More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4755 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  100 
 
 
293 aa  583  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2473  luciferase family protein  54.74 
 
 
289 aa  291  8e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.702772  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  44.52 
 
 
288 aa  241  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  45.58 
 
 
298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  42.76 
 
 
305 aa  216  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3016  hypothetical protein  43.25 
 
 
295 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4150  hypothetical protein  42.21 
 
 
296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  40.8 
 
 
288 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2877  luciferase-like protein  40 
 
 
291 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.399246  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2907  luciferase family protein  40 
 
 
291 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0407498  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2921  luciferase family protein  39.51 
 
 
351 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2183  Luciferase-like monooxygenase  34.81 
 
 
289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.21 
 
 
299 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4569  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.6 
 
 
288 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.658744  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  41.36 
 
 
272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4400  Luciferase-like monooxygenase  33.22 
 
 
286 aa  126  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  39.61 
 
 
281 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  34.33 
 
 
291 aa  122  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  33.73 
 
 
294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  31.86 
 
 
293 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  40.83 
 
 
278 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  35.33 
 
 
309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3326  luciferase-like protein  36.33 
 
 
286 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  35.68 
 
 
307 aa  115  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3388  Fis family transcriptional regulator  36.33 
 
 
286 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.695689  normal  0.0265519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3337  Fis family transcriptional regulator  36.33 
 
 
286 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122332  normal  0.403039 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  33.98 
 
 
346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3514  Luciferase-like monooxygenase  36.82 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  37.93 
 
 
273 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3175  Luciferase-like monooxygenase  31.99 
 
 
278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012092 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  34.31 
 
 
283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4637  luciferase-like protein  29.67 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  34.31 
 
 
283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4725  luciferase family protein  29.67 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5019  luciferase family protein  29.67 
 
 
293 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1645  luciferase family protein  31.43 
 
 
315 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4430  luciferase-like  32.6 
 
 
337 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173582  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3368  luciferase family protein  31.62 
 
 
278 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852738  normal  0.168989 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0272  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.53 
 
 
292 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.505051  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3119  Luciferase-like monooxygenase  27.91 
 
 
299 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460925  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5167  luciferase family protein  32.03 
 
 
306 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  34.44 
 
 
283 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4069  luciferase-like protein  33.06 
 
 
339 aa  106  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4027  luciferase family protein  35.16 
 
 
306 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.826665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4131  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  37.09 
 
 
289 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  0.0404326 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1590  luciferase family protein  31.14 
 
 
306 aa  105  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  34.94 
 
 
353 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4343  hypothetical protein  31.23 
 
 
288 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0191984  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4429  hypothetical protein  31.23 
 
 
288 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.205104 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2703  Luciferase-like monooxygenase  40.54 
 
 
341 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.190412  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4723  hypothetical protein  30.88 
 
 
288 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4163  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.63 
 
 
285 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.6036  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4419  Luciferase-like, subgroup  31.25 
 
 
311 aa  103  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1250  Luciferase-like monooxygenase  38.51 
 
 
296 aa  102  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1970  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.6 
 
 
293 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  33.97 
 
 
299 aa  102  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5600  luciferase-like protein  30.24 
 
 
341 aa  102  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3854  Luciferase-like, subgroup  33.2 
 
 
288 aa  101  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0329  luciferase-like protein  29.37 
 
 
306 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0339  luciferase family protein  29.37 
 
 
306 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.347721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3595  luciferase family protein  32.42 
 
 
285 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26001  normal  0.696176 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0318  luciferase family protein  29.37 
 
 
306 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2334  Luciferase-like monooxygenase  37.77 
 
 
304 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8770  Luciferase-like monooxygenase  32.31 
 
 
295 aa  99.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.547514 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4370  hypothetical protein  31.6 
 
 
284 aa  99.8  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  32.62 
 
 
342 aa  98.6  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2912  luciferase family protein  30.59 
 
 
285 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122178  normal  0.460914 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0161  luciferase-like  34.95 
 
 
289 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.68 
 
 
277 aa  98.2  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.759524 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4544  luciferase family protein  31.84 
 
 
282 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.178601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.49 
 
 
314 aa  96.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2015  luciferase family protein  40.58 
 
 
308 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212649  normal  0.512168 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5645  luciferase family protein  33.51 
 
 
284 aa  96.3  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  40.58 
 
 
308 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  40.58 
 
 
308 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4624  luciferase family protein  32.42 
 
 
306 aa  95.9  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2831  luciferase family protein  34.59 
 
 
290 aa  94.7  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5819  luciferase family protein  33.01 
 
 
274 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.762331  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1017  luciferase family protein  33.5 
 
 
276 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1552  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 
284 aa  94.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1979  Luciferase-like monooxygenase  35.43 
 
 
291 aa  94  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132329  normal  0.747602 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10958  oxidoreductase  34.55 
 
 
288 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.410507 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4099  luciferase-like protein  30.05 
 
 
334 aa  92.4  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6951  luciferase family protein  37.57 
 
 
322 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2400  Luciferase-like monooxygenase  32.49 
 
 
285 aa  92  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2248  luciferase family protein  30.37 
 
 
306 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2282  Luciferase-like monooxygenase  29.61 
 
 
312 aa  91.3  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0554594  normal  0.109814 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  40.15 
 
 
328 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  30.98 
 
 
292 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4885  luciferase family protein  31.4 
 
 
290 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795052  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  35.25 
 
 
324 aa  90.1  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1886  luciferase-like  32.24 
 
 
287 aa  89.7  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.5944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5013  Luciferase-like monooxygenase  32.5 
 
 
288 aa  89.7  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6834  luciferase family protein  33.52 
 
 
327 aa  89  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  31.45 
 
 
753 aa  89  8e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1973  luciferase family protein  33.95 
 
 
274 aa  89  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  28.37 
 
 
306 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3417  luciferase family protein  29.71 
 
 
320 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3185  luciferase family protein  29.71 
 
 
317 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3167  luciferase family protein (alkanal monooxygenase (FMN-linked))  29.71 
 
 
317 aa  87.8  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.282639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>