More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2400 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2400  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 
285 aa  559  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3119  Luciferase-like monooxygenase  43.24 
 
 
299 aa  233  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460925  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  38.81 
 
 
299 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2334  Luciferase-like monooxygenase  38.67 
 
 
304 aa  118  9e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  37.32 
 
 
307 aa  118  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5819  luciferase family protein  31 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.762331  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  33.49 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5645  luciferase family protein  33.22 
 
 
284 aa  109  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1645  luciferase family protein  33.17 
 
 
315 aa  108  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  30.54 
 
 
288 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1017  luciferase family protein  34.98 
 
 
276 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4069  luciferase-like protein  34.05 
 
 
339 aa  106  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.82 
 
 
277 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.759524 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4370  hypothetical protein  36.07 
 
 
284 aa  103  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  35.48 
 
 
278 aa  102  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.87 
 
 
304 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  34.68 
 
 
272 aa  102  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  29.93 
 
 
310 aa  102  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  28.63 
 
 
336 aa  101  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4419  Luciferase-like, subgroup  34.04 
 
 
311 aa  101  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  33.01 
 
 
305 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4400  Luciferase-like monooxygenase  33.93 
 
 
286 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4150  hypothetical protein  36.15 
 
 
296 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3016  hypothetical protein  36.15 
 
 
295 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2183  Luciferase-like monooxygenase  35.96 
 
 
289 aa  99.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  32.37 
 
 
310 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  33.18 
 
 
288 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  35.06 
 
 
346 aa  97.1  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12191  hypothetical protein  32.1 
 
 
288 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.69283e-42  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  30.43 
 
 
294 aa  97.4  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  36.5 
 
 
298 aa  96.7  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  34.1 
 
 
335 aa  95.9  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  34.13 
 
 
309 aa  95.5  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  31.13 
 
 
291 aa  95.5  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  36.17 
 
 
324 aa  93.6  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  30.37 
 
 
342 aa  93.6  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4569  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.3 
 
 
288 aa  93.6  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.658744  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  32.21 
 
 
306 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1250  Luciferase-like monooxygenase  33.92 
 
 
296 aa  92.4  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0086  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.24 
 
 
313 aa  92.4  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  32.13 
 
 
281 aa  92  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  32.49 
 
 
293 aa  92  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4027  luciferase family protein  32.69 
 
 
306 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.826665 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2831  luciferase family protein  31.94 
 
 
290 aa  90.9  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  28.02 
 
 
328 aa  90.9  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13096  hypothetical protein  32.5 
 
 
275 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0377667  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  29.65 
 
 
299 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1973  luciferase family protein  30.09 
 
 
274 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.84 
 
 
273 aa  89.7  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4637  luciferase-like protein  29.25 
 
 
293 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4725  luciferase family protein  29.25 
 
 
293 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3566  Luciferase-like monooxygenase  28.24 
 
 
274 aa  89.4  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136726  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5019  luciferase family protein  29.9 
 
 
293 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5167  luciferase family protein  37.42 
 
 
306 aa  89  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2473  luciferase family protein  34.33 
 
 
289 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.702772  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  29.86 
 
 
292 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1979  Luciferase-like monooxygenase  36.13 
 
 
291 aa  86.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132329  normal  0.747602 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4624  luciferase family protein  30.34 
 
 
306 aa  85.9  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3368  luciferase family protein  30 
 
 
278 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852738  normal  0.168989 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1948  luciferase-like protein  30.71 
 
 
353 aa  85.5  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  33.33 
 
 
353 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0173  putative F420-dependent oxidoreductase  34.43 
 
 
326 aa  84  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.182486  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0272  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.6 
 
 
292 aa  84.3  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.505051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4131  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  36.47 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  0.0404326 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2015  luciferase family protein  30.88 
 
 
308 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212649  normal  0.512168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  30.88 
 
 
308 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8869  Luciferase-like monooxygenase  33.95 
 
 
336 aa  84  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3175  Luciferase-like monooxygenase  36.71 
 
 
278 aa  84  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012092 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  30.88 
 
 
308 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  32.31 
 
 
335 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2877  luciferase-like protein  36.54 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.399246  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2921  luciferase family protein  36.71 
 
 
351 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2907  luciferase family protein  36.54 
 
 
291 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0407498  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0161  luciferase-like  36.42 
 
 
289 aa  82.4  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3854  Luciferase-like, subgroup  30.98 
 
 
288 aa  82.4  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  32.56 
 
 
290 aa  82  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1465  luciferase family protein  32.58 
 
 
275 aa  82  0.000000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2248  luciferase family protein  33.99 
 
 
306 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2634  luciferase family protein  31.02 
 
 
290 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.112704 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  31.85 
 
 
342 aa  81.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2017  Luciferase-like monooxygenase  30.32 
 
 
330 aa  81.3  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00175263  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1590  luciferase family protein  35.48 
 
 
306 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  35.39 
 
 
331 aa  80.5  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6444  luciferase family protein  34.64 
 
 
293 aa  80.5  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10203  hypothetical protein  28.63 
 
 
316 aa  80.5  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 
362 aa  80.1  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  31.92 
 
 
334 aa  80.1  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4723  hypothetical protein  28.23 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5600  luciferase-like protein  33.84 
 
 
341 aa  79.3  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.03 
 
 
314 aa  79.3  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  30.61 
 
 
281 aa  79.3  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4343  hypothetical protein  30.11 
 
 
288 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0191984  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4429  hypothetical protein  30.11 
 
 
288 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.205104 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0329  luciferase-like protein  34.84 
 
 
306 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6754  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.96 
 
 
310 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0339  luciferase family protein  34.84 
 
 
306 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.347721 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0318  luciferase family protein  34.84 
 
 
306 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2014  luciferase family protein  28.38 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.371395 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  28.09 
 
 
316 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  30.05 
 
 
343 aa  77.4  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>