More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2780 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  100 
 
 
298 aa  597  1e-170  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  87.15 
 
 
305 aa  519  1e-146  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  56.94 
 
 
288 aa  355  3.9999999999999996e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  54.17 
 
 
288 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2473  luciferase family protein  48.45 
 
 
289 aa  256  4e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.702772  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3016  hypothetical protein  49.12 
 
 
295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4150  hypothetical protein  48.07 
 
 
296 aa  250  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  45.58 
 
 
293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  36.77 
 
 
272 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4569  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.82 
 
 
288 aa  135  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.658744  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  34.87 
 
 
294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2907  luciferase family protein  35.06 
 
 
291 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0407498  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2877  luciferase-like protein  33.56 
 
 
291 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.399246  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2921  luciferase family protein  33.11 
 
 
351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  36.36 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3175  Luciferase-like monooxygenase  34.39 
 
 
278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012092 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4419  Luciferase-like, subgroup  30.18 
 
 
311 aa  124  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3514  Luciferase-like monooxygenase  32.79 
 
 
295 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726686  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4430  luciferase-like  32.49 
 
 
337 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173582  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2183  Luciferase-like monooxygenase  31.65 
 
 
289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  35.23 
 
 
291 aa  115  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  31.88 
 
 
293 aa  115  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1970  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.82 
 
 
293 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  32.97 
 
 
283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  32.97 
 
 
283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4400  Luciferase-like monooxygenase  34.36 
 
 
286 aa  112  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  37.59 
 
 
346 aa  112  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  31.38 
 
 
307 aa  112  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  32.97 
 
 
283 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5600  luciferase-like protein  30.74 
 
 
341 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  35.5 
 
 
281 aa  109  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.92 
 
 
273 aa  109  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4069  luciferase-like protein  32.55 
 
 
339 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3326  luciferase-like protein  34.72 
 
 
286 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3388  Fis family transcriptional regulator  34.72 
 
 
286 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.695689  normal  0.0265519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3337  Fis family transcriptional regulator  34.72 
 
 
286 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122332  normal  0.403039 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2015  luciferase family protein  36.41 
 
 
308 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212649  normal  0.512168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  36.41 
 
 
308 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  36.41 
 
 
308 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4637  luciferase-like protein  28.57 
 
 
293 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4725  luciferase family protein  28.57 
 
 
293 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3595  luciferase family protein  35.14 
 
 
285 aa  106  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26001  normal  0.696176 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2912  luciferase family protein  34.59 
 
 
285 aa  105  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122178  normal  0.460914 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5019  luciferase family protein  28.57 
 
 
293 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  33.87 
 
 
306 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  31.65 
 
 
335 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3368  luciferase family protein  31.94 
 
 
278 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852738  normal  0.168989 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1017  luciferase family protein  34.4 
 
 
276 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2334  Luciferase-like monooxygenase  37.17 
 
 
304 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1645  luciferase family protein  31.03 
 
 
315 aa  103  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5819  luciferase family protein  36.48 
 
 
274 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.762331  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0329  luciferase-like protein  33.8 
 
 
306 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0339  luciferase family protein  33.8 
 
 
306 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.347721 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0318  luciferase family protein  33.8 
 
 
306 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  35.98 
 
 
343 aa  103  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2831  luciferase family protein  31.49 
 
 
290 aa  103  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0272  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.91 
 
 
292 aa  102  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.505051  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4624  luciferase family protein  33.02 
 
 
306 aa  102  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3119  Luciferase-like monooxygenase  33.06 
 
 
299 aa  102  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460925  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5645  luciferase family protein  33.91 
 
 
284 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  34.29 
 
 
309 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3854  Luciferase-like, subgroup  35.18 
 
 
288 aa  99.4  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5167  luciferase family protein  33.33 
 
 
306 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4131  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.15 
 
 
289 aa  99  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  0.0404326 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4027  luciferase family protein  28.95 
 
 
306 aa  99  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.826665 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1979  Luciferase-like monooxygenase  31.94 
 
 
291 aa  98.6  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132329  normal  0.747602 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4343  hypothetical protein  32.14 
 
 
288 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0191984  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  34.47 
 
 
278 aa  98.2  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4429  hypothetical protein  32.14 
 
 
288 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.205104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4723  hypothetical protein  32.14 
 
 
288 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8770  Luciferase-like monooxygenase  32.04 
 
 
295 aa  97.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.547514 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1250  Luciferase-like monooxygenase  36.99 
 
 
296 aa  98.2  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2282  Luciferase-like monooxygenase  29.5 
 
 
312 aa  97.8  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0554594  normal  0.109814 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2400  Luciferase-like monooxygenase  36.5 
 
 
285 aa  96.7  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2703  Luciferase-like monooxygenase  38.78 
 
 
341 aa  96.7  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.190412  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  32.64 
 
 
324 aa  96.3  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7375  Luciferase-like monooxygenase  37.27 
 
 
282 aa  95.9  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.758616 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1590  luciferase family protein  34.91 
 
 
306 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4370  hypothetical protein  33.33 
 
 
284 aa  95.9  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  29.76 
 
 
282 aa  95.1  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  32.77 
 
 
342 aa  95.5  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2248  luciferase family protein  33.7 
 
 
306 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  31.16 
 
 
327 aa  94  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.63 
 
 
277 aa  93.6  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.759524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  33.16 
 
 
299 aa  93.2  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3410  putative F420-dependent oxidoreductase  36.41 
 
 
293 aa  93.2  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.212924  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1334  luciferase-type oxidoreductase  30.25 
 
 
306 aa  92.8  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.33 
 
 
304 aa  92.4  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29280  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.43 
 
 
328 aa  92.4  9e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963848  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  30.43 
 
 
292 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4740  Luciferase-like monooxygenase  30.38 
 
 
330 aa  91.3  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01680  hypothetical protein  36.02 
 
 
319 aa  90.5  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5013  Luciferase-like monooxygenase  34.78 
 
 
288 aa  90.9  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  31.37 
 
 
353 aa  90.5  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4163  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.33 
 
 
285 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.6036  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1857  Luciferase-like monooxygenase  29.76 
 
 
287 aa  90.1  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2634  luciferase family protein  32.83 
 
 
290 aa  90.1  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.112704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  31.58 
 
 
290 aa  89.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4544  luciferase family protein  32.12 
 
 
282 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.178601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.6 
 
 
314 aa  89.7  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>