More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_3031 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_3031  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  100 
 
 		 557 aa  1116    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2483  luciferase-like monooxygenase  84.07 
 
 		 543 aa  922    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.37849 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30060  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  61.08 
 
 		 507 aa  610  1e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2460  putative F420-dependent oxidoreductase  55.04 
 
 		 531 aa  514  1e-144  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.952845  normal  0.0130004 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  67.21 
 
 		 754 aa  402  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  64.65 
 
 		 753 aa  391  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  65.99 
 
 		 764 aa  387  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06300  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  63.55 
 
 		 299 aa  383  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  66.44 
 
 		 299 aa  384  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1522  Luciferase-like monooxygenase  66.44 
 
 		 300 aa  379  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0131104  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1520  Luciferase-like monooxygenase  64.19 
 
 		 298 aa  376  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.784524  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  62.42 
 
 		 758 aa  375  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1636  Luciferase-like monooxygenase  44.32 
 
 		 519 aa  371  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0262189 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3375  luciferase family protein  61.33 
 
 		 308 aa  365  1e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.445995  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0127  FAD linked oxidase domain protein  56.95 
 
 		 775 aa  298  2e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.48716 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3410  putative F420-dependent oxidoreductase  49.82 
 
 		 293 aa  246  6.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.212924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  46.23 
 
 		 752 aa  236  6e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2240  Luciferase-like monooxygenase  40.33 
 
 		 306 aa  184  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.835728  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9025  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  37.95 
 
 		 301 aa  173  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6599  hypothetical protein  37.15 
 
 		 316 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3153  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  40.79 
 
 		 303 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0290174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8878  hypothetical protein  35.29 
 
 		 303 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06290  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.87 
 
 		 734 aa  135  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.945102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.78 
 
 		 726 aa  113  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  40.11 
 
 		 288 aa  111  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  32.93 
 
 		 290 aa  105  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  32.45 
 
 		 343 aa  104  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  29.83 
 
 		 281 aa  97.1  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0109  Luciferase-like monooxygenase  35.24 
 
 		 307 aa  96.7  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2346  luciferase family protein  31.15 
 
 		 316 aa  96.7  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0184001 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4402  luciferase family protein  38.19 
 
 		 371 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.19 
 
 		 299 aa  95.9  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  32.34 
 
 		 282 aa  93.2  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  27.08 
 
 		 328 aa  92.4  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  33.54 
 
 		 288 aa  92.8  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1370  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.78 
 
 		 203 aa  92  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00063873 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4150  hypothetical protein  36.67 
 
 		 296 aa  91.3  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3016  hypothetical protein  36.67 
 
 		 295 aa  91.3  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.9 
 
 		 314 aa  90.9  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0625  Luciferase-like monooxygenase  29.85 
 
 		 332 aa  90.9  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00154415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  26.53 
 
 		 316 aa  90.9  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4671  Luciferase-like monooxygenase  33.2 
 
 		 287 aa  90.5  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.444126  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3119  Luciferase-like monooxygenase  32.82 
 
 		 299 aa  90.1  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460925  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  30.48 
 
 		 308 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2920  luciferase family protein  30.54 
 
 		 291 aa  89  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1857  Luciferase-like monooxygenase  30.6 
 
 		 287 aa  89  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  30.48 
 
 		 308 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2491  luciferase family protein  33.89 
 
 		 310 aa  89  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  normal  0.915237 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.7 
 
 		 311 aa  89  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3380  luciferase family protein  35.86 
 
 		 389 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.94 
 
 		 328 aa  88.2  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29280  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.63 
 
 		 328 aa  88.2  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4404  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  29.83 
 
 		 338 aa  87.8  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27940  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  27.83 
 
 		 262 aa  87.8  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.632404  normal  0.0133043 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  30.3 
 
 		 293 aa  86.3  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2183  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.44 
 
 		 306 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7341  Luciferase-like monooxygenase  32.32 
 
 		 309 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268267 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  34.25 
 
 		 328 aa  85.5  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 327 aa  85.1  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2015  luciferase family protein  31.25 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212649  normal  0.512168 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1645  luciferase family protein  29.39 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  38.1 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  31.23 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2921  luciferase family protein  34.15 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2877  luciferase-like protein  34.15 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.399246  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1898  luciferase-like protein  31.3 
 
 		 391 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749721  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1944  luciferase family protein  31.3 
 
 		 391 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.896213 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0268  luciferase family protein  37.14 
 
 		 313 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0709  Luciferase-like monooxygenase  31.16 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1948  luciferase-like protein  34.63 
 
 		 353 aa  82.4  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2907  luciferase family protein  34.15 
 
 		 291 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0407498  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4489  luciferase-like protein  26.09 
 
 		 338 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2239  oxidoreductase  26.83 
 
 		 264 aa  82  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.317079  hitchhiker  0.00666422 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4576  luciferase family protein  26.09 
 
 		 338 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.149021 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  34.04 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1979  Luciferase-like monooxygenase  31.06 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132329  normal  0.747602 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1878  luciferase family protein  30.89 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.121493 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1696  luciferase family protein  29.29 
 
 		 330 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0698  luciferase family protein  29.17 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281916  normal  0.0356984 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2313  luciferase family protein  35.39 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0072758  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.55 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4872  luciferase family protein  26.09 
 
 		 338 aa  80.9  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.541717  normal  0.0985833 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  30.51 
 
 		 310 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2391  luciferase-like  32.17 
 
 		 351 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.3 
 
 		 339 aa  80.1  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2517  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  37.65 
 
 		 304 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  31.3 
 
 		 349 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5951  Luciferase-like monooxygenase  36.31 
 
 		 308 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.900332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  29.66 
 
 		 307 aa  80.1  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2233  hypothetical protein  27.89 
 
 		 310 aa  80.1  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00182437  decreased coverage  0.00000088983 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  31.3 
 
 		 349 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4102  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  26.86 
 
 		 331 aa  80.1  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.9286  normal  0.155147 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12965  oxidoreductase  35.45 
 
 		 381 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5062  luciferase family protein  29 
 
 		 330 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4419  Luciferase-like, subgroup  25.71 
 
 		 311 aa  79.7  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4599  Luciferase-like monooxygenase  34.71 
 
 		 288 aa  80.1  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2493  luciferase family protein  31.98 
 
 		 372 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0669  Luciferase-like monooxygenase  26.13 
 
 		 342 aa  79.3  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.113099  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6754  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.7 
 
 		 310 aa  79.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0803  putative F420-dependent oxidoreductase  28.11 
 
 		 328 aa  79  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>