.7  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1671  luciferase family protein  39.82 
 
 
315 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1589  luciferase-like monooxygenase  39.82 
 
 
315 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0182  luciferase-like monooxygenase  39.82 
 
 
336 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  31.46 
 
 
330 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  23.05 
 
 
376 aa  73.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  26.57 
 
 
347 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3539  Luciferase-like monooxygenase  25.19 
 
 
378 aa  73.2  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  27.24 
 
 
340 aa  73.2  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  30.08 
 
 
402 aa  73.2  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  30.46 
 
 
386 aa  73.2  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  24.16 
 
 
336 aa  72.8  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4929  Luciferase-like monooxygenase  42.27 
 
 
341 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.164106  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  31.43 
 
 
6889 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  26.59 
 
 
347 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  24.36 
 
 
358 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  30.07 
 
 
329 aa  72.4  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  24.93 
 
 
365 aa  72.8  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1217  luciferase family protein  38.94 
 
 
315 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1696  Luciferase-like monooxygenase  37.07 
 
 
325 aa  71.6  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  27.62 
 
 
343 aa  71.2  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1881  luciferase family oxidoreductase, group 1  40.86 
 
 
323 aa  71.2  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.797974  normal  0.396374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9288  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  24.26 
 
 
356 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.862144 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  35.96 
 
 
341 aa  70.5  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0573  luciferase family protein  24.55 
 
 
421 aa  70.1  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6195  luciferase family protein  22.96 
 
 
323 aa  70.1  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0105566 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0277  luciferase-alpha subunit  30.28 
 
 
315 aa  69.7  0.00000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.200385  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4131  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.59 
 
 
289 aa  69.7  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  0.0404326 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>