More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1677 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1677  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  100 
 
 
325 aa  635    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.19 
 
 
328 aa  157  3e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.67 
 
 
318 aa  152  8e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.33 
 
 
328 aa  150  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.32 
 
 
320 aa  149  7e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3573  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.33 
 
 
337 aa  147  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1395  methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.92 
 
 
326 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0749  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.03 
 
 
323 aa  146  5e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1582  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.61 
 
 
349 aa  144  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0892  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.69 
 
 
320 aa  143  4e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1055  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.69 
 
 
320 aa  143  4e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.411528  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1619  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.1 
 
 
320 aa  143  4e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1680  methylenetetrahydromethanopterin reductase  34.57 
 
 
327 aa  117  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0341  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.76 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.256412 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0327  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.12 
 
 
328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.585505 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0557  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.85 
 
 
335 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0316712  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4412  luciferase-like  40.12 
 
 
317 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398031  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2257  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.49 
 
 
328 aa  106  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.7 
 
 
334 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4431  coenzyme F420-dependent N(5),N(10)-methenyltetrahydromethanopterin  32.2 
 
 
321 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.41 
 
 
336 aa  103  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4112  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.52 
 
 
344 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.273719  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0076  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.7 
 
 
327 aa  102  9e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0321839 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0528  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.6 
 
 
328 aa  102  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.52 
 
 
333 aa  99  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.49 
 
 
332 aa  98.6  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  31.36 
 
 
347 aa  99  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4268  luciferase family protein  29.69 
 
 
383 aa  97.8  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.673509  normal  0.529068 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5617  luciferase-like protein  37.44 
 
 
323 aa  97.1  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461594  normal  0.0935751 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  31.91 
 
 
344 aa  96.3  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1630  methylenetetrahydromethanopterin reductase  35.47 
 
 
333 aa  96.3  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  30.36 
 
 
326 aa  96.3  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3812  putative F420-dependent oxidoreductase  29.36 
 
 
339 aa  96.3  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  30.3 
 
 
327 aa  95.9  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  33.66 
 
 
350 aa  95.9  8e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2504  putative F420-dependent oxidoreductase  31.76 
 
 
344 aa  95.9  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  33.55 
 
 
350 aa  94.7  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1433  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.12 
 
 
363 aa  94.7  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32144  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5015  luciferase family protein  30.47 
 
 
343 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4633  luciferase-like protein  30.47 
 
 
343 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4721  luciferase family protein  30.47 
 
 
343 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265583  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24190  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.35 
 
 
343 aa  91.3  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5730  luciferase family protein  31.5 
 
 
353 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  32.02 
 
 
372 aa  90.1  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2862  Luciferase-like monooxygenase  38.56 
 
 
289 aa  90.1  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.628513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0724  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.98 
 
 
336 aa  90.1  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00584154 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2798  luciferase family protein  32.2 
 
 
341 aa  89.7  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000196172 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3963  putative F420-dependent oxidoreductase  30.95 
 
 
345 aa  88.6  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0217  luciferase-like protein  32.74 
 
 
334 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1861  Luciferase-like monooxygenase  32 
 
 
335 aa  87.8  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  28.62 
 
 
359 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2599  luciferase family protein  31.8 
 
 
348 aa  86.7  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288347  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1539  luciferase family protein  31.85 
 
 
343 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0223  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.03 
 
 
341 aa  84.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.91 
 
 
352 aa  84.3  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  29.29 
 
 
343 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  29.02 
 
 
343 aa  84  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  36.25 
 
 
346 aa  83.6  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3287  Luciferase-like, subgroup  30.58 
 
 
321 aa  83.2  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118077  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4369  F420-dependent oxidoreductase  29.84 
 
 
329 aa  83.2  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.257639  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0783  luciferase family protein  33.53 
 
 
330 aa  83.6  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0447629  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4973  luciferase family protein  30.56 
 
 
360 aa  82.8  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4043  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.83 
 
 
333 aa  81.6  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0263182  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1120  luciferase family protein  26.62 
 
 
333 aa  82  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  28.79 
 
 
337 aa  82  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  31.29 
 
 
350 aa  81.6  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4198  luciferase family protein  38.37 
 
 
317 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66157  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4259  luciferase family protein  31.28 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  39.43 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1386  putative F420-dependent oxidoreductase  35.51 
 
 
361 aa  80.9  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5169  Luciferase-like, subgroup  28.9 
 
 
336 aa  80.5  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.840364  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  32.63 
 
 
327 aa  80.1  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3948  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.89 
 
 
345 aa  79.7  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0406632  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  34.29 
 
 
318 aa  79.3  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4525  luciferase-like protein  30.26 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4515  putative F420-dependent oxidoreductase  26.99 
 
 
346 aa  79.3  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6174  Luciferase-like monooxygenase  34.85 
 
 
293 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.282344  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2731  luciferase family protein  26.56 
 
 
352 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1109  luciferase family protein  23.49 
 
 
368 aa  79  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3309  luciferase family protein  30.56 
 
 
318 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  28.4 
 
 
339 aa  78.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4198  Luciferase-like, subgroup  35.2 
 
 
302 aa  77.8  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1132  Luciferase-like monooxygenase  29.91 
 
 
332 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0218137 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  26.05 
 
 
348 aa  78.2  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2389  luciferase family protein  29.38 
 
 
318 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408058  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  26.18 
 
 
345 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  36.16 
 
 
339 aa  77.4  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3301  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  33.33 
 
 
318 aa  77.4  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5308  Luciferase-like monooxygenase  33.94 
 
 
329 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.406576  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.01 
 
 
327 aa  77  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3836  luciferase-like protein  30.5 
 
 
364 aa  77  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.65 
 
 
322 aa  76.6  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3731  luciferase-like protein  34.62 
 
 
318 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  33.48 
 
 
346 aa  76.6  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3804  luciferase family protein  34.62 
 
 
318 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0754765 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3743  luciferase family protein  34.62 
 
 
318 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.05 
 
 
346 aa  76.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3824  luciferase-like protein  30.37 
 
 
318 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0429165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3898  luciferase family protein  30.37 
 
 
318 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.85 
 
 
339 aa  76.3  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>