More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4731 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4731  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 		 335 aa  677    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329388  normal  0.73766 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7093  luciferase family protein  66.86 
 
 		 340 aa  461  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1694  luciferase family protein  47.78 
 
 		 334 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0758  luciferase family protein  48.09 
 
 		 319 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.556053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3064  luciferase  45.86 
 
 		 325 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.666797  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3198  bacterial luciferase family protein  45.69 
 
 		 328 aa  280  3e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339171  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1559  luciferase  40.94 
 
 		 322 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179064 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0230  luciferase family protein  43.58 
 
 		 359 aa  269  5e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2367  luciferase family protein  39.69 
 
 		 322 aa  241  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184521  hitchhiker  0.000901573 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2814  Luciferase-like monooxygenase  39.43 
 
 		 314 aa  239  4e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1981  luciferase family protein  39.13 
 
 		 327 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.960936  hitchhiker  0.00581741 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2485  hypothetical protein  38.82 
 
 		 327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0221825  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10203  hypothetical protein  38.51 
 
 		 316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0572  Luciferase-like monooxygenase  40.26 
 
 		 316 aa  231  9e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5641  luciferase family protein  38.51 
 
 		 327 aa  229  7e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01680  hypothetical protein  40.94 
 
 		 319 aa  228  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5909  luciferase-like  38.75 
 
 		 342 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3622  Luciferase-like monooxygenase  38.18 
 
 		 342 aa  216  4e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1816  luciferase family protein  40.78 
 
 		 313 aa  216  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00324647  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3318  luciferase family protein  38.44 
 
 		 346 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49090  hypothetical protein  39.46 
 
 		 339 aa  212  7e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002313 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4193  hypothetical protein  37.88 
 
 		 339 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3185  luciferase family protein  37.11 
 
 		 317 aa  209  4e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3086  luciferase family protein (alkanal monooxygenase, FMN-linked)  37.42 
 
 		 317 aa  209  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3436  luciferase family protein  37.11 
 
 		 317 aa  209  4e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3417  luciferase family protein  37.11 
 
 		 320 aa  209  7e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3167  luciferase family protein (alkanal monooxygenase (FMN-linked))  37.11 
 
 		 317 aa  208  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.282639  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3405  luciferase family protein  36.79 
 
 		 317 aa  206  6e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4752  luciferase family protein  40.83 
 
 		 316 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110568  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5451  luciferase-like  38.17 
 
 		 316 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5411  luciferase family protein  38.17 
 
 		 316 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.841448  decreased coverage  0.00286902 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4859  luciferase family protein  38.17 
 
 		 316 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5297  luciferase-like monooxygenase  40.14 
 
 		 316 aa  199  7e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564159 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0001  Luciferase-like monooxygenase  34.33 
 
 		 304 aa  189  4e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2282  Luciferase-like monooxygenase  37.97 
 
 		 312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0554594  normal  0.109814 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02793  monooxygenase  33.98 
 
 		 302 aa  182  6e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1334  luciferase-type oxidoreductase  35.17 
 
 		 306 aa  179  9e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3382  luciferase-type oxidoreductase  34.62 
 
 		 307 aa  178  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5288  luciferase family protein  35.92 
 
 		 313 aa  173  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537455  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2188  flavin-dependent oxidoreductase  36.1 
 
 		 319 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3798  luciferase-like monooxygenase  35.78 
 
 		 319 aa  169  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3279  luciferase family protein  35.14 
 
 		 321 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4462  luciferase-like  35.16 
 
 		 319 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.119072  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3904  luciferase family protein  35.16 
 
 		 319 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3623  luciferase family protein  35.16 
 
 		 319 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.378915 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2279  Luciferase-like monooxygenase  35.14 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.463796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5536  luciferase family protein  33.44 
 
 		 313 aa  155  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0197176 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4679  luciferase family protein  33.44 
 
 		 319 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0928  putative luciferase-like monooxygenase  31.17 
 
 		 325 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.187538  normal  0.76333 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4654  Luciferase-like monooxygenase  31.68 
 
 		 326 aa  149  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.334317  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  36.62 
 
 		 278 aa  93.6  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  34.04 
 
 		 272 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  29.82 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.16 
 
 		 314 aa  82.8  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  43.14 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  42.16 
 
 		 346 aa  80.1  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4141  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.41 
 
 		 285 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  0.0129648 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  30.92 
 
 		 352 aa  77.4  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1645  luciferase family protein  31.47 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  30.85 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  32.93 
 
 		 281 aa  75.9  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  37.72 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4792  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.48 
 
 		 266 aa  75.5  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0479287  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  40.2 
 
 		 344 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  40.2 
 
 		 344 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  38.32 
 
 		 348 aa  73.9  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  33.86 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7375  Luciferase-like monooxygenase  33.73 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.758616 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  33.06 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5600  luciferase-like protein  30.88 
 
 		 341 aa  72.8  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  28.7 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2400  Luciferase-like monooxygenase  29.73 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4569  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.33 
 
 		 288 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.658744  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  32.41 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  26.13 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4430  luciferase-like  26.96 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  34.19 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0958  luciferase-like  23.99 
 
 		 361 aa  69.3  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  29.12 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0086  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.14 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  30.22 
 
 		 283 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  30.22 
 
 		 283 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0592  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.26 
 
 		 265 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  23.61 
 
 		 335 aa  68.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5757  hypothetical protein  29.73 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.631627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5381  hypothetical protein  29.73 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.19 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5470  hypothetical protein  29.73 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.229318 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2334  Luciferase-like monooxygenase  30.65 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  26.88 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4069  luciferase-like protein  28.26 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  29.14 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  27.94 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  24.51 
 
 		 353 aa  66.2  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  26.41 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4099  luciferase-like protein  27.78 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8869  Luciferase-like monooxygenase  29.63 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0860  hypothetical protein  31.39 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0187655 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2248  luciferase family protein  28.57 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4131  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.4 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  0.0404326 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>