More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1680 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1680  methylenetetrahydromethanopterin reductase  100 
 
 
327 aa  649    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0341  methylenetetrahydromethanopterin reductase  64.47 
 
 
326 aa  402  1e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.256412 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3573  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  62.81 
 
 
337 aa  394  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1395  methylenetetrahydromethanopterin reductase  59.26 
 
 
326 aa  385  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1582  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  60.68 
 
 
349 aa  384  1e-105  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  37 
 
 
328 aa  222  7e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  36.84 
 
 
320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  37.04 
 
 
318 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1055  methylenetetrahydromethanopterin reductase  38.27 
 
 
320 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.411528  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0892  methylenetetrahydromethanopterin reductase  38.27 
 
 
320 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1619  methylenetetrahydromethanopterin reductase  39.2 
 
 
320 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0749  methylenetetrahydromethanopterin reductase  36.84 
 
 
323 aa  207  2e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0327  methylenetetrahydromethanopterin reductase  36.81 
 
 
328 aa  206  6e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.585505 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  37.54 
 
 
328 aa  204  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0528  methylenetetrahydromethanopterin reductase  36.81 
 
 
328 aa  202  5e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2257  methylenetetrahydromethanopterin reductase  36.2 
 
 
328 aa  199  5e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0557  methylenetetrahydromethanopterin reductase  34.86 
 
 
335 aa  195  1e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0316712  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0076  methylenetetrahydromethanopterin reductase  35.8 
 
 
327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0321839 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0724  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.15 
 
 
336 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00584154 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.55 
 
 
333 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.9 
 
 
336 aa  112  7.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0856  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.04 
 
 
356 aa  109  7.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1677  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  34.57 
 
 
325 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.8 
 
 
332 aa  106  7e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0157  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.28 
 
 
334 aa  104  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.6 
 
 
327 aa  97.4  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1630  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.9 
 
 
333 aa  95.9  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  28.77 
 
 
326 aa  94  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0860  Luciferase-like monooxygenase  28.57 
 
 
342 aa  93.6  4e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  26.72 
 
 
348 aa  88.6  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  28.67 
 
 
335 aa  87.8  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  29.67 
 
 
347 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3948  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.76 
 
 
345 aa  87.4  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0406632  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  29.9 
 
 
340 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  26.96 
 
 
327 aa  87  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  29.9 
 
 
340 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.9 
 
 
340 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.85 
 
 
352 aa  85.5  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  27.81 
 
 
344 aa  85.1  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  28.48 
 
 
359 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0319  luciferase family protein  28.18 
 
 
349 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514626  normal  0.781231 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2731  luciferase family protein  29.97 
 
 
352 aa  84  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2504  putative F420-dependent oxidoreductase  31.78 
 
 
344 aa  84  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4583  luciferase family protein  27.88 
 
 
349 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4588  luciferase family protein  28.12 
 
 
349 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3963  putative F420-dependent oxidoreductase  30.92 
 
 
345 aa  83.2  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  29.55 
 
 
343 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  29.7 
 
 
346 aa  82.8  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1109  luciferase family protein  25.4 
 
 
368 aa  82  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4412  luciferase-like  28.62 
 
 
317 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398031  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  26.81 
 
 
344 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  27.81 
 
 
345 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  25.87 
 
 
345 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1687  Luciferase-like monooxygenase  32.03 
 
 
336 aa  80.5  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193576  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1539  luciferase family protein  31.62 
 
 
343 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.09 
 
 
314 aa  80.1  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  29.17 
 
 
339 aa  79.3  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1199  luciferase family protein  35.66 
 
 
281 aa  79  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0358  luciferase family protein  30.19 
 
 
348 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0223  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.14 
 
 
341 aa  77.8  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.97 
 
 
346 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  24.92 
 
 
349 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3301  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  32.24 
 
 
318 aa  77  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  24.61 
 
 
349 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  32.34 
 
 
372 aa  76.6  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  24.61 
 
 
349 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  25.38 
 
 
346 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.15 
 
 
339 aa  76.3  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4576  putative oxidoreductase  28.8 
 
 
355 aa  75.9  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.248726  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1978  luciferase-like protein  30.19 
 
 
357 aa  75.5  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4431  coenzyme F420-dependent N(5),N(10)-methenyltetrahydromethanopterin  28.38 
 
 
321 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4633  luciferase-like protein  29.74 
 
 
343 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1188  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  31.87 
 
 
318 aa  75.1  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4721  luciferase family protein  29.74 
 
 
343 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265583  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4268  luciferase family protein  27.44 
 
 
383 aa  75.1  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.673509  normal  0.529068 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5015  luciferase family protein  29.74 
 
 
343 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  27.71 
 
 
337 aa  74.7  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4324  luciferase-like protein  34.21 
 
 
282 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4410  luciferase family protein  34.21 
 
 
282 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287539  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4704  luciferase family protein  34.21 
 
 
282 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.405552  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1995  putative F420-dependent oxidoreductase  25.6 
 
 
346 aa  73.9  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4102  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  31.22 
 
 
331 aa  73.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.9286  normal  0.155147 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4864  luciferase family protein  33.99 
 
 
282 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0725656  normal  0.117116 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1563  luciferase family protein  31.79 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  20.96 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10133  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd2  29.79 
 
 
360 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3812  putative F420-dependent oxidoreductase  28.62 
 
 
339 aa  71.6  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1519  luciferase-like protein  28.09 
 
 
349 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0217  luciferase-like protein  27.19 
 
 
334 aa  72  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1542  luciferase family protein  28.09 
 
 
349 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240997  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2493  luciferase family protein  29.04 
 
 
372 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4148  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  30.16 
 
 
331 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168027  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10971  oxidoreductase  32.24 
 
 
290 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0930752  normal  0.92148 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  27.68 
 
 
343 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  30.07 
 
 
342 aa  70.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0698  luciferase family protein  27.66 
 
 
336 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281916  normal  0.0356984 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00690  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.62 
 
 
331 aa  70.5  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.889784  normal  0.0731127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  29.74 
 
 
327 aa  70.1  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1815  luciferase family protein  32.4 
 
 
289 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  30.9 
 
 
346 aa  70.5  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>