128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2183 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2183  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  100 
 
 		 306 aa  622  1e-177  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3761  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  46.53 
 
 		 274 aa  229  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80349  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5424  hypothetical protein  41.72 
 
 		 311 aa  209  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.741222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4541  hypothetical protein  53.29 
 
 		 177 aa  142  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.304332 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2354  hypothetical protein  51.56 
 
 		 142 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2315  hypothetical protein  50.78 
 
 		 142 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2362  hypothetical protein  50.78 
 
 		 142 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.579861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3783  hypothetical protein  47.29 
 
 		 150 aa  129  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2616  hypothetical protein  48.06 
 
 		 149 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1187  hypothetical protein  48.06 
 
 		 146 aa  123  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0885  hypothetical protein  48.18 
 
 		 151 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4211  hypothetical protein  45.97 
 
 		 135 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1156  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  45.1 
 
 		 157 aa  112  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.902168 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1007  hypothetical protein  44.2 
 
 		 140 aa  112  9e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2875 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4642  hypothetical protein  42.19 
 
 		 135 aa  108  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.543378  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0956  hypothetical protein  45.31 
 
 		 161 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2630  hypothetical protein  44.7 
 
 		 153 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.421408  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2675  hypothetical protein  44.7 
 
 		 153 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.313846 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2659  hypothetical protein  44.7 
 
 		 153 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.463167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6160  hypothetical protein  40 
 
 		 144 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1237  hypothetical protein  37.5 
 
 		 157 aa  97.1  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2125  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.87 
 
 		 284 aa  94  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0724883  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2798  hypothetical protein  46.15 
 
 		 140 aa  92.8  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00699009  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11590  hypothetical protein  40.8 
 
 		 148 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.30585e-85  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11000  conserved hypothetical protein TIGR00026  40 
 
 		 138 aa  91.3  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2456  hypothetical protein  38.24 
 
 		 140 aa  89.4  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.597915  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2511  hypothetical protein  42.86 
 
 		 134 aa  89  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00847737  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3104  hypothetical protein  38.1 
 
 		 145 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412887  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0623  hypothetical protein  40.48 
 
 		 144 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3084  hypothetical protein  38.1 
 
 		 145 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3144  hypothetical protein  38.1 
 
 		 145 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.193303  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13580  hypothetical protein  36.3 
 
 		 151 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0664685 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5388  hypothetical protein  38.4 
 
 		 144 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3031  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  35.44 
 
 		 557 aa  86.3  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5355  hypothetical protein  40 
 
 		 145 aa  86.3  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.474804 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2023  hypothetical protein  34.65 
 
 		 145 aa  86.3  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481727  normal  0.406652 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2460  putative F420-dependent oxidoreductase  34.64 
 
 		 531 aa  85.9  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.952845  normal  0.0130004 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4680  hypothetical protein  32.84 
 
 		 150 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4766  hypothetical protein  32.84 
 
 		 150 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.203772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5065  hypothetical protein  32.84 
 
 		 150 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336664  normal  0.524632 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0997  hypothetical protein  41.35 
 
 		 140 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4262  hypothetical protein  37.96 
 
 		 146 aa  85.5  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.877042  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5840  hypothetical protein  42.57 
 
 		 143 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.765788  normal  0.503571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0482  hypothetical protein  35.48 
 
 		 164 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3827  hypothetical protein  37.9 
 
 		 146 aa  84.3  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4989  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.794366  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1416  hypothetical protein  37.98 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61227  normal  0.064122 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0985  hypothetical protein  33.07 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0468293  normal  0.0249112 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1126  hypothetical protein  34.01 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.726493  normal  0.303948 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1375  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.84 
 
 		 168 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3972  hypothetical protein  34.33 
 
 		 169 aa  80.9  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.604025  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10710  conserved hypothetical protein TIGR00026  35.46 
 
 		 360 aa  79.7  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.735464 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2106  hypothetical protein  37.4 
 
 		 177 aa  79.3  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.334754 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0266  hypothetical protein  41.09 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2212  hypothetical protein  36.5 
 
 		 144 aa  79  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2976  hypothetical protein  34.23 
 
 		 163 aa  78.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000649339  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2498  hypothetical protein  35.11 
 
 		 157 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2483  luciferase-like monooxygenase  34.81 
 
 		 543 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.37849 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5096  hypothetical protein  30.94 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0570836  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1559  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  35.71 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336696  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1838  hypothetical protein  38.6 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1126  hypothetical protein  38.05 
 
 		 146 aa  75.5  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.331179  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5872  hypothetical protein  39.2 
 
 		 144 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0817748 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0749  hypothetical protein  38.84 
 
 		 167 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.441888  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0763  hypothetical protein  38.84 
 
 		 167 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0743  hypothetical protein  38.84 
 
 		 167 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.163997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2031  hypothetical protein  41.27 
 
 		 125 aa  73.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0287759  normal  0.679852 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3969  hypothetical protein  35.43 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.827845  normal  0.0645114 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3955  hypothetical protein  34.65 
 
 		 147 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4029  hypothetical protein  34.65 
 
 		 147 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0257  hypothetical protein  31.75 
 
 		 147 aa  70.9  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7866  hypothetical protein  38.71 
 
 		 145 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1505  hypothetical protein  30 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2156  hypothetical protein  38.71 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30060  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.57 
 
 		 507 aa  70.1  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1728  hypothetical protein  36.72 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.247315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3262  hypothetical protein  37.5 
 
 		 155 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5261  hypothetical protein  29.23 
 
 		 168 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11287  hypothetical protein  33.09 
 
 		 149 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.91215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  34.75 
 
 		 324 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4640  hypothetical protein  34.19 
 
 		 143 aa  68.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4153  hypothetical protein  36.8 
 
 		 152 aa  67.8  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1090  hypothetical protein  43.42 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0978  hypothetical protein  38.05 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2620  hypothetical protein  31.2 
 
 		 148 aa  65.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00012961  normal  0.0164615 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1829  hypothetical protein  31.2 
 
 		 169 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0349871  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1876  hypothetical protein  31.2 
 
 		 169 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0838475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1810  hypothetical protein  31.2 
 
 		 169 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0179461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6204  hypothetical protein  34.85 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2718  hypothetical protein  33.81 
 
 		 157 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1328  hypothetical protein  33.93 
 
 		 153 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1820  hypothetical protein  34.68 
 
 		 167 aa  60.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000101682  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1636  Luciferase-like monooxygenase  26.92 
 
 		 519 aa  60.5  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0262189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5225  hypothetical protein  36.75 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0512  hypothetical protein  35.71 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0833  hypothetical protein  32.77 
 
 		 143 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4457  hypothetical protein  34.26 
 
 		 152 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2085  hypothetical protein  39.25 
 
 		 164 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.776425  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0252  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.19 
 
 		 160 aa  58.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0052  hypothetical protein  33.08 
 
 		 159 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0902572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>