More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3318 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3318  luciferase family protein  100 
 
 		 346 aa  694    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49090  hypothetical protein  69.91 
 
 		 339 aa  477  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002313 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4193  hypothetical protein  68.14 
 
 		 339 aa  472  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3622  Luciferase-like monooxygenase  68.73 
 
 		 342 aa  452  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2367  luciferase family protein  44.92 
 
 		 322 aa  265  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184521  hitchhiker  0.000901573 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2814  Luciferase-like monooxygenase  41.93 
 
 		 314 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3185  luciferase family protein  42.72 
 
 		 317 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3436  luciferase family protein  42.72 
 
 		 317 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3417  luciferase family protein  42.41 
 
 		 320 aa  259  4e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3086  luciferase family protein (alkanal monooxygenase, FMN-linked)  42.41 
 
 		 317 aa  258  7e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3167  luciferase family protein (alkanal monooxygenase (FMN-linked))  42.41 
 
 		 317 aa  258  8e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.282639  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3405  luciferase family protein  42.41 
 
 		 317 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5641  luciferase family protein  42.86 
 
 		 327 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01680  hypothetical protein  42.41 
 
 		 319 aa  249  5e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0572  Luciferase-like monooxygenase  40.99 
 
 		 316 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5909  luciferase-like  42.19 
 
 		 342 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1694  luciferase family protein  39.63 
 
 		 334 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10203  hypothetical protein  39.62 
 
 		 316 aa  236  4e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2485  hypothetical protein  40.88 
 
 		 327 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0221825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1816  luciferase family protein  43.66 
 
 		 313 aa  233  5e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00324647  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1981  luciferase family protein  39.25 
 
 		 327 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.960936  hitchhiker  0.00581741 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0758  luciferase family protein  41.43 
 
 		 319 aa  229  4e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.556053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0230  luciferase family protein  39.27 
 
 		 359 aa  219  3.9999999999999997e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1559  luciferase  37.61 
 
 		 322 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179064 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3198  bacterial luciferase family protein  38.04 
 
 		 328 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339171  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3064  luciferase  38.84 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.666797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4731  Luciferase-like monooxygenase  38.44 
 
 		 335 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329388  normal  0.73766 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0001  Luciferase-like monooxygenase  35.6 
 
 		 304 aa  202  5e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02793  monooxygenase  38.91 
 
 		 302 aa  188  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5288  luciferase family protein  38.7 
 
 		 313 aa  187  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537455  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4859  luciferase family protein  39.24 
 
 		 316 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5451  luciferase-like  39.24 
 
 		 316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5411  luciferase family protein  39.24 
 
 		 316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.841448  decreased coverage  0.00286902 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3382  luciferase-type oxidoreductase  37.34 
 
 		 307 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5297  luciferase-like monooxygenase  39.3 
 
 		 316 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564159 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7093  luciferase family protein  35.17 
 
 		 340 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4752  luciferase family protein  38.95 
 
 		 316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110568  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1334  luciferase-type oxidoreductase  37.41 
 
 		 306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2188  flavin-dependent oxidoreductase  35.09 
 
 		 319 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3798  luciferase-like monooxygenase  35.2 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4654  Luciferase-like monooxygenase  36.99 
 
 		 326 aa  166  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.334317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0928  putative luciferase-like monooxygenase  35.74 
 
 		 325 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.187538  normal  0.76333 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5536  luciferase family protein  35.44 
 
 		 313 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0197176 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2279  Luciferase-like monooxygenase  35.44 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.463796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4462  luciferase-like  34.8 
 
 		 319 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.119072  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3904  luciferase family protein  34.8 
 
 		 319 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3623  luciferase family protein  34.8 
 
 		 319 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.378915 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3279  luciferase family protein  33.96 
 
 		 321 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2282  Luciferase-like monooxygenase  37.72 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0554594  normal  0.109814 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4679  luciferase family protein  34.59 
 
 		 319 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  34.43 
 
 		 334 aa  92.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  36.11 
 
 		 352 aa  90.5  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  33.88 
 
 		 334 aa  89.7  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.61 
 
 		 273 aa  86.3  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  30.05 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  36.84 
 
 		 278 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  32.78 
 
 		 272 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4400  Luciferase-like monooxygenase  32.96 
 
 		 286 aa  82.4  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  31.72 
 
 		 353 aa  82  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  39.58 
 
 		 324 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  28.94 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  27.69 
 
 		 362 aa  80.9  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4419  Luciferase-like, subgroup  29.17 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4163  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.44 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.6036  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3175  Luciferase-like monooxygenase  30.29 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012092 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4099  luciferase-like protein  30.15 
 
 		 334 aa  79.3  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  29.04 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  34.86 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7310  monooxygenase  34.39 
 
 		 355 aa  77.4  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  34.86 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  34.86 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  32.69 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  35.8 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.96 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  33.77 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3368  luciferase family protein  35.71 
 
 		 278 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852738  normal  0.168989 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  30 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  33.71 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  28 
 
 		 335 aa  73.9  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  37.4 
 
 		 346 aa  73.6  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  40.16 
 
 		 372 aa  73.2  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  35.33 
 
 		 282 aa  72.8  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  35.54 
 
 		 341 aa  72.8  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4569  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.73 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.658744  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4069  luciferase-like protein  32.51 
 
 		 339 aa  72.8  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1645  luciferase family protein  30.29 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  27.47 
 
 		 336 aa  72  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1854  luciferase-like monooxygenase  30.42 
 
 		 389 aa  72  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  27.49 
 
 		 342 aa  72  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  29.13 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  32.16 
 
 		 330 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2493  luciferase family protein  36.55 
 
 		 372 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  33.56 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  27.94 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2999  Luciferase-like monooxygenase  29.77 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.547071  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4544  luciferase family protein  35.5 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.178601 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2588  putative luciferase-like monooxygenase  30.66 
 
 		 389 aa  70.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139273 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  29.84 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  28.82 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0594  luciferase-like protein  32.49 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.852458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>