More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5288 on replicon NC_010335
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010335  Caul_5288  luciferase family protein  100 
 
 		 313 aa  612  9.999999999999999e-175  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537455  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4654  Luciferase-like monooxygenase  54.52 
 
 		 326 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.334317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0928  putative luciferase-like monooxygenase  54.43 
 
 		 325 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.187538  normal  0.76333 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2188  flavin-dependent oxidoreductase  53.29 
 
 		 319 aa  285  8e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3798  luciferase-like monooxygenase  52.72 
 
 		 319 aa  281  9e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3279  luciferase family protein  52.4 
 
 		 321 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4462  luciferase-like  51.64 
 
 		 319 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.119072  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3904  luciferase family protein  51.64 
 
 		 319 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3623  luciferase family protein  51.64 
 
 		 319 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.378915 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4679  luciferase family protein  51.32 
 
 		 319 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5536  luciferase family protein  51 
 
 		 313 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0197176 
 
 
-
 
NC_003296  RS01680  hypothetical protein  46.56 
 
 		 319 aa  249  6e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2279  Luciferase-like monooxygenase  45.05 
 
 		 311 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.463796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2367  luciferase family protein  38.06 
 
 		 322 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184521  hitchhiker  0.000901573 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2814  Luciferase-like monooxygenase  38.68 
 
 		 314 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1981  luciferase family protein  37.42 
 
 		 327 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.960936  hitchhiker  0.00581741 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5909  luciferase-like  36.94 
 
 		 342 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1816  luciferase family protein  42.6 
 
 		 313 aa  203  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00324647  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5641  luciferase family protein  36.86 
 
 		 327 aa  202  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0572  Luciferase-like monooxygenase  36.67 
 
 		 316 aa  201  9e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3086  luciferase family protein (alkanal monooxygenase, FMN-linked)  36.51 
 
 		 317 aa  200  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3417  luciferase family protein  36.19 
 
 		 320 aa  199  6e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3185  luciferase family protein  36.19 
 
 		 317 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3167  luciferase family protein (alkanal monooxygenase (FMN-linked))  36.19 
 
 		 317 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.282639  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10203  hypothetical protein  35.13 
 
 		 316 aa  198  7.999999999999999e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3436  luciferase family protein  36.19 
 
 		 317 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2485  hypothetical protein  35.9 
 
 		 327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0221825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3405  luciferase family protein  36.19 
 
 		 317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1694  luciferase family protein  37.62 
 
 		 334 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0001  Luciferase-like monooxygenase  34.78 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3622  Luciferase-like monooxygenase  38.36 
 
 		 342 aa  187  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3318  luciferase family protein  38.7 
 
 		 346 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49090  hypothetical protein  41.25 
 
 		 339 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002313 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4193  hypothetical protein  40.5 
 
 		 339 aa  185  9e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3064  luciferase  37.42 
 
 		 325 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.666797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0758  luciferase family protein  39.23 
 
 		 319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.556053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7093  luciferase family protein  36.42 
 
 		 340 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3198  bacterial luciferase family protein  37.82 
 
 		 328 aa  179  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339171  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4731  Luciferase-like monooxygenase  35.92 
 
 		 335 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329388  normal  0.73766 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3382  luciferase-type oxidoreductase  34.32 
 
 		 307 aa  169  7e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1334  luciferase-type oxidoreductase  34.81 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2282  Luciferase-like monooxygenase  36.64 
 
 		 312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0554594  normal  0.109814 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5451  luciferase-like  38.35 
 
 		 316 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4859  luciferase family protein  38.35 
 
 		 316 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5411  luciferase family protein  38.35 
 
 		 316 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.841448  decreased coverage  0.00286902 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02793  monooxygenase  34.05 
 
 		 302 aa  156  5.0000000000000005e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5297  luciferase-like monooxygenase  38.49 
 
 		 316 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564159 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4752  luciferase family protein  38.13 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110568  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0230  luciferase family protein  35.14 
 
 		 359 aa  152  7e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1559  luciferase  33.23 
 
 		 322 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179064 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4099  luciferase-like protein  32.65 
 
 		 334 aa  85.9  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  28.86 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  27.91 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.46 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  31.4 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  25.68 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  27.67 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2014  luciferase family protein  28.86 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.371395 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  35 
 
 		 352 aa  76.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  29.35 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  27.15 
 
 		 335 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2031  luciferase-like protein  27.99 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2077  luciferase family protein  27.99 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.841403 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  28.36 
 
 		 362 aa  74.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  27.85 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4444  Luciferase-like, subgroup  35.54 
 
 		 328 aa  74.3  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155072  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.61 
 
 		 273 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  31.46 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  34.78 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1898  luciferase-like protein  31.76 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749721  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1944  luciferase family protein  31.76 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.896213 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  32.97 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1878  luciferase family protein  31.76 
 
 		 391 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.121493 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  31.21 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  31.09 
 
 		 294 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0454  Luciferase-like monooxygenase  35.26 
 
 		 322 aa  72  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  32.42 
 
 		 343 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4163  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.49 
 
 		 285 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.6036  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1109  luciferase family protein  28.28 
 
 		 368 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  30 
 
 		 335 aa  71.2  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  28.17 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4569  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.84 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.658744  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  29.47 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0268  luciferase family protein  29.39 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10971  oxidoreductase  31.75 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0930752  normal  0.92148 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  35.83 
 
 		 363 aa  69.7  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2493  luciferase family protein  32.45 
 
 		 372 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0803  putative F420-dependent oxidoreductase  29.08 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  28.14 
 
 		 352 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0451  luciferase-like protein  29.52 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  40.38 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0462  luciferase family protein  29.52 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4864  luciferase family protein  31.58 
 
 		 282 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0725656  normal  0.117116 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0592  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.66 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  29.07 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4419  Luciferase-like, subgroup  26.42 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1857  Luciferase-like monooxygenase  29.53 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  31.67 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0438  luciferase family protein  29.52 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.465558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4430  luciferase-like  24.01 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173582  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>