242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1120 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1120  luciferase family protein  100 
 
 		 333 aa  694    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4043  methylenetetrahydromethanopterin reductase  71.47 
 
 		 333 aa  523  1e-147  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0263182  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4257  Luciferase-like monooxygenase  71.47 
 
 		 333 aa  514  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0223  methylenetetrahydromethanopterin reductase  47.45 
 
 		 341 aa  309  4e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1433  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  43.79 
 
 		 363 aa  305  9.000000000000001e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32144  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24190  methylenetetrahydromethanopterin reductase  43.79 
 
 		 343 aa  296  3e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4268  luciferase family protein  43.86 
 
 		 383 aa  295  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.673509  normal  0.529068 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5730  luciferase family protein  41.74 
 
 		 353 aa  290  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2098  Luciferase-like monooxygenase  45.67 
 
 		 330 aa  287  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0305503  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5169  Luciferase-like, subgroup  45.89 
 
 		 336 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.840364  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2577  Luciferase-like monooxygenase  45.43 
 
 		 344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.95 
 
 		 320 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0892  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.36 
 
 		 320 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1055  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.36 
 
 		 320 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.411528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0749  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.86 
 
 		 323 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1619  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.27 
 
 		 320 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.3 
 
 		 328 aa  112  9e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7143  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.35 
 
 		 345 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0956909 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.92 
 
 		 328 aa  102  9e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.85 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0528  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.89 
 
 		 328 aa  99  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0327  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.08 
 
 		 328 aa  88.6  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.585505 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0557  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.7 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0316712  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1395  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.26 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2257  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.92 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0076  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.69 
 
 		 327 aa  82  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0321839 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3573  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.09 
 
 		 337 aa  79.7  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4162  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.945898  normal  0.398456 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4778  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.94 
 
 		 335 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1582  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.25 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1793  luciferase-like protein  30.16 
 
 		 347 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2584  Luciferase-like monooxygenase  29.17 
 
 		 359 aa  72.8  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000604781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1840  luciferase family protein  30.16 
 
 		 348 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.175999  normal  0.960587 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1774  luciferase-like protein  29.63 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0724  methylenetetrahydromethanopterin reductase  22.22 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584154 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2862  Luciferase-like monooxygenase  30.35 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.628513 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4431  coenzyme F420-dependent N(5),N(10)-methenyltetrahydromethanopterin  24.16 
 
 		 321 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1677  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.26 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  23.14 
 
 		 350 aa  67  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4412  luciferase-like  26.79 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2018  luciferase family protein  29.1 
 
 		 347 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.784882 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4328  luciferase family protein  29.1 
 
 		 348 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  22.51 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4525  luciferase-like protein  25.95 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3836  luciferase-like protein  27.18 
 
 		 364 aa  63.2  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2003  Luciferase-like, subgroup  29.73 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.749975 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0341  methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.79 
 
 		 326 aa  62.8  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.256412 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4112  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.34 
 
 		 344 aa  62.8  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.273719  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1680  methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.02 
 
 		 327 aa  62.4  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06300  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  25.51 
 
 		 299 aa  62  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2731  luciferase family protein  23.42 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0157  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.44 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4198  Luciferase-like, subgroup  27.64 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  25.67 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3963  putative F420-dependent oxidoreductase  23.42 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10133  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd2  29.55 
 
 		 360 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1563  luciferase family protein  32.09 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3410  putative F420-dependent oxidoreductase  29.17 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.212924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1132  Luciferase-like monooxygenase  29.31 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0218137 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  22.55 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2621  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.57 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.3 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1522  Luciferase-like monooxygenase  27.8 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0131104  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  24.68 
 
 		 335 aa  57  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4047  luciferase family protein  28.7 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal  0.465581 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  27.91 
 
 		 764 aa  57  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4369  F420-dependent oxidoreductase  27.54 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.257639  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3284  Luciferase-like monooxygenase  27.27 
 
 		 295 aa  57  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000209347  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  21.56 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  22.87 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  23.03 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00690  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.77 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.889784  normal  0.0731127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2439  Luciferase-like monooxygenase  32.35 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000186799  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  25.78 
 
 		 299 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1539  luciferase family protein  23.18 
 
 		 343 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  23.19 
 
 		 351 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0217  luciferase-like protein  24.78 
 
 		 334 aa  55.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  27.35 
 
 		 343 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0120  Luciferase-like monooxygenase  31.46 
 
 		 310 aa  54.3  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  27.24 
 
 		 326 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2778  Luciferase-like monooxygenase  28.84 
 
 		 317 aa  53.9  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1861  Luciferase-like monooxygenase  23.96 
 
 		 335 aa  53.9  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02130  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.1 
 
 		 329 aa  53.9  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9025  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  26.97 
 
 		 301 aa  53.9  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5617  luciferase-like protein  28.04 
 
 		 323 aa  53.5  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461594  normal  0.0935751 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  20.35 
 
 		 349 aa  53.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3359  Luciferase-like, subgroup  30.3 
 
 		 318 aa  52.8  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0118033 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  24.29 
 
 		 349 aa  52.8  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4174  putative N5, N10-methylenetetrahydromethanopterin reductase-related protein  25.27 
 
 		 331 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.754635  normal  0.728118 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1687  Luciferase-like monooxygenase  23.32 
 
 		 336 aa  52.8  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0669  Luciferase-like monooxygenase  23.58 
 
 		 342 aa  52.8  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.113099  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3153  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.91 
 
 		 303 aa  52.8  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0290174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3381  luciferase family protein  27.98 
 
 		 337 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  22.51 
 
 		 354 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  23.9 
 
 		 343 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4111  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  22.38 
 
 		 342 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  22.16 
 
 		 363 aa  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  24.2 
 
 		 327 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12965  oxidoreductase  29.41 
 
 		 381 aa  52  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  27.55 
 
 		 346 aa  51.2  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0981332 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>