More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12965 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12965  oxidoreductase  100 
 
 
381 aa  769    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3380  luciferase family protein  71.16 
 
 
389 aa  550  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5511  luciferase family protein  58.4 
 
 
380 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2493  luciferase family protein  37.89 
 
 
372 aa  209  7e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4402  luciferase family protein  39.5 
 
 
371 aa  200  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952289  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1898  luciferase-like protein  36.96 
 
 
391 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749721  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1944  luciferase family protein  36.96 
 
 
391 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.896213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1878  luciferase family protein  36.96 
 
 
391 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.121493 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1109  luciferase family protein  28.95 
 
 
368 aa  125  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.76 
 
 
318 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0749  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.51 
 
 
323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.57 
 
 
328 aa  110  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.13 
 
 
320 aa  105  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0892  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.19 
 
 
320 aa  96.7  7e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1055  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.19 
 
 
320 aa  96.7  7e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.411528  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1619  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.85 
 
 
320 aa  96.3  8e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.72 
 
 
328 aa  95.9  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0326  Luciferase-like monooxygenase  32.58 
 
 
325 aa  95.1  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  32.6 
 
 
754 aa  85.5  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  23.81 
 
 
328 aa  84.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4387  Luciferase-like, subgroup  31.13 
 
 
339 aa  84  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.128943  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  27.54 
 
 
343 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1117  luciferase family protein  31.75 
 
 
287 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.30712 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2257  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.73 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2274  Luciferase-like monooxygenase  24.72 
 
 
326 aa  79.7  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.800632  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  27.16 
 
 
343 aa  79.7  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4328  luciferase family protein  31.38 
 
 
348 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  36.27 
 
 
299 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4111  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  39.62 
 
 
342 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2018  luciferase family protein  31.38 
 
 
347 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.784882 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0211  luciferase family protein  29.41 
 
 
336 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  31.84 
 
 
282 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2483  luciferase-like monooxygenase  35.08 
 
 
543 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.37849 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  23.64 
 
 
321 aa  77  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1582  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.2 
 
 
349 aa  76.6  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5442  luciferase family protein  33.65 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.942961  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0217  luciferase-like protein  29.37 
 
 
334 aa  75.5  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  28.57 
 
 
335 aa  75.9  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0698  luciferase family protein  28.76 
 
 
336 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281916  normal  0.0356984 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3910  putative F420-dependent oxidoreductase  25.08 
 
 
314 aa  75.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4872  luciferase family protein  24.61 
 
 
338 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.541717  normal  0.0985833 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  22.61 
 
 
328 aa  75.5  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3573  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.16 
 
 
337 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  34.57 
 
 
350 aa  74.7  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  40.25 
 
 
337 aa  74.7  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4489  luciferase-like protein  24.61 
 
 
338 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5063  luciferase-like protein  29.29 
 
 
285 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4576  luciferase family protein  24.61 
 
 
338 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.149021 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5151  luciferase family protein  29.29 
 
 
285 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1948  luciferase-like protein  26.82 
 
 
353 aa  75.5  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  31.75 
 
 
286 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  29.86 
 
 
281 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1696  luciferase family protein  25.23 
 
 
330 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  35.47 
 
 
327 aa  74.7  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8869  Luciferase-like monooxygenase  27.61 
 
 
336 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3375  luciferase family protein  34.95 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.445995  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0076  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.69 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0321839 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0327  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.27 
 
 
328 aa  73.6  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.585505 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0528  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.48 
 
 
328 aa  73.9  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.6 
 
 
334 aa  73.6  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2577  Luciferase-like monooxygenase  33.15 
 
 
344 aa  72.8  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  31.03 
 
 
309 aa  72.4  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.2 
 
 
292 aa  72.8  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0300  Luciferase-like monooxygenase  33.55 
 
 
364 aa  72  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3031  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  35.45 
 
 
557 aa  72  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  27.48 
 
 
327 aa  72  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.67 
 
 
339 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  32.54 
 
 
305 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06300  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.94 
 
 
299 aa  71.2  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1857  Luciferase-like monooxygenase  29.55 
 
 
287 aa  71.2  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.71 
 
 
314 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0981  Luciferase-like monooxygenase  27.5 
 
 
332 aa  71.2  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2491  luciferase family protein  28.4 
 
 
310 aa  70.5  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  normal  0.915237 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1793  luciferase-like protein  30.32 
 
 
347 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2731  luciferase family protein  27.33 
 
 
352 aa  70.9  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1840  luciferase family protein  30.32 
 
 
348 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.175999  normal  0.960587 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0803  putative F420-dependent oxidoreductase  26.16 
 
 
328 aa  70.9  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0860  Luciferase-like monooxygenase  27.19 
 
 
342 aa  70.9  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29280  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  27.89 
 
 
328 aa  70.9  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963848  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2346  luciferase family protein  28.57 
 
 
316 aa  70.5  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0184001 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1861  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1330  Luciferase-like monooxygenase  28.24 
 
 
323 aa  70.5  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  29.39 
 
 
339 aa  70.1  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1522  Luciferase-like monooxygenase  32.98 
 
 
300 aa  70.1  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0131104  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.52 
 
 
339 aa  69.7  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0211  luciferase-like protein  26.87 
 
 
321 aa  69.7  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1636  Luciferase-like monooxygenase  34.22 
 
 
519 aa  70.1  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0262189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5062  luciferase family protein  23.91 
 
 
330 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0813  Luciferase-like monooxygenase  26.22 
 
 
320 aa  69.7  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0625  Luciferase-like monooxygenase  24.38 
 
 
332 aa  69.7  0.00000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00154415  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4102  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  31.61 
 
 
331 aa  69.7  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.9286  normal  0.155147 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3320  luciferase family protein  27.04 
 
 
338 aa  69.3  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3963  putative F420-dependent oxidoreductase  27.99 
 
 
345 aa  69.7  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1687  Luciferase-like monooxygenase  34.07 
 
 
336 aa  69.3  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193576  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4671  Luciferase-like monooxygenase  31.7 
 
 
287 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.444126  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2233  hypothetical protein  30.91 
 
 
310 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00182437  decreased coverage  0.00000088983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8767  hypothetical protein  30.09 
 
 
278 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.430519 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  31.19 
 
 
288 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1774  luciferase-like protein  29.79 
 
 
348 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.72 
 
 
273 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>