More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4411 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  100 
 
 		 335 aa  695    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4430  luciferase-like  47.23 
 
 		 337 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  32.82 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  36.2 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4444  Luciferase-like, subgroup  29.18 
 
 		 328 aa  121  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155072  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  30.25 
 
 		 346 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4099  luciferase-like protein  27.47 
 
 		 334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5600  luciferase-like protein  28.53 
 
 		 341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  36.32 
 
 		 281 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  33.2 
 
 		 293 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4069  luciferase-like protein  30.29 
 
 		 339 aa  115  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  27.1 
 
 		 328 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  33.63 
 
 		 272 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4400  Luciferase-like monooxygenase  35.11 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  27.24 
 
 		 309 aa  109  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4027  luciferase family protein  32.46 
 
 		 306 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.826665 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  29.04 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2334  Luciferase-like monooxygenase  37.19 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.18 
 
 		 299 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1645  luciferase family protein  29.86 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.33 
 
 		 277 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.759524 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  31.65 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  28.48 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0329  luciferase-like protein  27.94 
 
 		 306 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0339  luciferase family protein  27.94 
 
 		 306 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.347721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4569  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  25.88 
 
 		 288 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.658744  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0318  luciferase family protein  27.94 
 
 		 306 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2183  Luciferase-like monooxygenase  28.15 
 
 		 289 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  38.46 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  27.95 
 
 		 342 aa  100  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  28.86 
 
 		 288 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4637  luciferase-like protein  29.02 
 
 		 293 aa  99  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4725  luciferase family protein  29.02 
 
 		 293 aa  99  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5167  luciferase family protein  33.33 
 
 		 306 aa  99  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5019  luciferase family protein  29.02 
 
 		 293 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  26.19 
 
 		 352 aa  98.2  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  31.02 
 
 		 306 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  26.93 
 
 		 342 aa  98.2  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29280  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  26.39 
 
 		 328 aa  98.2  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.98 
 
 		 273 aa  97.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3514  Luciferase-like monooxygenase  34.95 
 
 		 295 aa  96.3  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726686  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0395  Luciferase-like monooxygenase  29.46 
 
 		 306 aa  96.3  7e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.104379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0625  Luciferase-like monooxygenase  26.92 
 
 		 332 aa  96.3  7e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00154415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5819  luciferase family protein  31.73 
 
 		 274 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.762331  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1590  luciferase family protein  32.37 
 
 		 306 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  26.24 
 
 		 308 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2831  luciferase family protein  28.86 
 
 		 290 aa  95.5  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  26.24 
 
 		 308 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2015  luciferase family protein  26.24 
 
 		 308 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212649  normal  0.512168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2877  luciferase-like protein  30.38 
 
 		 291 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.399246  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5063  luciferase-like protein  32.13 
 
 		 285 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4131  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.07 
 
 		 289 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  0.0404326 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4138  luciferase-like protein  25.83 
 
 		 353 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5151  luciferase family protein  32.13 
 
 		 285 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  24.3 
 
 		 310 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01300  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.18 
 
 		 296 aa  94  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.570221  normal  0.447872 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2921  luciferase family protein  30.38 
 
 		 351 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5442  luciferase family protein  31.67 
 
 		 285 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.942961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2907  luciferase family protein  30 
 
 		 291 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0407498  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  28.57 
 
 		 291 aa  92.8  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4419  Luciferase-like, subgroup  27.76 
 
 		 311 aa  92.8  7e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1675  luciferase family protein  28.47 
 
 		 311 aa  92.4  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0454  Luciferase-like monooxygenase  24.32 
 
 		 322 aa  92.4  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  26.57 
 
 		 309 aa  92.4  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13096  hypothetical protein  32.55 
 
 		 275 aa  92  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0377667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  25.47 
 
 		 310 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  29.14 
 
 		 354 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0109  Luciferase-like monooxygenase  31.48 
 
 		 307 aa  92.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  26.78 
 
 		 334 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  30.11 
 
 		 324 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  28.38 
 
 		 288 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5311  luciferase-like protein  28.39 
 
 		 283 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  32.16 
 
 		 299 aa  90.5  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2282  Luciferase-like monooxygenase  27.35 
 
 		 312 aa  90.5  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0554594  normal  0.109814 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1017  luciferase family protein  29.67 
 
 		 276 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1970  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.13 
 
 		 293 aa  90.1  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2848  Luciferase-like monooxygenase  26.41 
 
 		 306 aa  89.7  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.23 
 
 		 306 aa  90.1  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1948  luciferase-like protein  29.11 
 
 		 353 aa  89.7  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  28.92 
 
 		 364 aa  89.4  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3320  luciferase family protein  28.48 
 
 		 338 aa  89.7  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1857  Luciferase-like monooxygenase  26.89 
 
 		 287 aa  89.4  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2346  luciferase family protein  26.86 
 
 		 316 aa  89.4  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0184001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4872  luciferase family protein  27.67 
 
 		 338 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.541717  normal  0.0985833 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6951  luciferase family protein  28.3 
 
 		 322 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  26.38 
 
 		 281 aa  88.6  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  26.92 
 
 		 362 aa  88.6  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  26.52 
 
 		 334 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4624  luciferase family protein  32.4 
 
 		 306 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4150  hypothetical protein  29.78 
 
 		 296 aa  88.2  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  28.49 
 
 		 283 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0669  Luciferase-like monooxygenase  27.27 
 
 		 342 aa  88.6  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.113099  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2313  luciferase family protein  28.82 
 
 		 316 aa  88.2  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0072758  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  28.49 
 
 		 283 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3016  hypothetical protein  33 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  28.49 
 
 		 283 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3175  Luciferase-like monooxygenase  30.22 
 
 		 278 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012092 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7341  Luciferase-like monooxygenase  25.87 
 
 		 309 aa  87  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268267 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2248  luciferase family protein  30.26 
 
 		 306 aa  87  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1265  luciferase-like protein  29.74 
 
 		 282 aa  87  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0282083 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>