More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3622 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3622  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 
342 aa  681    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49090  hypothetical protein  71.09 
 
 
339 aa  474  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00002313 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4193  hypothetical protein  70.5 
 
 
339 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3318  luciferase family protein  68.73 
 
 
346 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2814  Luciferase-like monooxygenase  44.41 
 
 
314 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2367  luciferase family protein  43.08 
 
 
322 aa  265  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184521  hitchhiker  0.000901573 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3185  luciferase family protein  42.24 
 
 
317 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3436  luciferase family protein  42.24 
 
 
317 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3417  luciferase family protein  41.93 
 
 
320 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3086  luciferase family protein (alkanal monooxygenase, FMN-linked)  41.93 
 
 
317 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1694  luciferase family protein  42.41 
 
 
334 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3167  luciferase family protein (alkanal monooxygenase (FMN-linked))  41.93 
 
 
317 aa  252  6e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.282639  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3405  luciferase family protein  41.93 
 
 
317 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01680  hypothetical protein  43.53 
 
 
319 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5909  luciferase-like  40.49 
 
 
342 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0572  Luciferase-like monooxygenase  41.18 
 
 
316 aa  242  6e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5641  luciferase family protein  40.25 
 
 
327 aa  241  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2485  hypothetical protein  39.63 
 
 
327 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0221825  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1981  luciferase family protein  38.34 
 
 
327 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.960936  hitchhiker  0.00581741 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10203  hypothetical protein  38.87 
 
 
316 aa  232  9e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0230  luciferase family protein  40.98 
 
 
359 aa  229  4e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1816  luciferase family protein  43.17 
 
 
313 aa  228  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00324647  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0758  luciferase family protein  39.56 
 
 
319 aa  223  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.556053  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1559  luciferase  37.81 
 
 
322 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179064 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4731  Luciferase-like monooxygenase  38.18 
 
 
335 aa  216  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329388  normal  0.73766 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3198  bacterial luciferase family protein  37.5 
 
 
328 aa  212  9e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339171  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3064  luciferase  37.23 
 
 
325 aa  209  6e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.666797  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0001  Luciferase-like monooxygenase  37.74 
 
 
304 aa  209  6e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4859  luciferase family protein  41.98 
 
 
316 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5451  luciferase-like  41.98 
 
 
316 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5411  luciferase family protein  41.98 
 
 
316 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.841448  decreased coverage  0.00286902 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3382  luciferase-type oxidoreductase  39.5 
 
 
307 aa  195  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5297  luciferase-like monooxygenase  42.12 
 
 
316 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.564159 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7093  luciferase family protein  36.28 
 
 
340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4752  luciferase family protein  41.64 
 
 
316 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110568  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5288  luciferase family protein  38.36 
 
 
313 aa  187  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537455  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02793  monooxygenase  39.11 
 
 
302 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2279  Luciferase-like monooxygenase  39.56 
 
 
311 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.463796  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1334  luciferase-type oxidoreductase  37.19 
 
 
306 aa  182  6e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2188  flavin-dependent oxidoreductase  36.83 
 
 
319 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.182489  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3798  luciferase-like monooxygenase  37.35 
 
 
319 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0928  putative luciferase-like monooxygenase  37.42 
 
 
325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.187538  normal  0.76333 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4462  luciferase-like  37.15 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.119072  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3904  luciferase family protein  37.15 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3623  luciferase family protein  37.15 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.378915 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3279  luciferase family protein  36.62 
 
 
321 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2282  Luciferase-like monooxygenase  40.43 
 
 
312 aa  172  6.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0554594  normal  0.109814 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4654  Luciferase-like monooxygenase  37.58 
 
 
326 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.334317  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5536  luciferase family protein  38.36 
 
 
313 aa  169  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0197176 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4679  luciferase family protein  37.42 
 
 
319 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  33.67 
 
 
272 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  37.91 
 
 
346 aa  84  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.7 
 
 
372 aa  82.8  0.000000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4569  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.44 
 
 
288 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.658744  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4400  Luciferase-like monooxygenase  27.52 
 
 
286 aa  80.5  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  35.21 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  35.21 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  35.21 
 
 
283 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4099  luciferase-like protein  26.67 
 
 
334 aa  79.3  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  31.82 
 
 
353 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  44.68 
 
 
352 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  37.7 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  33.16 
 
 
334 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.66 
 
 
273 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  29.88 
 
 
344 aa  77.8  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  35.2 
 
 
362 aa  77  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  34.07 
 
 
334 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  27.68 
 
 
327 aa  76.6  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3368  luciferase family protein  32.6 
 
 
278 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852738  normal  0.168989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  27.49 
 
 
293 aa  76.3  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  29.84 
 
 
305 aa  75.9  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  39.25 
 
 
344 aa  75.9  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  36.81 
 
 
288 aa  75.9  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  33.95 
 
 
324 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  29.96 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  29.91 
 
 
376 aa  73.2  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  37.38 
 
 
345 aa  72.8  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1645  luciferase family protein  30.51 
 
 
315 aa  72.8  0.000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4419  Luciferase-like, subgroup  26.59 
 
 
311 aa  72.8  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  31.32 
 
 
335 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  36.45 
 
 
346 aa  72.4  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  28.53 
 
 
310 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.29 
 
 
314 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4850  hypothetical protein  38.24 
 
 
347 aa  72  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.401256 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  43.96 
 
 
281 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2848  Luciferase-like monooxygenase  32.91 
 
 
306 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2183  Luciferase-like monooxygenase  35.33 
 
 
289 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4544  luciferase family protein  34.08 
 
 
282 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.178601 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0594  luciferase-like protein  35.03 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4864  luciferase family protein  33.33 
 
 
282 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0725656  normal  0.117116 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1871  luciferase family protein  31.19 
 
 
301 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0338781 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  38.02 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  35.2 
 
 
348 aa  70.1  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1199  luciferase family protein  37.09 
 
 
281 aa  70.1  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  35.08 
 
 
278 aa  70.1  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1787  oxidoreductase  27.86 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.737797  normal  0.187733 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  26.58 
 
 
342 aa  69.7  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3175  Luciferase-like monooxygenase  37.23 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012092 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  28.26 
 
 
291 aa  69.7  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4069  luciferase-like protein  29.2 
 
 
339 aa  69.3  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.436291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>