More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10203 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_10203  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  654    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5909  luciferase-like  45.66 
 
 
342 aa  286  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2485  hypothetical protein  44.34 
 
 
327 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0221825  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2814  Luciferase-like monooxygenase  44.03 
 
 
314 aa  276  4e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5641  luciferase family protein  43.69 
 
 
327 aa  275  8e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0572  Luciferase-like monooxygenase  46.98 
 
 
316 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3417  luciferase family protein  44.55 
 
 
320 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3185  luciferase family protein  45.16 
 
 
317 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3086  luciferase family protein (alkanal monooxygenase, FMN-linked)  45.16 
 
 
317 aa  270  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3436  luciferase family protein  45.16 
 
 
317 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3167  luciferase family protein (alkanal monooxygenase (FMN-linked))  44.84 
 
 
317 aa  268  7e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.282639  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3405  luciferase family protein  44.52 
 
 
317 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2367  luciferase family protein  42.35 
 
 
322 aa  266  4e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184521  hitchhiker  0.000901573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1981  luciferase family protein  41.61 
 
 
327 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.960936  hitchhiker  0.00581741 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1694  luciferase family protein  42.26 
 
 
334 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3382  luciferase-type oxidoreductase  40.26 
 
 
307 aa  246  4e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0001  Luciferase-like monooxygenase  41.39 
 
 
304 aa  241  7.999999999999999e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1816  luciferase family protein  39.16 
 
 
313 aa  241  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00324647  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01680  hypothetical protein  39.61 
 
 
319 aa  237  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0758  luciferase family protein  37.1 
 
 
319 aa  236  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.556053  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1334  luciferase-type oxidoreductase  39.41 
 
 
306 aa  236  4e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3318  luciferase family protein  39.62 
 
 
346 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4731  Luciferase-like monooxygenase  38.51 
 
 
335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329388  normal  0.73766 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3198  bacterial luciferase family protein  37.86 
 
 
328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339171  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2282  Luciferase-like monooxygenase  39.79 
 
 
312 aa  232  5e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0554594  normal  0.109814 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3622  Luciferase-like monooxygenase  38.87 
 
 
342 aa  232  8.000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4193  hypothetical protein  38.29 
 
 
339 aa  225  7e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49090  hypothetical protein  38.54 
 
 
339 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00002313 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1559  luciferase  35.37 
 
 
322 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179064 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7093  luciferase family protein  36.94 
 
 
340 aa  220  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0230  luciferase family protein  37.62 
 
 
359 aa  218  7.999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3064  luciferase  36.81 
 
 
325 aa  216  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.666797  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5297  luciferase-like monooxygenase  38.19 
 
 
316 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.564159 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2279  Luciferase-like monooxygenase  36.45 
 
 
311 aa  210  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.463796  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4752  luciferase family protein  37.86 
 
 
316 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110568  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4859  luciferase family protein  38.93 
 
 
316 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5451  luciferase-like  38.93 
 
 
316 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5411  luciferase family protein  38.93 
 
 
316 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.841448  decreased coverage  0.00286902 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02793  monooxygenase  34.31 
 
 
302 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5288  luciferase family protein  35.13 
 
 
313 aa  198  7.999999999999999e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537455  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0928  putative luciferase-like monooxygenase  33.23 
 
 
325 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.187538  normal  0.76333 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4654  Luciferase-like monooxygenase  34.59 
 
 
326 aa  182  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.334317  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2188  flavin-dependent oxidoreductase  33.12 
 
 
319 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.182489  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4679  luciferase family protein  32.68 
 
 
319 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4462  luciferase-like  33.01 
 
 
319 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.119072  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3904  luciferase family protein  33.01 
 
 
319 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3623  luciferase family protein  33.01 
 
 
319 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.378915 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5536  luciferase family protein  32.72 
 
 
313 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0197176 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3798  luciferase-like monooxygenase  31.37 
 
 
319 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3279  luciferase family protein  31.38 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  35.21 
 
 
283 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  35.21 
 
 
283 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  35.21 
 
 
283 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  31.28 
 
 
307 aa  89  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3368  luciferase family protein  32.04 
 
 
278 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852738  normal  0.168989 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  29.36 
 
 
346 aa  86.7  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4569  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.54 
 
 
288 aa  86.3  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.658744  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  26.7 
 
 
335 aa  85.9  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.57 
 
 
273 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  28.86 
 
 
327 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  27.73 
 
 
333 aa  84.7  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  25.54 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  27.8 
 
 
333 aa  84  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4544  luciferase family protein  36.05 
 
 
282 aa  82.4  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.178601 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  30.05 
 
 
278 aa  82  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  31.28 
 
 
288 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  28.57 
 
 
305 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  29.55 
 
 
342 aa  80.5  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2400  Luciferase-like monooxygenase  28.63 
 
 
285 aa  80.5  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4419  Luciferase-like, subgroup  25.42 
 
 
311 aa  80.1  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  25.69 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  28.14 
 
 
298 aa  79.7  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  31.47 
 
 
272 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  26.47 
 
 
335 aa  79  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2183  Luciferase-like monooxygenase  27.05 
 
 
289 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4400  Luciferase-like monooxygenase  27.22 
 
 
286 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10971  oxidoreductase  29.19 
 
 
290 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0930752  normal  0.92148 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4324  luciferase-like protein  29.74 
 
 
282 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4410  luciferase family protein  29.74 
 
 
282 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287539  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4704  luciferase family protein  29.74 
 
 
282 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.405552  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  25.97 
 
 
294 aa  77  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  34.65 
 
 
346 aa  77  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4864  luciferase family protein  28.21 
 
 
282 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0725656  normal  0.117116 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  30.77 
 
 
345 aa  75.9  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  28.88 
 
 
308 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  28.3 
 
 
353 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  28.88 
 
 
308 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  22.47 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  31.21 
 
 
324 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  30 
 
 
293 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18420  hypothetical protein  39 
 
 
106 aa  75.1  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2334  Luciferase-like monooxygenase  32.69 
 
 
304 aa  74.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2248  luciferase family protein  36.21 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  30 
 
 
362 aa  73.9  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  22.81 
 
 
314 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  32.76 
 
 
344 aa  74.3  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4138  luciferase-like protein  23.24 
 
 
353 aa  73.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  32.76 
 
 
344 aa  73.6  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.33 
 
 
372 aa  73.9  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3175  Luciferase-like monooxygenase  30.41 
 
 
278 aa  73.9  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>