More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_00690 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_00690  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  100 
 
 
331 aa  641    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.889784  normal  0.0731127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2778  Luciferase-like monooxygenase  61.28 
 
 
317 aa  325  5e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3359  Luciferase-like, subgroup  61.02 
 
 
318 aa  290  3e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0118033 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3725  luciferase family protein  56.91 
 
 
316 aa  282  6.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.290268  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4112  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  38.8 
 
 
344 aa  173  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.273719  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2621  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  40.85 
 
 
278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2003  Luciferase-like, subgroup  38.21 
 
 
288 aa  135  9e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.749975 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5617  luciferase-like protein  38.18 
 
 
323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461594  normal  0.0935751 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2862  Luciferase-like monooxygenase  41.75 
 
 
289 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.628513 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3798  Luciferase-like monooxygenase  39.6 
 
 
290 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.535605  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.78 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1630  methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.69 
 
 
333 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.62 
 
 
318 aa  102  9e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.84 
 
 
320 aa  101  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3948  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.99 
 
 
345 aa  100  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0406632  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0749  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25 
 
 
323 aa  99  9e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0327  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.01 
 
 
328 aa  97.4  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.585505 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.78 
 
 
328 aa  91.3  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3573  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.5 
 
 
337 aa  90.5  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0528  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.31 
 
 
328 aa  89.7  6e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2257  methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.99 
 
 
328 aa  89.4  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  32.43 
 
 
344 aa  86.3  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0557  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.07 
 
 
335 aa  85.9  8e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0316712  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0157  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.99 
 
 
334 aa  84.7  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1619  methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.84 
 
 
320 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1582  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.05 
 
 
349 aa  81.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0892  methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.84 
 
 
320 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1055  methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.84 
 
 
320 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.411528  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.46 
 
 
352 aa  79.7  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1395  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.79 
 
 
326 aa  79  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  28.18 
 
 
343 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0076  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.23 
 
 
327 aa  77.4  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0321839 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0724  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.8 
 
 
336 aa  77  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00584154 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4412  luciferase-like  27.59 
 
 
317 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398031  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4047  luciferase family protein  33.33 
 
 
347 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal  0.465581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.66 
 
 
314 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  30.31 
 
 
335 aa  73.2  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5730  luciferase family protein  30.47 
 
 
353 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.53 
 
 
336 aa  71.2  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  34.68 
 
 
333 aa  70.9  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0341  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.95 
 
 
326 aa  70.5  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.256412 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  30.12 
 
 
327 aa  70.5  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4431  coenzyme F420-dependent N(5),N(10)-methenyltetrahydromethanopterin  27.45 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  28.62 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2439  Luciferase-like monooxygenase  30.6 
 
 
322 aa  68.9  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000186799  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  30.96 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  27.41 
 
 
349 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  27.41 
 
 
349 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  30 
 
 
349 aa  67.8  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.98 
 
 
322 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  27.41 
 
 
349 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4268  luciferase family protein  33.33 
 
 
383 aa  67.8  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.673509  normal  0.529068 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 
350 aa  67  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4588  luciferase family protein  27.3 
 
 
349 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7143  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.31 
 
 
345 aa  67.4  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0956909 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1677  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.61 
 
 
325 aa  67  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1687  Luciferase-like monooxygenase  30.17 
 
 
336 aa  66.6  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193576  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30 
 
 
361 aa  66.6  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.5 
 
 
332 aa  66.2  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2798  luciferase family protein  34.45 
 
 
341 aa  66.2  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000196172 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.38 
 
 
339 aa  65.9  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2761  luciferase-like  28.42 
 
 
353 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2852  luciferase family protein  30.74 
 
 
314 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.709446  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2599  luciferase family protein  34.87 
 
 
348 aa  65.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288347  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  27.85 
 
 
340 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0217  luciferase-like protein  29.21 
 
 
334 aa  65.1  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0223  methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.6 
 
 
341 aa  64.3  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1533  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.21 
 
 
323 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0482478  normal  0.0346737 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  27.85 
 
 
340 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.85 
 
 
340 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4328  luciferase family protein  27.6 
 
 
348 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  27.07 
 
 
359 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1132  Luciferase-like monooxygenase  28.87 
 
 
332 aa  63.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0218137 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4065  luciferase family protein  29.01 
 
 
344 aa  63.9  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2018  luciferase family protein  27.6 
 
 
347 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.784882 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1680  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.62 
 
 
327 aa  63.9  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  34.71 
 
 
346 aa  63.5  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1071  hypothetical protein  28.01 
 
 
304 aa  63.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0319  luciferase family protein  26.52 
 
 
349 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514626  normal  0.781231 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  28.73 
 
 
326 aa  63.2  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.65 
 
 
339 aa  62.8  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4043  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.67 
 
 
333 aa  62  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0263182  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7266  hypothetical protein  28.62 
 
 
334 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1120  luciferase family protein  30.77 
 
 
333 aa  62.4  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3836  luciferase-like protein  31.76 
 
 
364 aa  62.4  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24190  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.63 
 
 
343 aa  62.4  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  26.42 
 
 
344 aa  62  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1433  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.48 
 
 
363 aa  61.2  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32144  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  26.77 
 
 
348 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.09 
 
 
327 aa  62  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.84 
 
 
346 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0484  luciferase-like protein  31.28 
 
 
330 aa  60.8  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.573719  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0086  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  26.44 
 
 
313 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4515  putative F420-dependent oxidoreductase  30.28 
 
 
346 aa  60.8  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  31.35 
 
 
372 aa  60.5  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  22.54 
 
 
321 aa  60.5  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.35 
 
 
351 aa  60.5  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4583  luciferase family protein  26.52 
 
 
349 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1774  luciferase-like protein  26.04 
 
 
348 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  29.45 
 
 
327 aa  59.7  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>