More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3198 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3198  bacterial luciferase family protein  100 
 
 		 328 aa  679    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339171  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3064  luciferase  78.88 
 
 		 325 aa  543  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.666797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0758  luciferase family protein  62.09 
 
 		 319 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.556053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1694  luciferase family protein  59.62 
 
 		 334 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1559  luciferase  50.8 
 
 		 322 aa  350  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179064 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0230  luciferase family protein  53.9 
 
 		 359 aa  329  3e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7093  luciferase family protein  45.11 
 
 		 340 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4731  Luciferase-like monooxygenase  45.69 
 
 		 335 aa  280  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329388  normal  0.73766 
 
 
-
 
NC_003296  RS01680  hypothetical protein  45.25 
 
 		 319 aa  269  4e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2814  Luciferase-like monooxygenase  40.69 
 
 		 314 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2367  luciferase family protein  43.18 
 
 		 322 aa  248  9e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184521  hitchhiker  0.000901573 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0572  Luciferase-like monooxygenase  42.27 
 
 		 316 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5909  luciferase-like  41.46 
 
 		 342 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5641  luciferase family protein  40.65 
 
 		 327 aa  236  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2485  hypothetical protein  40.65 
 
 		 327 aa  235  7e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0221825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1981  luciferase family protein  41.35 
 
 		 327 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.960936  hitchhiker  0.00581741 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10203  hypothetical protein  37.86 
 
 		 316 aa  234  2.0000000000000002e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1816  luciferase family protein  43.37 
 
 		 313 aa  231  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00324647  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0001  Luciferase-like monooxygenase  38.8 
 
 		 304 aa  222  7e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4193  hypothetical protein  39.94 
 
 		 339 aa  222  7e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49090  hypothetical protein  40.56 
 
 		 339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002313 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3318  luciferase family protein  38.04 
 
 		 346 aa  215  9e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3417  luciferase family protein  38.75 
 
 		 320 aa  215  9e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3185  luciferase family protein  38.56 
 
 		 317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3086  luciferase family protein (alkanal monooxygenase, FMN-linked)  38.87 
 
 		 317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3436  luciferase family protein  38.56 
 
 		 317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3622  Luciferase-like monooxygenase  37.5 
 
 		 342 aa  212  7.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3167  luciferase family protein (alkanal monooxygenase (FMN-linked))  38.56 
 
 		 317 aa  211  9e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.282639  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3405  luciferase family protein  38.24 
 
 		 317 aa  210  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3279  luciferase family protein  40.26 
 
 		 321 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3798  luciferase-like monooxygenase  39.67 
 
 		 319 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2279  Luciferase-like monooxygenase  38.59 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.463796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3382  luciferase-type oxidoreductase  36.48 
 
 		 307 aa  186  4e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1334  luciferase-type oxidoreductase  37.19 
 
 		 306 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02793  monooxygenase  36.43 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5297  luciferase-like monooxygenase  39.43 
 
 		 316 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564159 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4752  luciferase family protein  39.07 
 
 		 316 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110568  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0928  putative luciferase-like monooxygenase  37.61 
 
 		 325 aa  182  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.187538  normal  0.76333 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4462  luciferase-like  38.03 
 
 		 319 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.119072  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3623  luciferase family protein  38.03 
 
 		 319 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.378915 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3904  luciferase family protein  38.03 
 
 		 319 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4679  luciferase family protein  39.22 
 
 		 319 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4654  Luciferase-like monooxygenase  37.85 
 
 		 326 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.334317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2188  flavin-dependent oxidoreductase  38.03 
 
 		 319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5288  luciferase family protein  37.82 
 
 		 313 aa  179  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537455  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5451  luciferase-like  38.13 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5411  luciferase family protein  38.13 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.841448  decreased coverage  0.00286902 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4859  luciferase family protein  38.13 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2282  Luciferase-like monooxygenase  36.7 
 
 		 312 aa  171  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0554594  normal  0.109814 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5536  luciferase family protein  36.69 
 
 		 313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0197176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.76 
 
 		 273 aa  93.6  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  34.43 
 
 		 278 aa  85.9  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  30.28 
 
 		 272 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2848  Luciferase-like monooxygenase  33.9 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  32.67 
 
 		 316 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  36.13 
 
 		 362 aa  77.4  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2473  luciferase family protein  34.64 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.702772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  27.52 
 
 		 291 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2703  Luciferase-like monooxygenase  38.28 
 
 		 341 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.190412  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  35.71 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  35.42 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2248  luciferase family protein  32.17 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5645  luciferase family protein  26.71 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4906  luciferase family protein  35.83 
 
 		 325 aa  72.4  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.089783  normal  0.0157174 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  31.72 
 
 		 306 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4163  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.06 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.6036  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12907  oxidoreductase  33.47 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000227121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2999  Luciferase-like monooxygenase  28.94 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.547071  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  27.98 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0272  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.95 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.505051  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  35.71 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1898  luciferase-like protein  32.03 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749721  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1944  luciferase family protein  32.03 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.896213 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2400  Luciferase-like monooxygenase  29.08 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1878  luciferase family protein  32.03 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.121493 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1979  Luciferase-like monooxygenase  32.31 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132329  normal  0.747602 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  28.5 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  28.5 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  26.89 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  28.35 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  35.86 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1948  luciferase-like protein  29.56 
 
 		 353 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  35.86 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  26.75 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.35 
 
 		 314 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  27.88 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  37.72 
 
 		 372 aa  67.8  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10958  oxidoreductase  30.82 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.410507 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0961  alkanal monooxygenase beta chain  29.08 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4343  hypothetical protein  28.77 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0191984  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  27.35 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  34.78 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  34.78 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4429  hypothetical protein  28.77 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.205104 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3636  alkanal monooxygenase  26.95 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.372909 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4864  luciferase family protein  29.21 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0725656  normal  0.117116 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  29.17 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4723  hypothetical protein  28.77 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2493  luciferase family protein  31.01 
 
 		 372 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  27.42 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>