More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4430 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4430  luciferase-like  100 
 
 		 337 aa  697    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  47.23 
 
 		 335 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  34.06 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  30.96 
 
 		 307 aa  132  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  33.2 
 
 		 288 aa  130  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  35.27 
 
 		 272 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4400  Luciferase-like monooxygenase  38.67 
 
 		 286 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4099  luciferase-like protein  26.09 
 
 		 334 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  32.43 
 
 		 305 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  34.82 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  33.33 
 
 		 283 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  33.33 
 
 		 283 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  33.33 
 
 		 283 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  32.49 
 
 		 298 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5600  luciferase-like protein  28.13 
 
 		 341 aa  119  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4069  luciferase-like protein  29.03 
 
 		 339 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  37.62 
 
 		 278 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4027  luciferase family protein  29.68 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.826665 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  29.06 
 
 		 342 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3368  luciferase family protein  32.99 
 
 		 278 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852738  normal  0.168989 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  25.85 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  32.6 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2877  luciferase-like protein  31.11 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.399246  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  31.65 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  33.33 
 
 		 281 aa  106  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2921  luciferase family protein  31.5 
 
 		 351 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  28.24 
 
 		 309 aa  106  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.37 
 
 		 299 aa  106  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1265  luciferase-like protein  30.92 
 
 		 282 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0282083 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1645  luciferase family protein  27.88 
 
 		 315 aa  105  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2907  luciferase family protein  30.37 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0407498  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1979  Luciferase-like monooxygenase  33.47 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132329  normal  0.747602 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4624  luciferase family protein  26.11 
 
 		 306 aa  102  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  27.11 
 
 		 352 aa  102  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.83 
 
 		 314 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.99 
 
 		 273 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4444  Luciferase-like, subgroup  26.83 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155072  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2334  Luciferase-like monooxygenase  33.47 
 
 		 304 aa  99.8  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4569  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.05 
 
 		 288 aa  99.8  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.658744  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  27.14 
 
 		 334 aa  98.2  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  27.86 
 
 		 316 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.11 
 
 		 277 aa  97.4  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.759524 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4544  luciferase family protein  31.36 
 
 		 282 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.178601 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3016  hypothetical protein  33.33 
 
 		 295 aa  97.1  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  28.25 
 
 		 310 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4150  hypothetical protein  33.33 
 
 		 296 aa  96.7  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  25.23 
 
 		 328 aa  96.7  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0395  Luciferase-like monooxygenase  25.08 
 
 		 306 aa  96.3  6e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.104379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  31.62 
 
 		 306 aa  95.9  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2282  Luciferase-like monooxygenase  30.09 
 
 		 312 aa  95.9  9e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0554594  normal  0.109814 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  24.4 
 
 		 353 aa  94.7  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4324  luciferase-like protein  28.57 
 
 		 282 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4131  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.91 
 
 		 289 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  0.0404326 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4410  luciferase family protein  28.57 
 
 		 282 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2248  luciferase family protein  32.05 
 
 		 306 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0709  Luciferase-like monooxygenase  25.75 
 
 		 307 aa  94.7  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4704  luciferase family protein  28.57 
 
 		 282 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.405552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  31 
 
 		 299 aa  93.6  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4637  luciferase-like protein  26.12 
 
 		 293 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4725  luciferase family protein  26.12 
 
 		 293 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3514  Luciferase-like monooxygenase  30.13 
 
 		 295 aa  92.8  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726686  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5019  luciferase family protein  26.12 
 
 		 293 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2831  luciferase family protein  27.94 
 
 		 290 aa  92.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1590  luciferase family protein  27.87 
 
 		 306 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2313  luciferase family protein  26.3 
 
 		 316 aa  92.4  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0072758  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  31.9 
 
 		 292 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5167  luciferase family protein  28.52 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2473  luciferase family protein  33.16 
 
 		 289 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.702772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  33.82 
 
 		 308 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2867  putative F420-dependent oxidoreductase  27.3 
 
 		 311 aa  90.9  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  33.82 
 
 		 308 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3595  luciferase family protein  32.86 
 
 		 285 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26001  normal  0.696176 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4864  luciferase family protein  32.62 
 
 		 282 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0725656  normal  0.117116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1973  luciferase family protein  31.11 
 
 		 274 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4138  luciferase-like protein  25.07 
 
 		 353 aa  90.9  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2015  luciferase family protein  31.86 
 
 		 308 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212649  normal  0.512168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8770  Luciferase-like monooxygenase  33.5 
 
 		 295 aa  90.5  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.547514 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1552  Luciferase-like monooxygenase  28.87 
 
 		 284 aa  90.5  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1871  luciferase family protein  27.41 
 
 		 301 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0338781 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  27.03 
 
 		 334 aa  89.4  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5311  luciferase-like protein  28.76 
 
 		 283 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6834  luciferase family protein  25.96 
 
 		 327 aa  89  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3286  luciferase family protein  27.89 
 
 		 307 aa  89  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3854  Luciferase-like, subgroup  30.21 
 
 		 288 aa  89  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0329  luciferase-like protein  27.78 
 
 		 306 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0272  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  26.51 
 
 		 292 aa  89  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.505051  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3320  luciferase family protein  27.52 
 
 		 338 aa  88.6  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2183  Luciferase-like monooxygenase  28.96 
 
 		 289 aa  88.6  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0339  luciferase family protein  27.78 
 
 		 306 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.347721 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0318  luciferase family protein  27.78 
 
 		 306 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1970  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.49 
 
 		 293 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  23.71 
 
 		 346 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1199  luciferase family protein  36.11 
 
 		 281 aa  87.4  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7341  Luciferase-like monooxygenase  27.09 
 
 		 309 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268267 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  26.96 
 
 		 310 aa  87  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  29.05 
 
 		 330 aa  87  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10971  oxidoreductase  33.33 
 
 		 290 aa  87  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0930752  normal  0.92148 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  26.17 
 
 		 331 aa  87  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5018  luciferase-like protein  28.32 
 
 		 283 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.915726  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3874  putative F420-dependent oxidoreductase  27.98 
 
 		 286 aa  86.7  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>