More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3279 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3279  luciferase family protein  100 
 
 		 321 aa  632  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3798  luciferase-like monooxygenase  97.81 
 
 		 319 aa  616  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2188  flavin-dependent oxidoreductase  88.05 
 
 		 319 aa  551  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4462  luciferase-like  85.53 
 
 		 319 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.119072  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3904  luciferase family protein  85.53 
 
 		 319 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3623  luciferase family protein  85.53 
 
 		 319 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.378915 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4679  luciferase family protein  80.95 
 
 		 319 aa  496  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0928  putative luciferase-like monooxygenase  71.7 
 
 		 325 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.187538  normal  0.76333 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4654  Luciferase-like monooxygenase  72.13 
 
 		 326 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.334317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5536  luciferase family protein  72.31 
 
 		 313 aa  423  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0197176 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5288  luciferase family protein  52.4 
 
 		 313 aa  280  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537455  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_003296  RS01680  hypothetical protein  44.98 
 
 		 319 aa  226  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2279  Luciferase-like monooxygenase  44.69 
 
 		 311 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.463796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2367  luciferase family protein  40.33 
 
 		 322 aa  210  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184521  hitchhiker  0.000901573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1981  luciferase family protein  38.44 
 
 		 327 aa  208  9e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.960936  hitchhiker  0.00581741 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1816  luciferase family protein  39.74 
 
 		 313 aa  196  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00324647  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2485  hypothetical protein  36.93 
 
 		 327 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0221825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2814  Luciferase-like monooxygenase  37.34 
 
 		 314 aa  193  4e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3198  bacterial luciferase family protein  40.26 
 
 		 328 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339171  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5641  luciferase family protein  37.25 
 
 		 327 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3064  luciferase  38.87 
 
 		 325 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.666797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49090  hypothetical protein  41.98 
 
 		 339 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002313 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5909  luciferase-like  36.54 
 
 		 342 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0572  Luciferase-like monooxygenase  36.77 
 
 		 316 aa  182  7e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4193  hypothetical protein  39.94 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1694  luciferase family protein  38.14 
 
 		 334 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0001  Luciferase-like monooxygenase  33.66 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3622  Luciferase-like monooxygenase  36.62 
 
 		 342 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3086  luciferase family protein (alkanal monooxygenase, FMN-linked)  34.1 
 
 		 317 aa  170  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3417  luciferase family protein  33.77 
 
 		 320 aa  169  7e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3167  luciferase family protein (alkanal monooxygenase (FMN-linked))  33.77 
 
 		 317 aa  168  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.282639  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3185  luciferase family protein  33.44 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3436  luciferase family protein  33.44 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3405  luciferase family protein  33.77 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4731  Luciferase-like monooxygenase  35.14 
 
 		 335 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329388  normal  0.73766 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10203  hypothetical protein  31.38 
 
 		 316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0758  luciferase family protein  36.89 
 
 		 319 aa  162  6e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.556053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3318  luciferase family protein  33.96 
 
 		 346 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7093  luciferase family protein  35.24 
 
 		 340 aa  159  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02793  monooxygenase  33.01 
 
 		 302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2282  Luciferase-like monooxygenase  36.05 
 
 		 312 aa  152  7e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0554594  normal  0.109814 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1559  luciferase  34.91 
 
 		 322 aa  149  9e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179064 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4859  luciferase family protein  37.28 
 
 		 316 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5451  luciferase-like  37.28 
 
 		 316 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5411  luciferase family protein  37.28 
 
 		 316 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.841448  decreased coverage  0.00286902 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4752  luciferase family protein  37.01 
 
 		 316 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110568  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3382  luciferase-type oxidoreductase  31.69 
 
 		 307 aa  144  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1334  luciferase-type oxidoreductase  32.5 
 
 		 306 aa  143  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5297  luciferase-like monooxygenase  36.3 
 
 		 316 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564159 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0230  luciferase family protein  38.05 
 
 		 359 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  36.29 
 
 		 362 aa  80.1  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.44 
 
 		 372 aa  78.6  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  38.89 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4099  luciferase-like protein  27.8 
 
 		 334 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  38.06 
 
 		 345 aa  75.5  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  38.32 
 
 		 352 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  40.91 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  40.87 
 
 		 341 aa  72.8  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  38.94 
 
 		 344 aa  72.8  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  29.05 
 
 		 364 aa  72.4  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  34.51 
 
 		 328 aa  71.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  37.39 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  26.64 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  28.83 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  38.05 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  39.09 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  39.09 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4450  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  37.91 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.743649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  35.45 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  34.36 
 
 		 324 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  34.09 
 
 		 348 aa  68.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10971  oxidoreductase  32.37 
 
 		 290 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0930752  normal  0.92148 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  30.45 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  32.24 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  34.62 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  35 
 
 		 376 aa  67  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4324  luciferase-like protein  32.29 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4410  luciferase family protein  32.29 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  37.3 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4704  luciferase family protein  32.29 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.405552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0709  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  31.13 
 
 		 382 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2867  putative F420-dependent oxidoreductase  33.58 
 
 		 311 aa  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3368  luciferase family protein  41.35 
 
 		 278 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852738  normal  0.168989 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  32.58 
 
 		 353 aa  65.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  34.19 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  37.9 
 
 		 272 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0454  Luciferase-like monooxygenase  28.65 
 
 		 322 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4444  Luciferase-like, subgroup  32.73 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155072  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  44.94 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4864  luciferase family protein  32.11 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0725656  normal  0.117116 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2015  luciferase family protein  40.2 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212649  normal  0.512168 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2346  luciferase family protein  34.59 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0184001 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  39.32 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  32.63 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4569  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.59 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.658744  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1926  hypothetical protein  30.61 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  31.79 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7675  putative alkanal monooxygenase (FMN-linked) (luciferase-related)  31.62 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2248  luciferase family protein  32.48 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>