More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1619 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1619  methylenetetrahydromethanopterin reductase  100 
 
 
320 aa  642    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0892  methylenetetrahydromethanopterin reductase  95.31 
 
 
320 aa  595  1e-169  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1055  methylenetetrahydromethanopterin reductase  95.31 
 
 
320 aa  595  1e-169  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.411528  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  87.81 
 
 
320 aa  577  1e-164  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0749  methylenetetrahydromethanopterin reductase  82.17 
 
 
323 aa  530  1e-149  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  58.15 
 
 
328 aa  375  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  60.62 
 
 
328 aa  373  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  56.47 
 
 
318 aa  365  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0528  methylenetetrahydromethanopterin reductase  46.81 
 
 
328 aa  287  2e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0557  methylenetetrahydromethanopterin reductase  46.04 
 
 
335 aa  281  8.000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0316712  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2257  methylenetetrahydromethanopterin reductase  45.29 
 
 
328 aa  281  1e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0327  methylenetetrahydromethanopterin reductase  45.59 
 
 
328 aa  280  2e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.585505 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0076  methylenetetrahydromethanopterin reductase  46.5 
 
 
327 aa  268  1e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0321839 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1395  methylenetetrahydromethanopterin reductase  39.25 
 
 
326 aa  235  9e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1582  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  39.05 
 
 
349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0341  methylenetetrahydromethanopterin reductase  38.32 
 
 
326 aa  228  8e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.256412 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3573  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  38.29 
 
 
337 aa  225  9e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1680  methylenetetrahydromethanopterin reductase  39.2 
 
 
327 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1677  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.7 
 
 
325 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1433  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.07 
 
 
363 aa  130  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32144  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1120  luciferase family protein  28.78 
 
 
333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24190  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.88 
 
 
343 aa  120  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0724  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.31 
 
 
336 aa  119  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00584154 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4268  luciferase family protein  27.99 
 
 
383 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.673509  normal  0.529068 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0223  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.34 
 
 
341 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4043  methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.19 
 
 
333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0263182  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.92 
 
 
336 aa  110  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3948  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.44 
 
 
345 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0406632  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.1 
 
 
333 aa  109  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  28.33 
 
 
335 aa  108  9.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1630  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.73 
 
 
333 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5730  luciferase family protein  27.88 
 
 
353 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4431  coenzyme F420-dependent N(5),N(10)-methenyltetrahydromethanopterin  29.02 
 
 
321 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12965  oxidoreductase  28.19 
 
 
381 aa  101  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2577  Luciferase-like monooxygenase  27.55 
 
 
344 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0157  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.39 
 
 
334 aa  99  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.82 
 
 
339 aa  96.7  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2098  Luciferase-like monooxygenase  25.79 
 
 
330 aa  95.9  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0305503  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1687  Luciferase-like monooxygenase  25.16 
 
 
336 aa  95.5  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193576  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  31.08 
 
 
337 aa  95.5  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  27.47 
 
 
340 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  27.47 
 
 
340 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.47 
 
 
340 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  28.39 
 
 
350 aa  95.1  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.32 
 
 
361 aa  94  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0860  Luciferase-like monooxygenase  26.73 
 
 
342 aa  93.6  4e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  26.01 
 
 
327 aa  93.2  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4162  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.06 
 
 
333 aa  92.4  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.945898  normal  0.398456 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4257  Luciferase-like monooxygenase  27.41 
 
 
333 aa  92  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2020  putative oxidoreductase  23.58 
 
 
343 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4112  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.21 
 
 
344 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.273719  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5169  Luciferase-like, subgroup  27.04 
 
 
336 aa  90.5  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.840364  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.3 
 
 
334 aa  90.5  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  27.3 
 
 
326 aa  89.4  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4588  luciferase family protein  25.81 
 
 
349 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6623  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.79 
 
 
333 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  26.01 
 
 
321 aa  89  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.78 
 
 
327 aa  88.2  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4065  luciferase family protein  26.74 
 
 
344 aa  87  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2862  Luciferase-like monooxygenase  29.61 
 
 
289 aa  87  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.628513 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00690  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  23.84 
 
 
331 aa  87  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.889784  normal  0.0731127 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3380  luciferase family protein  25.07 
 
 
389 aa  87  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0856  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.04 
 
 
356 aa  86.3  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  27.47 
 
 
360 aa  85.9  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1842  putative oxidoreductase  24.01 
 
 
353 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0319  luciferase family protein  25.48 
 
 
349 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514626  normal  0.781231 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1776  putative oxidoreductase  24.01 
 
 
353 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1795  putative oxidoreductase  24.01 
 
 
348 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4583  luciferase family protein  25.48 
 
 
349 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1132  Luciferase-like monooxygenase  28.21 
 
 
332 aa  85.5  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0218137 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4326  putative oxidoreductase  21.67 
 
 
337 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  24.69 
 
 
344 aa  82  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4412  luciferase-like  26.1 
 
 
317 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398031  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3963  putative F420-dependent oxidoreductase  25.07 
 
 
345 aa  81.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0507  Luciferase-like monooxygenase  24.76 
 
 
301 aa  81.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1861  Luciferase-like monooxygenase  26.01 
 
 
335 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  31.25 
 
 
753 aa  80.5  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  29.63 
 
 
350 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4111  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  33.33 
 
 
342 aa  80.1  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.99 
 
 
332 aa  79.7  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  24.55 
 
 
352 aa  79  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5511  luciferase family protein  30 
 
 
380 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5617  luciferase-like protein  30.38 
 
 
323 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461594  normal  0.0935751 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  29.17 
 
 
350 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3981  luciferase family protein  28.09 
 
 
329 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0510411 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1109  luciferase family protein  31.53 
 
 
368 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0698  luciferase family protein  25.15 
 
 
336 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281916  normal  0.0356984 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.48 
 
 
346 aa  77  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3824  luciferase-like protein  25.34 
 
 
318 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0429165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3898  luciferase family protein  25.34 
 
 
318 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3810  luciferase family protein  25.34 
 
 
318 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0990904  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0326  Luciferase-like monooxygenase  23.01 
 
 
325 aa  76.3  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0217  luciferase-like protein  26.11 
 
 
334 aa  76.6  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  24.61 
 
 
349 aa  76.3  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.62 
 
 
339 aa  76.3  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  25.79 
 
 
345 aa  75.9  0.0000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  24.48 
 
 
348 aa  75.9  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  31.67 
 
 
754 aa  75.9  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1840  luciferase family protein  26.32 
 
 
348 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.175999  normal  0.960587 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0358  luciferase family protein  24.31 
 
 
348 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>