More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6491 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6491  luciferase family protein  100 
 
 
336 aa  654    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  44.16 
 
 
349 aa  235  8e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  44.25 
 
 
350 aa  232  6e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  43.79 
 
 
349 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  43.39 
 
 
350 aa  228  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  45.32 
 
 
351 aa  218  7.999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  43.15 
 
 
350 aa  206  5e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  42.01 
 
 
346 aa  179  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0981332 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  36.76 
 
 
344 aa  170  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  34.11 
 
 
343 aa  165  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3963  putative F420-dependent oxidoreductase  34.48 
 
 
345 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  38.26 
 
 
352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1995  putative F420-dependent oxidoreductase  37.08 
 
 
346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  38.41 
 
 
361 aa  164  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2599  luciferase family protein  36.76 
 
 
348 aa  161  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288347  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4515  putative F420-dependent oxidoreductase  34.43 
 
 
346 aa  160  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2798  luciferase family protein  36.69 
 
 
341 aa  157  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000196172 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  31.88 
 
 
348 aa  157  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  36.71 
 
 
372 aa  156  5.0000000000000005e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  32.44 
 
 
347 aa  156  6e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  34.1 
 
 
345 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  35.33 
 
 
349 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  35.33 
 
 
349 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  35.16 
 
 
346 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  32.32 
 
 
343 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3812  putative F420-dependent oxidoreductase  35.86 
 
 
339 aa  151  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  35.33 
 
 
349 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 
339 aa  150  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1539  luciferase family protein  32.62 
 
 
343 aa  149  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  32.17 
 
 
344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  34.15 
 
 
339 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2504  putative F420-dependent oxidoreductase  30.06 
 
 
344 aa  147  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5015  luciferase family protein  31.5 
 
 
343 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4633  luciferase-like protein  31.5 
 
 
343 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  34.16 
 
 
359 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4721  luciferase family protein  31.5 
 
 
343 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265583  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2391  luciferase-like  34.38 
 
 
351 aa  146  6e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.14 
 
 
346 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0860  Luciferase-like monooxygenase  34.69 
 
 
342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4576  putative oxidoreductase  34.85 
 
 
355 aa  139  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.248726  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  35.76 
 
 
346 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  34.48 
 
 
336 aa  137  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  33.12 
 
 
346 aa  136  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2731  luciferase family protein  30.97 
 
 
352 aa  135  7.000000000000001e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3612  luciferase family protein  31.5 
 
 
342 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1386  putative F420-dependent oxidoreductase  34.42 
 
 
361 aa  134  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.08 
 
 
333 aa  125  9e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.35 
 
 
332 aa  121  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0950  Luciferase-like monooxygenase  32.29 
 
 
372 aa  122  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1057  putative F420-dependent oxidoreductase  30.56 
 
 
354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1519  luciferase-like protein  31.69 
 
 
349 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1542  luciferase family protein  31.69 
 
 
349 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240997  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  34.12 
 
 
335 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  28.78 
 
 
345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  31.17 
 
 
326 aa  106  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.81 
 
 
327 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  29.47 
 
 
327 aa  100  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.84 
 
 
318 aa  98.6  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4065  luciferase family protein  33.01 
 
 
344 aa  97.8  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.9 
 
 
334 aa  95.9  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4973  luciferase family protein  33.33 
 
 
360 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  32.45 
 
 
346 aa  94.4  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  29.32 
 
 
318 aa  92.8  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  32.87 
 
 
327 aa  92.8  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  23.1 
 
 
321 aa  90.9  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  29.61 
 
 
360 aa  90.9  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0541  Luciferase-like, subgroup  31.06 
 
 
341 aa  90.1  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.764904  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2761  luciferase-like  31.19 
 
 
353 aa  89.4  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.07 
 
 
322 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1978  luciferase-like protein  29.08 
 
 
357 aa  87  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  30.35 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6623  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.6 
 
 
333 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3309  luciferase family protein  30 
 
 
318 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.14 
 
 
328 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3287  Luciferase-like, subgroup  30.71 
 
 
321 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118077  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.68 
 
 
320 aa  75.9  0.0000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.58 
 
 
328 aa  75.5  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0261  luciferase family protein  31.34 
 
 
309 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110692 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0410  luciferase family protein  30.32 
 
 
306 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1412  luciferase family protein  28.53 
 
 
318 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3824  luciferase-like protein  31.25 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0429165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3898  luciferase family protein  31.25 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3810  luciferase family protein  31.25 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0990904  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0749  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.68 
 
 
323 aa  72  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1619  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25 
 
 
320 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2916  luciferase family protein  31.6 
 
 
330 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2453  luciferase family protein  30.59 
 
 
317 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0341  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.61 
 
 
326 aa  70.1  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.256412 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4198  luciferase family protein  29.91 
 
 
317 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66157  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1055  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.01 
 
 
320 aa  69.7  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.411528  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0892  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.01 
 
 
320 aa  69.7  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4259  luciferase family protein  30 
 
 
318 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2389  luciferase family protein  30.29 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408058  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  28.86 
 
 
340 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  28.86 
 
 
340 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.86 
 
 
340 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  28.37 
 
 
305 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1395  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.72 
 
 
326 aa  66.6  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  34.48 
 
 
299 aa  66.6  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4500  hypothetical protein  29.39 
 
 
325 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139462  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>