More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4370 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4370  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0272  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  67.61 
 
 		 292 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.505051  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3854  Luciferase-like, subgroup  70.92 
 
 		 288 aa  395  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1250  Luciferase-like monooxygenase  67.73 
 
 		 296 aa  386  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4723  hypothetical protein  64.18 
 
 		 288 aa  371  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4343  hypothetical protein  63.83 
 
 		 288 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0191984  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4429  hypothetical protein  63.83 
 
 		 288 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.205104 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1850  hypothetical protein  63.6 
 
 		 290 aa  366  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4885  luciferase family protein  63.12 
 
 		 290 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10958  oxidoreductase  64.31 
 
 		 288 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.410507 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5019  luciferase family protein  39.27 
 
 		 293 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4637  luciferase-like protein  39.27 
 
 		 293 aa  201  8e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4725  luciferase family protein  39.27 
 
 		 293 aa  201  8e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2831  luciferase family protein  37.73 
 
 		 290 aa  177  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2634  luciferase family protein  38.1 
 
 		 290 aa  166  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.112704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1970  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.3 
 
 		 293 aa  145  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3595  luciferase family protein  33.58 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26001  normal  0.696176 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2912  luciferase family protein  32.12 
 
 		 285 aa  129  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122178  normal  0.460914 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8770  Luciferase-like monooxygenase  33.81 
 
 		 295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.547514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.26 
 
 		 299 aa  125  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  30.5 
 
 		 272 aa  122  9e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3625  luciferase-like protein  41.29 
 
 		 202 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3326  luciferase-like protein  31.64 
 
 		 286 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3388  Fis family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 286 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.695689  normal  0.0265519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3337  Fis family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 286 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122332  normal  0.403039 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  31.98 
 
 		 294 aa  115  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4400  Luciferase-like monooxygenase  32.6 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  36.06 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4419  Luciferase-like, subgroup  31.18 
 
 		 311 aa  106  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4027  luciferase family protein  29 
 
 		 306 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.826665 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2400  Luciferase-like monooxygenase  36.07 
 
 		 285 aa  103  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6834  luciferase family protein  40.82 
 
 		 327 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4069  luciferase-like protein  33.19 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  28.1 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  31.6 
 
 		 293 aa  99.8  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  35.21 
 
 		 305 aa  99  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5645  luciferase family protein  32.24 
 
 		 284 aa  96.7  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1017  luciferase family protein  33.02 
 
 		 276 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  33.33 
 
 		 298 aa  95.9  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2334  Luciferase-like monooxygenase  35.85 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  30.96 
 
 		 283 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  30.96 
 
 		 283 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  31.88 
 
 		 291 aa  93.2  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2877  luciferase-like protein  32.55 
 
 		 291 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.399246  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3119  Luciferase-like monooxygenase  31.25 
 
 		 299 aa  92.8  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460925  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2907  luciferase family protein  32.55 
 
 		 291 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0407498  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2921  luciferase family protein  32.55 
 
 		 351 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  30.46 
 
 		 283 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  27.17 
 
 		 309 aa  90.9  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  30.68 
 
 		 281 aa  89.7  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3175  Luciferase-like monooxygenase  32.03 
 
 		 278 aa  89.4  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012092 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3368  luciferase family protein  31.38 
 
 		 278 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852738  normal  0.168989 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3410  putative F420-dependent oxidoreductase  36.88 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.212924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3514  Luciferase-like monooxygenase  31.45 
 
 		 295 aa  87.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726686  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3016  hypothetical protein  40.99 
 
 		 295 aa  87.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5819  luciferase family protein  30.88 
 
 		 274 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.762331  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4150  hypothetical protein  40.99 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  31.92 
 
 		 335 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4430  luciferase-like  29.67 
 
 		 337 aa  86.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6951  luciferase family protein  38.85 
 
 		 322 aa  85.9  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  36.2 
 
 		 288 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.22 
 
 		 273 aa  85.5  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  32.84 
 
 		 307 aa  85.1  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  37.76 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  29.86 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1645  luciferase family protein  32.24 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  31.89 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  26.73 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2473  luciferase family protein  31.69 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.702772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4569  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.78 
 
 		 288 aa  82.4  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.658744  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2017  Luciferase-like monooxygenase  27.33 
 
 		 330 aa  82.4  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00175263  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1979  Luciferase-like monooxygenase  29.86 
 
 		 291 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132329  normal  0.747602 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  29.95 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  34.44 
 
 		 346 aa  81.6  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  32.2 
 
 		 334 aa  81.6  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1520  Luciferase-like monooxygenase  32.64 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.784524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  30.85 
 
 		 324 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6444  luciferase family protein  35.51 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2183  Luciferase-like monooxygenase  29.17 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  27.8 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  27.8 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4163  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.48 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.6036  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06300  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.03 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5600  luciferase-like protein  31.19 
 
 		 341 aa  79.7  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1522  Luciferase-like monooxygenase  31.07 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0131104  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  31.38 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  28.88 
 
 		 335 aa  79  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4624  luciferase family protein  30.43 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  34.27 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2015  luciferase family protein  27.41 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212649  normal  0.512168 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3031  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  30.15 
 
 		 557 aa  77  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4899  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  40 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  normal  0.510583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4141  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.11 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  0.0129648 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1636  Luciferase-like monooxygenase  27.27 
 
 		 519 aa  76.3  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0262189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0329  luciferase-like protein  27.98 
 
 		 306 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0339  luciferase family protein  27.98 
 
 		 306 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.347721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2248  luciferase family protein  27.34 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  33.79 
 
 		 764 aa  75.5  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0318  luciferase family protein  27.98 
 
 		 306 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2531  luciferase-like protein  26.11 
 
 		 330 aa  75.5  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>