More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_05590 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  100 
 
 
372 aa  711    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2745  luciferase family protein  69.39 
 
 
405 aa  425  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266873  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  58.91 
 
 
344 aa  351  1e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  58.01 
 
 
344 aa  344  1e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  57.67 
 
 
376 aa  342  5e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  57.19 
 
 
345 aa  335  5e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  56.42 
 
 
346 aa  334  1e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  55.29 
 
 
348 aa  329  5.0000000000000004e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  56.97 
 
 
341 aa  328  9e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  55.02 
 
 
348 aa  319  3.9999999999999996e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  52.68 
 
 
347 aa  310  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  50.3 
 
 
343 aa  297  3e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  42.29 
 
 
362 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0398  putative luciferase-like monooxygenase  31.93 
 
 
346 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  32.46 
 
 
342 aa  107  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  42.75 
 
 
364 aa  106  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  43.97 
 
 
374 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2397  Luciferase-like monooxygenase  33.75 
 
 
341 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4358  luciferase family protein  32.04 
 
 
342 aa  100  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608083  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3232  Luciferase-like monooxygenase  30.15 
 
 
344 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2323  Luciferase-like, subgroup  31.38 
 
 
338 aa  96.3  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708828  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  42.4 
 
 
334 aa  96.3  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  42.4 
 
 
334 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7208  monooxygenase  33.22 
 
 
341 aa  94  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.841094  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7327  flavin-dependent oxidoreductase  31.33 
 
 
372 aa  93.6  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  39.72 
 
 
364 aa  93.6  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  28.21 
 
 
341 aa  93.2  6e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2168  Luciferase-like monooxygenase  35.93 
 
 
338 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319006  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3758  luciferase family protein  30.43 
 
 
361 aa  92  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  38.6 
 
 
355 aa  90.5  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  38.73 
 
 
362 aa  90.5  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  29.36 
 
 
345 aa  90.5  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  38.73 
 
 
362 aa  90.5  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3446  luciferase family protein  31.98 
 
 
341 aa  90.1  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.922588  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2848  Luciferase-like monooxygenase  32.38 
 
 
341 aa  89.7  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5208  monooxygenase  30.56 
 
 
359 aa  89.7  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0275727  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2543  Luciferase-like monooxygenase  30.26 
 
 
350 aa  89.4  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000264716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4330  Luciferase-like monooxygenase  30.5 
 
 
341 aa  89.4  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.619439  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1492  Luciferase-like, subgroup  29.54 
 
 
345 aa  88.2  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  32.28 
 
 
380 aa  88.6  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5180  monooxygenase  30.36 
 
 
361 aa  87.8  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30900  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.57 
 
 
354 aa  87.4  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.796008  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3005  luciferase family protein  29.43 
 
 
338 aa  87  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  39.32 
 
 
439 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  34.17 
 
 
402 aa  86.7  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3764  luciferase family protein  31.94 
 
 
381 aa  86.3  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.269499  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  44.07 
 
 
352 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2931  luciferase family protein  34.15 
 
 
348 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  39.04 
 
 
327 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  39.32 
 
 
439 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  39.32 
 
 
436 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  39.32 
 
 
436 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  39.32 
 
 
436 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0448  Luciferase-like protein  31.91 
 
 
340 aa  84.3  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2367  luciferase family protein  42.98 
 
 
322 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184521  hitchhiker  0.000901573 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  36.46 
 
 
329 aa  84.7  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4772  luciferase-like protein  40.35 
 
 
396 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2676  Luciferase-like monooxygenase  29.97 
 
 
340 aa  84  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0559319  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4858  luciferase family protein  40.35 
 
 
396 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5567  Luciferase-like monooxygenase  30.82 
 
 
344 aa  84  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638626  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5158  luciferase family protein  40.35 
 
 
396 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0868  luciferase family protein  33.05 
 
 
340 aa  84  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5641  luciferase family protein  42.28 
 
 
327 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2353  Luciferase-like monooxygenase  30 
 
 
340 aa  83.2  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0651216  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5909  luciferase-like  41.96 
 
 
342 aa  82.8  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13649  monooxygenase  39.13 
 
 
395 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.486849  hitchhiker  0.000284766 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3622  Luciferase-like monooxygenase  34.7 
 
 
342 aa  82.8  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2485  hypothetical protein  41.46 
 
 
327 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0221825  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03180  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.76 
 
 
340 aa  82  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  34.04 
 
 
353 aa  82  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1423  luciferase-like protein  30.74 
 
 
341 aa  82  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1952  luciferase family protein  33.12 
 
 
343 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2486  Luciferase-like monooxygenase  29.18 
 
 
367 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000818407 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0613  luciferase-like protein  29.25 
 
 
350 aa  81.6  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  32.27 
 
 
328 aa  81.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  37.5 
 
 
365 aa  81.6  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_004310  BR2051  luciferase family protein  32.62 
 
 
340 aa  80.9  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1973  luciferase family protein  32.62 
 
 
340 aa  81.3  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123864  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  39.64 
 
 
365 aa  80.5  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3121  luciferase family protein  31.74 
 
 
340 aa  80.9  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  31.4 
 
 
342 aa  80.5  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4485  luciferase-like  31.15 
 
 
340 aa  80.5  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  28.91 
 
 
329 aa  80.1  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  34.25 
 
 
386 aa  80.1  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2850  Luciferase-like monooxygenase  31.67 
 
 
341 aa  80.5  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000200599  normal  0.039851 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  45.05 
 
 
333 aa  80.1  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1981  luciferase family protein  41.38 
 
 
327 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.960936  hitchhiker  0.00581741 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0277  luciferase-alpha subunit  36.09 
 
 
315 aa  79.7  0.00000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.200385  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3415  luciferase family protein  29.17 
 
 
337 aa  79.7  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.462422  normal  0.0975768 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6195  luciferase family protein  40 
 
 
323 aa  79.7  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0105566 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  39.85 
 
 
377 aa  79.7  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  40.91 
 
 
371 aa  79.3  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0326  luciferase family protein  29.75 
 
 
344 aa  79.3  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3623  luciferase family protein  36.08 
 
 
319 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.378915 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1985  Luciferase-like, subgroup  29.94 
 
 
331 aa  79  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2188  flavin-dependent oxidoreductase  36.08 
 
 
319 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.182489  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4462  luciferase-like  36.08 
 
 
319 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.119072  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  35.59 
 
 
383 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3904  luciferase family protein  36.08 
 
 
319 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  30.91 
 
 
352 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>