More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2659 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2659  luciferase-like  100 
 
 		 327 aa  657    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0969127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2329  Luciferase-like monooxygenase  44.16 
 
 		 339 aa  252  7e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3381  luciferase family protein  42.32 
 
 		 337 aa  241  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2517  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  46.95 
 
 		 304 aa  226  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0213  putative F420-dependent oxidoreductase  40.56 
 
 		 336 aa  209  6e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2418  Luciferase-like monooxygenase  41.51 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00430888  hitchhiker  0.005997 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6911  luciferase family protein  39.45 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3259  luciferase family protein  36.92 
 
 		 350 aa  200  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0516  luciferase family protein  40.73 
 
 		 327 aa  193  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0173  putative F420-dependent oxidoreductase  38.08 
 
 		 326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.182486  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0757  luciferase family protein  38.62 
 
 		 310 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  0.787392 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3123  Luciferase-like monooxygenase  38.87 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.23873  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0205  luciferase family protein  34.59 
 
 		 316 aa  155  9e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12907  oxidoreductase  35.53 
 
 		 325 aa  145  6e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000227121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39070  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.18 
 
 		 296 aa  143  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0791  Luciferase-like monooxygenase  33.81 
 
 		 307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.393824  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  49.32 
 
 		 282 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1139  putative F420-dependent oxidoreductase  32.36 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0629  luciferase family protein  35.64 
 
 		 319 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0317  Luciferase-like monooxygenase  34.27 
 
 		 287 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4930  luciferase family protein  34.3 
 
 		 274 aa  127  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0362878  normal  0.0194962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  35.55 
 
 		 310 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.53 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1675  luciferase family protein  42.53 
 
 		 311 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  45.58 
 
 		 281 aa  122  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  47.06 
 
 		 290 aa  122  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  33.21 
 
 		 310 aa  122  9e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0268  luciferase family protein  40.76 
 
 		 313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  38.73 
 
 		 343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3880  luciferase family protein  36 
 
 		 316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4271  luciferase family protein  38.79 
 
 		 316 aa  119  9e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0653657  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  38.28 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3910  putative F420-dependent oxidoreductase  37.23 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.83 
 
 		 306 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6754  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  37.57 
 
 		 310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0109  Luciferase-like monooxygenase  34.19 
 
 		 307 aa  113  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5062  luciferase family protein  30.88 
 
 		 330 aa  113  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0451  luciferase-like protein  41.86 
 
 		 309 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0462  luciferase family protein  41.86 
 
 		 312 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1815  luciferase family protein  30.1 
 
 		 289 aa  112  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  43.45 
 
 		 286 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0438  luciferase family protein  41.86 
 
 		 309 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.465558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2031  luciferase-like protein  39.44 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2077  luciferase family protein  39.44 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.841403 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1857  Luciferase-like monooxygenase  32.77 
 
 		 287 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4374  luciferase-like protein  34.09 
 
 		 274 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111927  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4461  luciferase family protein  34.09 
 
 		 274 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0432852  normal  0.0185115 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4755  luciferase family protein  34.09 
 
 		 274 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.377838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0709  Luciferase-like monooxygenase  38.73 
 
 		 307 aa  109  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4671  Luciferase-like monooxygenase  44.68 
 
 		 287 aa  109  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.444126  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4489  luciferase-like protein  34.55 
 
 		 338 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4576  luciferase family protein  34.55 
 
 		 338 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.149021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4872  luciferase family protein  34.55 
 
 		 338 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.541717  normal  0.0985833 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2313  luciferase family protein  34.33 
 
 		 316 aa  109  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0072758  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2280  luciferase-like monooxygenase  38.15 
 
 		 305 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101166  normal  0.0450195 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3231  putative F420-dependent oxidoreductase  40.24 
 
 		 324 aa  108  9.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2014  luciferase family protein  38.89 
 
 		 313 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.371395 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0202  Luciferase-like monooxygenase  28.47 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1117  luciferase family protein  42.76 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.30712 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4972  Luciferase-like monooxygenase  38.24 
 
 		 317 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7341  Luciferase-like monooxygenase  32.84 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268267 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  39.88 
 
 		 292 aa  107  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1926  hypothetical protein  31.06 
 
 		 313 aa  106  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2491  luciferase family protein  32.53 
 
 		 310 aa  106  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  normal  0.915237 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5063  luciferase-like protein  40.69 
 
 		 285 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0395  Luciferase-like monooxygenase  40.35 
 
 		 306 aa  106  6e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.104379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5151  luciferase family protein  40.69 
 
 		 285 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5442  luciferase family protein  40.69 
 
 		 285 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.942961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3286  luciferase family protein  32.32 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0803  putative F420-dependent oxidoreductase  33 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  32.34 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  33.52 
 
 		 316 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10807  hypothetical protein  35.54 
 
 		 347 aa  104  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000229169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  30.48 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3320  luciferase family protein  36.88 
 
 		 338 aa  103  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0998  luciferase family protein  38.46 
 
 		 290 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2346  luciferase family protein  31.06 
 
 		 316 aa  102  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0184001 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1696  luciferase family protein  29.51 
 
 		 330 aa  102  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3738  luciferase-like  39.25 
 
 		 294 aa  102  9e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.945207 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29280  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.11 
 
 		 328 aa  102  9e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963848  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2867  putative F420-dependent oxidoreductase  33.99 
 
 		 311 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2107  Luciferase-like monooxygenase  33 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.950748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0211  luciferase-like protein  33.33 
 
 		 321 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0981  Luciferase-like monooxygenase  30.65 
 
 		 332 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3697  putative F420-dependent oxidoreductase  37.43 
 
 		 308 aa  99.8  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5951  Luciferase-like monooxygenase  38.51 
 
 		 308 aa  99.8  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.900332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1342  Luciferase-like monooxygenase  30.45 
 
 		 311 aa  99.4  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.256746  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  35.03 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1330  Luciferase-like monooxygenase  34.34 
 
 		 323 aa  97.8  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4740  Luciferase-like monooxygenase  31.27 
 
 		 330 aa  97.8  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1948  luciferase-like protein  38.1 
 
 		 353 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3155  putative F420-dependent oxidoreductase  38.93 
 
 		 321 aa  96.7  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00585618 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0282  luciferase-like protein  33.58 
 
 		 305 aa  96.7  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2274  Luciferase-like monooxygenase  35.54 
 
 		 326 aa  96.7  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.800632  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  35.5 
 
 		 292 aa  96.7  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43560  dimethyl sulfone monooxygenase; SfnG  32.77 
 
 		 364 aa  96.3  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0372146  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2233  hypothetical protein  37.58 
 
 		 310 aa  95.9  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00182437  decreased coverage  0.00000088983 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1324  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.75 
 
 		 261 aa  95.9  8e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  38.58 
 
 		 308 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  38.58 
 
 		 308 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.62194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>