More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0157 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0157  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  100 
 
 		 334 aa  645    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0724  methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.59 
 
 		 336 aa  168  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584154 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.25 
 
 		 318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0528  methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.65 
 
 		 328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0327  methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.62 
 
 		 328 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.585505 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1582  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.95 
 
 		 349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0749  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.39 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0557  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.85 
 
 		 335 aa  108  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0316712  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.13 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2257  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.41 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.06 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3573  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.33 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0341  methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.08 
 
 		 326 aa  99.8  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.256412 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1395  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.23 
 
 		 326 aa  99.8  6e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1680  methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.28 
 
 		 327 aa  97.1  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1619  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.39 
 
 		 320 aa  96.7  5e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.95 
 
 		 328 aa  95.9  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0892  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.39 
 
 		 320 aa  90.9  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1055  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.39 
 
 		 320 aa  90.9  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.411528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0076  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.47 
 
 		 327 aa  89.7  6e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0321839 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00690  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.99 
 
 		 331 aa  86.7  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.889784  normal  0.0731127 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4112  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.91 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.273719  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.29 
 
 		 336 aa  83.6  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.91 
 
 		 361 aa  82  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1630  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.95 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4268  luciferase family protein  26.59 
 
 		 383 aa  77  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.673509  normal  0.529068 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0223  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.43 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0541  Luciferase-like, subgroup  27.33 
 
 		 341 aa  75.9  0.0000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.764904  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.08 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  28.89 
 
 		 335 aa  73.2  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0856  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.13 
 
 		 356 aa  72  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2778  Luciferase-like monooxygenase  28.71 
 
 		 317 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2577  Luciferase-like monooxygenase  27.64 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  26.55 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.12 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  27.08 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  23.37 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1433  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.14 
 
 		 363 aa  69.7  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32144  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4412  luciferase-like  29.63 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4431  coenzyme F420-dependent N(5),N(10)-methenyltetrahydromethanopterin  27.53 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5730  luciferase family protein  25.35 
 
 		 353 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24190  methylenetetrahydromethanopterin reductase  22.22 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1978  luciferase-like protein  25.7 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1120  luciferase family protein  25.44 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3910  putative F420-dependent oxidoreductase  30.71 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.05 
 
 		 339 aa  65.1  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  26.13 
 
 		 337 aa  65.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  27.24 
 
 		 343 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5169  Luciferase-like, subgroup  27.47 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.840364  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  26.47 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0173  putative F420-dependent oxidoreductase  25.2 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.182486  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  29.19 
 
 		 344 aa  63.2  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2584  Luciferase-like monooxygenase  29.45 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000604781  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  26.45 
 
 		 347 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4138  luciferase-like protein  23.65 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3381  luciferase family protein  37.06 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2334  Luciferase-like monooxygenase  33.51 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1677  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.37 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0326  Luciferase-like monooxygenase  26.09 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.02 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0941  luciferase-like protein  26.33 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4043  methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.34 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0263182  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  23.92 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  31.85 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  31.85 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  36.19 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  30.57 
 
 		 350 aa  59.3  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0213  putative F420-dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 336 aa  59.3  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  35.24 
 
 		 346 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0319  luciferase family protein  27.13 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514626  normal  0.781231 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0757  luciferase family protein  32.39 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  0.787392 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3725  luciferase family protein  29.33 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.290268  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5015  luciferase family protein  28.42 
 
 		 343 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  33.04 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.36 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5617  luciferase-like protein  30.15 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461594  normal  0.0935751 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  35.24 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3359  Luciferase-like, subgroup  31.25 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0118033 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4500  hypothetical protein  29.18 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2098  Luciferase-like monooxygenase  27.3 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0305503  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  27.48 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  27.24 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  27.48 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.48 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4633  luciferase-like protein  27.68 
 
 		 343 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4721  luciferase family protein  27.68 
 
 		 343 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  27.24 
 
 		 327 aa  57  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1539  luciferase family protein  26.92 
 
 		 343 aa  57  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4583  luciferase family protein  26.36 
 
 		 349 aa  57  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  25 
 
 		 358 aa  57  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  25.36 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  27.42 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  31.11 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  26.32 
 
 		 350 aa  56.2  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  29.65 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3963  putative F420-dependent oxidoreductase  28.27 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4047  luciferase family protein  31.82 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal  0.465581 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  24.7 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3836  luciferase-like protein  30.82 
 
 		 364 aa  55.8  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1132  Luciferase-like monooxygenase  24.92 
 
 		 332 aa  55.8  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0218137 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>