More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2577 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2577  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 
344 aa  694    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5730  luciferase family protein  68.3 
 
 
353 aa  489  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24190  methylenetetrahydromethanopterin reductase  67.16 
 
 
343 aa  486  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1433  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  67.44 
 
 
363 aa  476  1e-133  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32144  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4268  luciferase family protein  67.55 
 
 
383 aa  465  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.673509  normal  0.529068 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2098  Luciferase-like monooxygenase  64.26 
 
 
330 aa  429  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0305503  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0223  methylenetetrahydromethanopterin reductase  60.88 
 
 
341 aa  425  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5169  Luciferase-like, subgroup  60.6 
 
 
336 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.840364  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1120  luciferase family protein  45.43 
 
 
333 aa  293  3e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4043  methylenetetrahydromethanopterin reductase  43.49 
 
 
333 aa  289  5.0000000000000004e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0263182  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4257  Luciferase-like monooxygenase  40.53 
 
 
333 aa  266  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.53 
 
 
328 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.13 
 
 
328 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.57 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.9 
 
 
320 aa  107  3e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0749  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.95 
 
 
323 aa  104  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1619  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.22 
 
 
320 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  30.09 
 
 
350 aa  95.1  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1055  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.33 
 
 
320 aa  94.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.411528  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0892  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.33 
 
 
320 aa  94.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7143  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.65 
 
 
345 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0956909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0724  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.87 
 
 
336 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00584154 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  35.48 
 
 
299 aa  85.1  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4162  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.03 
 
 
333 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.945898  normal  0.398456 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0327  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.88 
 
 
328 aa  82  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.585505 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4778  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.33 
 
 
335 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.65 
 
 
339 aa  80.5  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5511  luciferase family protein  27.92 
 
 
380 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  26.71 
 
 
350 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06300  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.41 
 
 
299 aa  77.8  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2483  luciferase-like monooxygenase  34.12 
 
 
543 aa  77  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.37849 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3573  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.99 
 
 
337 aa  77  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0557  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.29 
 
 
335 aa  77  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0316712  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0528  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.45 
 
 
328 aa  76.3  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3948  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.22 
 
 
345 aa  75.9  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0406632  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1582  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.96 
 
 
349 aa  75.5  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  26.71 
 
 
350 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0076  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.64 
 
 
327 aa  74.7  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0321839 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12965  oxidoreductase  33.15 
 
 
381 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2257  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.3 
 
 
328 aa  71.6  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1395  methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.52 
 
 
326 aa  70.9  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.57 
 
 
339 aa  70.1  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1630  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.56 
 
 
333 aa  69.7  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3380  luciferase family protein  32.78 
 
 
389 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1522  Luciferase-like monooxygenase  34.3 
 
 
300 aa  69.3  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0131104  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3836  luciferase-like protein  35.43 
 
 
364 aa  68.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3031  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  32.55 
 
 
557 aa  68.2  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4328  luciferase family protein  31.25 
 
 
348 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3375  luciferase family protein  31.82 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.445995  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4404  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  32.68 
 
 
338 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2018  luciferase family protein  31.03 
 
 
347 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.784882 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1677  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.96 
 
 
325 aa  67.8  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0157  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.56 
 
 
334 aa  67.4  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4112  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.79 
 
 
344 aa  66.2  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.273719  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2731  luciferase family protein  27.09 
 
 
352 aa  65.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  32.41 
 
 
753 aa  65.9  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  27.38 
 
 
351 aa  65.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  30.77 
 
 
343 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3410  putative F420-dependent oxidoreductase  30.18 
 
 
293 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.212924  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10412  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd1  31.79 
 
 
336 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2584  Luciferase-like monooxygenase  33.97 
 
 
359 aa  64.3  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000604781  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  33.98 
 
 
764 aa  64.3  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4111  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  30.87 
 
 
342 aa  63.9  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.71 
 
 
333 aa  63.9  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.19 
 
 
336 aa  63.9  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1774  luciferase-like protein  30.86 
 
 
348 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1898  luciferase-like protein  32.95 
 
 
391 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749721  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9025  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.13 
 
 
301 aa  63.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1944  luciferase family protein  32.95 
 
 
391 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.896213 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30060  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.22 
 
 
507 aa  63.5  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15798  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1793  luciferase-like protein  29.57 
 
 
347 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1840  luciferase family protein  29.57 
 
 
348 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.175999  normal  0.960587 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  27.17 
 
 
346 aa  63.2  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0981332 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2003  Luciferase-like, subgroup  29.27 
 
 
288 aa  63.2  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.749975 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4972  Luciferase-like monooxygenase  27.13 
 
 
317 aa  62.8  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1878  luciferase family protein  32.39 
 
 
391 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.121493 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0211  luciferase family protein  28.22 
 
 
336 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  24.55 
 
 
349 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10133  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd2  31.46 
 
 
360 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4402  luciferase family protein  31.06 
 
 
371 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952289  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1520  Luciferase-like monooxygenase  31.8 
 
 
298 aa  61.6  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.784524  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  27.36 
 
 
346 aa  62  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4431  coenzyme F420-dependent N(5),N(10)-methenyltetrahydromethanopterin  28.48 
 
 
321 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0341  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.7 
 
 
326 aa  60.8  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.256412 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4412  luciferase-like  29.94 
 
 
317 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398031  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3798  Luciferase-like monooxygenase  28.81 
 
 
290 aa  60.5  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.535605  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0217  luciferase-like protein  25.17 
 
 
334 aa  60.1  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  33 
 
 
754 aa  60.1  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  26.47 
 
 
347 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0698  luciferase family protein  28.78 
 
 
336 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281916  normal  0.0356984 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24550  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.9 
 
 
329 aa  59.7  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2439  Luciferase-like monooxygenase  26.24 
 
 
322 aa  59.7  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000186799  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4525  luciferase-like protein  26.2 
 
 
283 aa  59.3  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2391  luciferase-like  27.52 
 
 
351 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  26.89 
 
 
344 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0326  Luciferase-like monooxygenase  25.36 
 
 
325 aa  59.3  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1687  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 
336 aa  58.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193576  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  25.78 
 
 
349 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1399  luciferase family protein  26.61 
 
 
293 aa  58.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00157589 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2778  Luciferase-like monooxygenase  27.5 
 
 
317 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>