More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1559 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1559  luciferase  100 
 
 		 322 aa  653    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179064 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0758  luciferase family protein  54.52 
 
 		 319 aa  362  6e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.556053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1694  luciferase family protein  53.02 
 
 		 334 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3198  bacterial luciferase family protein  50.8 
 
 		 328 aa  350  1e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339171  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3064  luciferase  49.84 
 
 		 325 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.666797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0230  luciferase family protein  54.37 
 
 		 359 aa  335  7.999999999999999e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4731  Luciferase-like monooxygenase  40.94 
 
 		 335 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329388  normal  0.73766 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7093  luciferase family protein  38.68 
 
 		 340 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2814  Luciferase-like monooxygenase  38.61 
 
 		 314 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2367  luciferase family protein  40.87 
 
 		 322 aa  224  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184521  hitchhiker  0.000901573 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5641  luciferase family protein  40.82 
 
 		 327 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4193  hypothetical protein  37.91 
 
 		 339 aa  222  8e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10203  hypothetical protein  35.37 
 
 		 316 aa  221  9.999999999999999e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2485  hypothetical protein  38.61 
 
 		 327 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0221825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3622  Luciferase-like monooxygenase  37.81 
 
 		 342 aa  217  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1981  luciferase family protein  39.88 
 
 		 327 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.960936  hitchhiker  0.00581741 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3318  luciferase family protein  37.61 
 
 		 346 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0572  Luciferase-like monooxygenase  38.85 
 
 		 316 aa  216  4e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49090  hypothetical protein  37.92 
 
 		 339 aa  215  9e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002313 
 
 
-
 
NC_003296  RS01680  hypothetical protein  40.84 
 
 		 319 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5909  luciferase-like  37.74 
 
 		 342 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1816  luciferase family protein  41.28 
 
 		 313 aa  209  4e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00324647  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3185  luciferase family protein  36.83 
 
 		 317 aa  202  7e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3436  luciferase family protein  36.83 
 
 		 317 aa  202  7e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3086  luciferase family protein (alkanal monooxygenase, FMN-linked)  36.83 
 
 		 317 aa  201  9e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3417  luciferase family protein  36.02 
 
 		 320 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3167  luciferase family protein (alkanal monooxygenase (FMN-linked))  36.51 
 
 		 317 aa  199  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.282639  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3405  luciferase family protein  36.51 
 
 		 317 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0001  Luciferase-like monooxygenase  35 
 
 		 304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5451  luciferase-like  38.13 
 
 		 316 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5411  luciferase family protein  38.13 
 
 		 316 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.841448  decreased coverage  0.00286902 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4859  luciferase family protein  38.13 
 
 		 316 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5297  luciferase-like monooxygenase  37.59 
 
 		 316 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564159 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4752  luciferase family protein  37.23 
 
 		 316 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110568  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3382  luciferase-type oxidoreductase  36.14 
 
 		 307 aa  170  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1334  luciferase-type oxidoreductase  36.79 
 
 		 306 aa  166  4e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2282  Luciferase-like monooxygenase  36.33 
 
 		 312 aa  163  3e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0554594  normal  0.109814 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2279  Luciferase-like monooxygenase  35.03 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.463796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02793  monooxygenase  31.35 
 
 		 302 aa  158  9e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3798  luciferase-like monooxygenase  35.69 
 
 		 319 aa  153  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5288  luciferase family protein  33.23 
 
 		 313 aa  149  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537455  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3279  luciferase family protein  34.91 
 
 		 321 aa  149  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2188  flavin-dependent oxidoreductase  34.97 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4462  luciferase-like  35.48 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.119072  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3904  luciferase family protein  35.48 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3623  luciferase family protein  35.48 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.378915 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4679  luciferase family protein  33.98 
 
 		 319 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0928  putative luciferase-like monooxygenase  31.43 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.187538  normal  0.76333 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4654  Luciferase-like monooxygenase  31.75 
 
 		 326 aa  135  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.334317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5536  luciferase family protein  32.17 
 
 		 313 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0197176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.76 
 
 		 273 aa  90.1  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  37.79 
 
 		 278 aa  86.7  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  31.22 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  35.46 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  28.63 
 
 		 353 aa  80.1  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  36.22 
 
 		 281 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  35 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  31.43 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  29.11 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  28.44 
 
 		 334 aa  73.2  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  29.89 
 
 		 336 aa  72  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  30.11 
 
 		 334 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  33.8 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  33.1 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  34.29 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0310  Luciferase-like monooxygenase  36.62 
 
 		 367 aa  70.1  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  29.71 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  32.89 
 
 		 362 aa  68.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4419  Luciferase-like, subgroup  26.74 
 
 		 311 aa  68.9  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  32.56 
 
 		 352 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  34.27 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  36.59 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  34.27 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  36.59 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  31.47 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  26.97 
 
 		 314 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  32.39 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2015  luciferase family protein  36.59 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212649  normal  0.512168 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2473  luciferase family protein  36.44 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.702772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  31.82 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  33.12 
 
 		 328 aa  67  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5372  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.58 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0364521 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  35.94 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1973  luciferase family protein  32.78 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0282  luciferase-like protein  36.24 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  32.94 
 
 		 364 aa  65.9  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2999  Luciferase-like monooxygenase  26.39 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.547071  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  27.6 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2877  luciferase-like protein  37.78 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.399246  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0454  Luciferase-like monooxygenase  33.11 
 
 		 322 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2014  luciferase family protein  30 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.371395 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2907  luciferase family protein  37.78 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0407498  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  30 
 
 		 329 aa  65.5  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2921  luciferase family protein  37.78 
 
 		 351 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3175  Luciferase-like monooxygenase  36.96 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012092 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  32.37 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  29.75 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4138  luciferase-like protein  26.74 
 
 		 353 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1898  luciferase-like protein  32.6 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749721  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1878  luciferase family protein  32.6 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.121493 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>