More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3259 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3259  luciferase family protein  100 
 
 		 350 aa  715    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0516  luciferase family protein  58.23 
 
 		 327 aa  371  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6911  luciferase family protein  60.75 
 
 		 325 aa  366  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2659  luciferase-like  36.92 
 
 		 327 aa  192  6e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0969127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2517  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  39.44 
 
 		 304 aa  186  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3381  luciferase family protein  34.83 
 
 		 337 aa  175  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0757  luciferase family protein  36.48 
 
 		 310 aa  157  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  0.787392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2329  Luciferase-like monooxygenase  33.23 
 
 		 339 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0213  putative F420-dependent oxidoreductase  33.9 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0173  putative F420-dependent oxidoreductase  34.11 
 
 		 326 aa  153  5e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.182486  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39070  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.56 
 
 		 296 aa  150  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1139  putative F420-dependent oxidoreductase  33.54 
 
 		 289 aa  142  7e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2418  Luciferase-like monooxygenase  34.56 
 
 		 311 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00430888  hitchhiker  0.005997 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4930  luciferase family protein  33.65 
 
 		 274 aa  133  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0362878  normal  0.0194962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3123  Luciferase-like monooxygenase  32.42 
 
 		 312 aa  132  9e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.23873  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0629  luciferase family protein  38.64 
 
 		 319 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662642 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12907  oxidoreductase  31.56 
 
 		 325 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000227121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1815  luciferase family protein  32.5 
 
 		 289 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  40.1 
 
 		 290 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0268  luciferase family protein  37.33 
 
 		 313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0317  Luciferase-like monooxygenase  30.63 
 
 		 287 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.37 
 
 		 311 aa  112  9e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  37.29 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1675  luciferase family protein  30.93 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3910  putative F420-dependent oxidoreductase  37.04 
 
 		 314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  33.49 
 
 		 281 aa  109  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  32.04 
 
 		 309 aa  109  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29280  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  39.23 
 
 		 328 aa  109  8.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0462  luciferase family protein  34.58 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0451  luciferase-like protein  34.89 
 
 		 309 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00720803  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4740  Luciferase-like monooxygenase  39.13 
 
 		 330 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0205  luciferase family protein  31.35 
 
 		 316 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0438  luciferase family protein  34.89 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.465558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4374  luciferase-like protein  34.15 
 
 		 274 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111927  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4461  luciferase family protein  34.15 
 
 		 274 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0432852  normal  0.0185115 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4755  luciferase family protein  34.15 
 
 		 274 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.377838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1926  hypothetical protein  34.96 
 
 		 313 aa  105  9e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3697  putative F420-dependent oxidoreductase  36.46 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6754  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.94 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  32.97 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2313  luciferase family protein  37.37 
 
 		 316 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0072758  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3286  luciferase family protein  36.13 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  35.16 
 
 		 310 aa  104  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4271  luciferase family protein  35.56 
 
 		 316 aa  103  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0653657  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  30.48 
 
 		 328 aa  102  8e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3880  luciferase family protein  36 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10807  hypothetical protein  30.34 
 
 		 347 aa  102  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000229169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  32.46 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7341  Luciferase-like monooxygenase  34.95 
 
 		 309 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268267 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1342  Luciferase-like monooxygenase  32.51 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.256746  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2248  luciferase family protein  32.3 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  32.46 
 
 		 310 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0803  putative F420-dependent oxidoreductase  35.45 
 
 		 328 aa  99.8  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4671  Luciferase-like monooxygenase  40 
 
 		 287 aa  99.4  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.444126  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  36.21 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2867  putative F420-dependent oxidoreductase  35.38 
 
 		 311 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4489  luciferase-like protein  35.68 
 
 		 338 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  30.98 
 
 		 293 aa  98.6  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4576  luciferase family protein  35.68 
 
 		 338 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.149021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4872  luciferase family protein  35.68 
 
 		 338 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.541717  normal  0.0985833 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  37.13 
 
 		 292 aa  97.4  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3320  luciferase family protein  36.84 
 
 		 338 aa  97.1  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  33.17 
 
 		 308 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  33.17 
 
 		 308 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4065  Luciferase-like monooxygenase  29.22 
 
 		 290 aa  96.3  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.247001 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1419  Luciferase-like monooxygenase  30.99 
 
 		 293 aa  95.9  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  41.26 
 
 		 324 aa  95.9  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  32.34 
 
 		 288 aa  95.5  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  29.82 
 
 		 316 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3077  luciferase family protein  36.67 
 
 		 309 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5062  luciferase family protein  36.02 
 
 		 330 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2999  Luciferase-like monooxygenase  37.16 
 
 		 294 aa  95.5  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.547071  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  40.15 
 
 		 282 aa  95.1  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2015  luciferase family protein  35 
 
 		 308 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212649  normal  0.512168 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2280  luciferase-like monooxygenase  34.05 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101166  normal  0.0450195 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1696  luciferase family protein  36.02 
 
 		 330 aa  94  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2233  hypothetical protein  37.2 
 
 		 310 aa  94  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00182437  decreased coverage  0.00000088983 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  31.77 
 
 		 288 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2920  luciferase family protein  38.33 
 
 		 291 aa  93.6  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  34.88 
 
 		 308 aa  92.8  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2107  Luciferase-like monooxygenase  38.73 
 
 		 330 aa  92.8  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.950748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.92 
 
 		 277 aa  92.8  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.759524 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1330  Luciferase-like monooxygenase  28.28 
 
 		 323 aa  92.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0109  Luciferase-like monooxygenase  35.5 
 
 		 307 aa  92.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0709  Luciferase-like monooxygenase  33.17 
 
 		 307 aa  92  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2014  luciferase family protein  34.29 
 
 		 313 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.371395 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2031  luciferase-like protein  34.29 
 
 		 313 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2077  luciferase family protein  34.29 
 
 		 313 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.841403 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  39.55 
 
 		 286 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  32.68 
 
 		 336 aa  90.5  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5063  luciferase-like protein  40.6 
 
 		 285 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5151  luciferase family protein  40.6 
 
 		 285 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5442  luciferase family protein  40.6 
 
 		 285 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.942961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3738  luciferase-like  32.08 
 
 		 294 aa  89.7  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.945207 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1117  luciferase family protein  41.04 
 
 		 287 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.30712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5951  Luciferase-like monooxygenase  33.85 
 
 		 308 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.900332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1563  luciferase family protein  34.26 
 
 		 299 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.39 
 
 		 306 aa  89  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4624  luciferase family protein  32.24 
 
 		 306 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0395  Luciferase-like monooxygenase  29.44 
 
 		 306 aa  88.2  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.104379  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>