More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4429 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4343  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  590  1e-168  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0191984  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4429  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  590  1e-168  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.205104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4723  hypothetical protein  98.96 
 
 		 288 aa  586  1e-166  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1850  hypothetical protein  85.47 
 
 		 290 aa  498  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4885  luciferase family protein  85.17 
 
 		 290 aa  494  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10958  oxidoreductase  82.29 
 
 		 288 aa  479  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.410507 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0272  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  71.38 
 
 		 292 aa  436  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.505051  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3854  Luciferase-like, subgroup  69.9 
 
 		 288 aa  407  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1250  Luciferase-like monooxygenase  64.48 
 
 		 296 aa  377  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4370  hypothetical protein  63.83 
 
 		 284 aa  370  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5019  luciferase family protein  44.29 
 
 		 293 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4637  luciferase-like protein  44.29 
 
 		 293 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4725  luciferase family protein  44.29 
 
 		 293 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2831  luciferase family protein  41.03 
 
 		 290 aa  202  6e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2634  luciferase family protein  41.72 
 
 		 290 aa  189  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.112704 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3595  luciferase family protein  35.17 
 
 		 285 aa  158  8e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26001  normal  0.696176 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2912  luciferase family protein  34.83 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122178  normal  0.460914 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8770  Luciferase-like monooxygenase  34.47 
 
 		 295 aa  156  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.547514 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3326  luciferase-like protein  35.86 
 
 		 286 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3388  Fis family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 286 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.695689  normal  0.0265519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3337  Fis family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 286 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122332  normal  0.403039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1970  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.86 
 
 		 293 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.49 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3625  luciferase-like protein  38.38 
 
 		 202 aa  113  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  38.69 
 
 		 288 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  29.79 
 
 		 309 aa  112  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  29.39 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  31.23 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  29.37 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4400  Luciferase-like monooxygenase  35.87 
 
 		 286 aa  99.4  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4419  Luciferase-like, subgroup  26.24 
 
 		 311 aa  99  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  32.14 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  29.07 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  33.67 
 
 		 305 aa  97.1  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2473  luciferase family protein  32.98 
 
 		 289 aa  96.3  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.702772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3119  Luciferase-like monooxygenase  29.86 
 
 		 299 aa  95.9  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460925  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  35.71 
 
 		 278 aa  95.1  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.92 
 
 		 273 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5645  luciferase family protein  27.15 
 
 		 284 aa  92.8  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  32.23 
 
 		 346 aa  90.1  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3016  hypothetical protein  40.58 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4150  hypothetical protein  40.58 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2877  luciferase-like protein  30.6 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.399246  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2907  luciferase family protein  30.6 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0407498  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  34.02 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2921  luciferase family protein  30.77 
 
 		 351 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4069  luciferase-like protein  29.48 
 
 		 339 aa  86.7  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  30.9 
 
 		 282 aa  86.3  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3368  luciferase family protein  29 
 
 		 278 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852738  normal  0.168989 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5819  luciferase family protein  30.51 
 
 		 274 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.762331  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4027  luciferase family protein  27.42 
 
 		 306 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.826665 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  37.68 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  26.84 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  28 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  28 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  28 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3175  Luciferase-like monooxygenase  35.67 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012092 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  31 
 
 		 291 aa  82  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  27.27 
 
 		 335 aa  82  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6834  luciferase family protein  33.09 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4624  luciferase family protein  25.52 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  28.29 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1520  Luciferase-like monooxygenase  31.12 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.784524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1017  luciferase family protein  29.46 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  33.16 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4163  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.73 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.6036  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4569  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.76 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.658744  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1636  Luciferase-like monooxygenase  27.53 
 
 		 519 aa  79.3  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0262189 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  32.31 
 
 		 754 aa  79.3  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7126  hypothetical protein  26.63 
 
 		 367 aa  79  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2483  luciferase-like monooxygenase  30.81 
 
 		 543 aa  79  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.37849 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6444  luciferase family protein  35.11 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4430  luciferase-like  23.08 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3410  putative F420-dependent oxidoreductase  31.32 
 
 		 293 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.212924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2017  Luciferase-like monooxygenase  28.75 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00175263  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2400  Luciferase-like monooxygenase  30.11 
 
 		 285 aa  78.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2334  Luciferase-like monooxygenase  30.37 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4671  Luciferase-like monooxygenase  32.88 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.444126  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  31.79 
 
 		 764 aa  78.2  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3514  Luciferase-like monooxygenase  30.17 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726686  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0757  luciferase family protein  26.91 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  0.787392 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30060  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.29 
 
 		 507 aa  77  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6062  monooxygenase  26.83 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.888466  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  32.17 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1979  Luciferase-like monooxygenase  27.17 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132329  normal  0.747602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2183  Luciferase-like monooxygenase  27.27 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  28.31 
 
 		 335 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6951  luciferase family protein  35.97 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1552  Luciferase-like monooxygenase  30.1 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1117  luciferase family protein  30.83 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.30712 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0329  luciferase-like protein  29.63 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1645  luciferase family protein  30.91 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0339  luciferase family protein  29.63 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.347721 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0318  luciferase family protein  29.63 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.12 
 
 		 314 aa  75.5  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3031  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  28.72 
 
 		 557 aa  75.1  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1886  luciferase-like  29.3 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.5944 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  31.14 
 
 		 334 aa  75.1  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  28.08 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06300  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.53 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>