More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1563 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1563  luciferase family protein  100 
 
 
299 aa  585  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6389  luciferase family protein  47.46 
 
 
298 aa  222  7e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1552  Luciferase-like monooxygenase  36.66 
 
 
284 aa  189  7e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4790  luciferase-like protein  46.15 
 
 
284 aa  188  9e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5156  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  45.74 
 
 
203 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3462  Luciferase-like, subgroup  36.3 
 
 
281 aa  138  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.22909 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1652  Luciferase-like monooxygenase  37.99 
 
 
296 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0921038  normal  0.0160005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2329  Luciferase-like monooxygenase  40.76 
 
 
339 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  31.88 
 
 
309 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1675  luciferase family protein  39.59 
 
 
311 aa  116  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2353  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  36.1 
 
 
287 aa  115  6.9999999999999995e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0900  luciferase-like protein  37.13 
 
 
284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1583  luciferase family protein  36.36 
 
 
289 aa  113  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  39.18 
 
 
307 aa  112  8.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7341  Luciferase-like monooxygenase  38.66 
 
 
309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268267 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1926  hypothetical protein  39.11 
 
 
313 aa  110  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2280  luciferase-like monooxygenase  41.71 
 
 
305 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101166  normal  0.0450195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6754  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  39.68 
 
 
310 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0629  luciferase family protein  38.17 
 
 
319 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0662642 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  36.41 
 
 
306 aa  104  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  32.99 
 
 
299 aa  102  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  37.64 
 
 
311 aa  101  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  35.43 
 
 
310 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4271  luciferase family protein  38.66 
 
 
316 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0653657  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0268  luciferase family protein  37.57 
 
 
313 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  37.57 
 
 
308 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0709  Luciferase-like monooxygenase  38.46 
 
 
307 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2867  putative F420-dependent oxidoreductase  35.27 
 
 
311 aa  99.4  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2346  luciferase family protein  36.07 
 
 
316 aa  99.4  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0184001 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  37.72 
 
 
290 aa  99.4  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  36.05 
 
 
310 aa  99  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0109  Luciferase-like monooxygenase  36.56 
 
 
307 aa  98.6  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  33.2 
 
 
309 aa  97.4  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5951  Luciferase-like monooxygenase  33.18 
 
 
308 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.900332  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6911  luciferase family protein  40.12 
 
 
325 aa  96.7  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0395  Luciferase-like monooxygenase  36.36 
 
 
306 aa  95.9  8e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.104379  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2491  luciferase family protein  40.23 
 
 
310 aa  95.1  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  normal  0.915237 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3880  luciferase family protein  37.11 
 
 
316 aa  95.5  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  37.31 
 
 
299 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0454  Luciferase-like monooxygenase  35.87 
 
 
322 aa  94.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0451  luciferase-like protein  36.84 
 
 
309 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  29.49 
 
 
293 aa  94.4  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0462  luciferase family protein  36.84 
 
 
312 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4069  luciferase-like protein  30.26 
 
 
339 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  28.34 
 
 
288 aa  94.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0438  luciferase family protein  36.84 
 
 
309 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.465558  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3595  luciferase family protein  35.38 
 
 
285 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26001  normal  0.696176 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5167  luciferase family protein  37.97 
 
 
306 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3119  Luciferase-like monooxygenase  35.29 
 
 
299 aa  92.8  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460925  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  37.95 
 
 
292 aa  92.8  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1342  Luciferase-like monooxygenase  37.43 
 
 
311 aa  92.8  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.256746  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  30.56 
 
 
281 aa  92.4  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0329  luciferase-like protein  36.71 
 
 
306 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0339  luciferase family protein  36.71 
 
 
306 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.347721 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0318  luciferase family protein  36.71 
 
 
306 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3155  putative F420-dependent oxidoreductase  36.9 
 
 
321 aa  90.9  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00585618 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3286  luciferase family protein  35.53 
 
 
307 aa  90.5  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2912  luciferase family protein  35.9 
 
 
285 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122178  normal  0.460914 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1857  Luciferase-like monooxygenase  32.94 
 
 
287 aa  90.1  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  31.23 
 
 
282 aa  89.7  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1590  luciferase family protein  36.71 
 
 
306 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3326  luciferase-like protein  34.05 
 
 
286 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2313  luciferase family protein  36.27 
 
 
316 aa  89.7  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0072758  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3388  Fis family transcriptional regulator  34.05 
 
 
286 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.695689  normal  0.0265519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3337  Fis family transcriptional regulator  34.05 
 
 
286 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122332  normal  0.403039 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2999  Luciferase-like monooxygenase  35.16 
 
 
294 aa  89  9e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.547071  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  29.7 
 
 
341 aa  88.2  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4489  luciferase-like protein  32.57 
 
 
338 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4576  luciferase family protein  32.57 
 
 
338 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.149021 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4624  luciferase family protein  34.76 
 
 
306 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4872  luciferase family protein  32.57 
 
 
338 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.541717  normal  0.0985833 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5063  luciferase-like protein  40.88 
 
 
285 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0282  luciferase-like protein  40.34 
 
 
305 aa  87.8  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5151  luciferase family protein  40.88 
 
 
285 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  34.5 
 
 
334 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  31.72 
 
 
324 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5442  luciferase family protein  40.88 
 
 
285 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.942961  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4906  luciferase family protein  39.11 
 
 
325 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.089783  normal  0.0157174 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  34.5 
 
 
334 aa  87  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3231  putative F420-dependent oxidoreductase  37.57 
 
 
324 aa  86.7  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4027  luciferase family protein  32.46 
 
 
306 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.826665 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  31.07 
 
 
346 aa  85.9  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.75 
 
 
277 aa  85.5  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.759524 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5062  luciferase family protein  32.96 
 
 
330 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3697  putative F420-dependent oxidoreductase  34.88 
 
 
308 aa  84.7  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11883  oxidoreductase  35.14 
 
 
307 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  34.41 
 
 
281 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4400  Luciferase-like monooxygenase  35.2 
 
 
286 aa  83.6  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  37.72 
 
 
286 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3259  luciferase family protein  33.18 
 
 
350 aa  83.2  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1886  luciferase-like  37.43 
 
 
287 aa  83.2  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.5944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2848  Luciferase-like monooxygenase  36.94 
 
 
306 aa  82.8  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  32.28 
 
 
288 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2659  luciferase-like  33.81 
 
 
327 aa  82.8  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0969127 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0211  luciferase-like protein  27 
 
 
321 aa  82.8  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  32.98 
 
 
293 aa  82.4  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  31.39 
 
 
354 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3410  putative F420-dependent oxidoreductase  31.67 
 
 
293 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.212924  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  34.42 
 
 
343 aa  81.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  38.2 
 
 
314 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>