More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4515 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4515  putative F420-dependent oxidoreductase  100 
 
 		 346 aa  692    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  68.7 
 
 		 346 aa  501  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  68.12 
 
 		 348 aa  496  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  64.83 
 
 		 344 aa  472  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  64.83 
 
 		 345 aa  454  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  64.53 
 
 		 346 aa  456  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  63.95 
 
 		 349 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  63.95 
 
 		 349 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  63.95 
 
 		 349 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1995  putative F420-dependent oxidoreductase  63.77 
 
 		 346 aa  452  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2391  luciferase-like  62.9 
 
 		 351 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  60.64 
 
 		 345 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1057  putative F420-dependent oxidoreductase  56.57 
 
 		 354 aa  404  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  57.89 
 
 		 346 aa  395  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4576  putative oxidoreductase  61.27 
 
 		 355 aa  394  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.248726  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0860  Luciferase-like monooxygenase  57.43 
 
 		 342 aa  369  1e-101  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1519  luciferase-like protein  53.18 
 
 		 349 aa  359  5e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3612  luciferase family protein  57.82 
 
 		 342 aa  359  5e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1542  luciferase family protein  53.18 
 
 		 349 aa  359  5e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240997  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  46.92 
 
 		 349 aa  285  9e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  48.85 
 
 		 344 aa  281  8.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  48.72 
 
 		 339 aa  278  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  47.16 
 
 		 350 aa  278  1e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  49.54 
 
 		 349 aa  278  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  46.59 
 
 		 350 aa  276  5e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  45.64 
 
 		 339 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  46.29 
 
 		 352 aa  257  3e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  43.2 
 
 		 343 aa  256  6e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3812  putative F420-dependent oxidoreductase  43.6 
 
 		 339 aa  254  1.0000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  43.77 
 
 		 343 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1539  luciferase family protein  44.24 
 
 		 343 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  47.41 
 
 		 351 aa  250  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5015  luciferase family protein  44.11 
 
 		 343 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4633  luciferase-like protein  44.11 
 
 		 343 aa  249  5e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4721  luciferase family protein  44.11 
 
 		 343 aa  249  5e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  44.24 
 
 		 347 aa  249  6e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  43.69 
 
 		 359 aa  247  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  44.07 
 
 		 372 aa  246  6e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2504  putative F420-dependent oxidoreductase  41.27 
 
 		 344 aa  243  3e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2731  luciferase family protein  42.73 
 
 		 352 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  46.55 
 
 		 346 aa  243  5e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  44.01 
 
 		 361 aa  241  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1386  putative F420-dependent oxidoreductase  45.02 
 
 		 361 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2599  luciferase family protein  46.39 
 
 		 348 aa  239  4e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2798  luciferase family protein  45.48 
 
 		 341 aa  238  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000196172 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  44.88 
 
 		 350 aa  233  5e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0950  Luciferase-like monooxygenase  40.71 
 
 		 372 aa  229  8e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3963  putative F420-dependent oxidoreductase  39.88 
 
 		 345 aa  226  5.0000000000000005e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  42 
 
 		 346 aa  221  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0981332 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  38.01 
 
 		 336 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  35.96 
 
 		 333 aa  157  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6491  luciferase family protein  34.13 
 
 		 336 aa  152  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.75 
 
 		 334 aa  137  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.99 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0541  Luciferase-like, subgroup  31.63 
 
 		 341 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.764904  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.25 
 
 		 327 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  30.65 
 
 		 326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1978  luciferase-like protein  28.66 
 
 		 357 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  29.81 
 
 		 327 aa  114  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  36.32 
 
 		 346 aa  112  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  23.92 
 
 		 321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  29.91 
 
 		 335 aa  103  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  28.03 
 
 		 360 aa  99  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  28.8 
 
 		 327 aa  96.3  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4065  luciferase family protein  29.28 
 
 		 344 aa  95.1  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6623  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.18 
 
 		 333 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4583  luciferase family protein  27.74 
 
 		 349 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  25.61 
 
 		 318 aa  90.1  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0319  luciferase family protein  26.19 
 
 		 349 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514626  normal  0.781231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.1 
 
 		 322 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  28.72 
 
 		 340 aa  87  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  28.72 
 
 		 340 aa  87  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.72 
 
 		 340 aa  87  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4588  luciferase family protein  27.36 
 
 		 349 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2715  Luciferase-like monooxygenase  27.71 
 
 		 301 aa  86.7  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2690  luciferase family protein  29.58 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  26.95 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4973  luciferase family protein  28.53 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2345  luciferase family protein  29.02 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.430269 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1395  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25 
 
 		 326 aa  77.4  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3573  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.12 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6142  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.65 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2761  luciferase-like  25.83 
 
 		 353 aa  76.3  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3824  luciferase-like protein  26.18 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0429165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3898  luciferase family protein  26.18 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3810  luciferase family protein  26.18 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0990904  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.25 
 
 		 318 aa  75.9  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0507  Luciferase-like monooxygenase  28.51 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2389  luciferase family protein  26.39 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  33.52 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1582  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.84 
 
 		 349 aa  72  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4020  Luciferase-like monooxygenase  29.53 
 
 		 283 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169591  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0261  luciferase family protein  26.51 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110692 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4259  luciferase family protein  26.19 
 
 		 318 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0410  luciferase family protein  25.15 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2584  Luciferase-like monooxygenase  28.35 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000604781  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1630  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.84 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  27 
 
 		 327 aa  69.3  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1109  luciferase family protein  23.67 
 
 		 368 aa  69.3  0.00000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1071  hypothetical protein  27.61 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>